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Massive Digital sequencing by binary DNA

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Una nuova era per il sequenziamento del DNA

Fare del sequenziamento del DNA una prassi clinica quotidiana e di routine è l'obiettivo principale che si propone l'iniziativa Digital Sequencing. I partner del progetto stanno lavorando per sviluppare una nuova tecnologia "digitale" di sequenziamento del DNA che permetta di accelerare il processo e ridurre i costi.

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Al termine del progetto che ha portato al sequenziamento dell'intero genoma umano, i progressi tecnici hanno ridotto notevolmente i costi e i tempi necessari per il sequenziamento del DNA, che comunque continua ad essere una tecnica estremamente costosa a causa della strumentazione su cui si basa. Lo scopo principale del progetto Digital Sequencing ("Massive digital sequencing by binary DNA"), finanziato dall'UE, consiste nello sviluppo di una piattaforma tecnologica che permetta un sequenziamento ad alto rendimento basato sulla tecnologia dei dischi ottici impiegata per i DVD e i PC, in modo da ottenere il primo "sequenziatore digitale". Il consorzio ha sviluppato una nuova tecnologia per la preparazione dei campioni, che converte il DNA in molecole sintetiche ingrandite con funzionalità digitali (0, 1) chiamate "tag binari", che vengono poi formulate in lunghe letture di DNA virtuali corrispondenti alle dimensioni in bit necessarie per consentirne la lettura su un lettore di dischi ottici. Grazie allo sviluppo di una tecnica basata sulla nanostampa, il trasferimento indotto da laser (TIL), il consorzio è riuscito a trasferire il DNA su spot di dimensioni nanometriche, utilizzando poi un prototipo iniziale di lettore ad uso del laboratorio per ottenere il formato binario delle sequenze di DNA. L'analisi del DNA viene impiegata principalmente nella ricerca e nello sviluppo di farmaci e metodi diagnostici, ma una volta che i costi scenderanno la situazione è probabilmente destinata a cambiare. I partner del progetto ritengono che l'implementazione del "sequenziatore digitale" consentirà di ampliare le applicazioni del sequenziamento del DNA a settori quali l'assistenza sanitaria, l'agricoltura e la medicina legale.

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