Szkolenie EMBO z zakresu profilowania mikroRNA, Heidelberg, Niemcy

Europejska Organizacja Biologii Molekularnej (EMBO) organizuje szkolenie pt. "Profilowanie mikroRNA: od hybrydyzacji in situ do sekwencjonowania nowej generacji" w dniach od 18 do 24 kwietnia 2009 r. w Heidelbergu, Niemcy.

Szkolenie rozpocznie się od teoretycznego wprowadzenia do profilowania mikroRNA. Następnie przewidziano połączenie praktycznych zajęć laboratoryjnych i bioinformatycznych z wykładami i konsultacjami obejmującymi następujące tematy:
- ocena jakości i kwantyfikacja całkowitego RNA;
- planowanie doświadczeń w zakresie pełnego profilowania mikroRNA techniką microarray i hybrydyzacji in situ;
- planowanie pełnego eksperymentu ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy w czasie rzeczywistym (qPCR) w różnych systemach, odwrócona transkrypcja i etapy qPCR: synteza nici DNA, po której następuje amplifikacja mikroRNA;
- planowanie pełnego oznaczania profilowania mikroRNA na podstawie łańcucha koralików;
- analiza danych za pomocą różnych algorytmów, normalizacja podejść;
- korelacja danych ekspresji mikroRNA pozyskanych różnymi metodami;
- rozwiązywanie problemów na poszczególnych etapach;
- podejścia do profilowania mikroRNA (sekwencjonowanie nowej generacji, łańcuch koralików, technika microarray, qPCR, hybrydyzacja northern, hybrydyzacja in situ);
- przygotowywanie próbek, projektowanie/planowanie eksperymentów, opcje wyposażenia/oprzyrządowania i kontrola jakości całkowitego RNA;
- projektowanie oznaczania qPCR w celu określenia ekspresji mikroRNA;
- projektowanie eksperymentu mikroRNA, wykorzystującego technikę microarray;
- analiza, normalizacja i interpretacja danych;
- korelacja profilowania transkryptomu z danymi profilowania mikroRNA;
- korelacja między różnymi podejściami do profilowania mikroRNA;
- przewidywanie docelowych mikroRNA i ich potwierdzenie na drodze doświadczalnej.Więcej informacji:
http://www-db.embl.de/jss/EmblGroupsOrg/conf_117#registration(odnośnik otworzy się w nowym oknie)