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Massive Digital sequencing by binary DNA

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Inicio de una nueva era en la secuenciación del ADN

El principal objetivo de la iniciativa «Massive digital sequencing by binary DNA» (Digital Sequencing) consiste en lograr que la secuenciación de ADN sea un proceso habitual en la práctica clínica. Los socios tratan de desarrollar una nueva técnica de secuenciación de ADN «digital» que aceleraría el proceso a un coste mucho menor.

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Tras la realización del proyecto Genoma Humano, donde se secuenció el genoma humano completo, los avances técnicos en la materia lograron abaratar considerablemente los costes y el tiempo del proceso de secuenciación. Sin embargo, continúa siendo una técnica extremadamente cara debido a los reactivos y el equipo necesarios. El objetivo principal del proyecto Digital Sequencing, financiado con fondos europeos, es crear una plataforma informática capaz de realizar una secuenciación de alto rendimiento. La idea se basa en la tecnología de los discos ópticos, utilizada en DVD y ordenadores, para generar el primer «secuenciador digital». Se ha desarrollado un nuevo método de preparación de muestra que transforma el ADN en moléculas sintéticas ampliadas con características binarias (0,1) denominadas «etiquetas binarias». A continuación, se formulan en fragmentos de ADN virtuales largos para que se ajusten al tamaño de bit requerido para su lectura en un lector de disco óptico. El consorcio, mediante el desarrollo de una técnica de nanoimpresión, la transferencia inducida por láser (laser induced transfer, LIT), logró transferir el ADN en nanoporos. A continuación, se utilizó un prototipo de lector creado en el laboratorio para obtener el formato binario de las secuencias de ADN. A pesar de que el análisis de ADN se utiliza principalmente en la investigación de medicamentos y diagnóstico de enfermedades, se espera que, una vez reducido el coste de estos procesos, se convierta en una técnica de uso general. Los socios del proyecto consideran que la introducción del «secuenciador digital» ampliará el uso de la secuenciación de ADN a otros sectores como el sanitario, de la agricultura y de la medicina forense.

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