Paleovirology, the evolutionary dynamics of viral cross-species transmissions, and the consequences of virus-host gene exchange

Projektinformationen

PALVIREVOL

ID Finanzhilfevereinbarung: 101001623

DOI

10.3030/101001623

EK-Unterschriftsdatum 30 März 2021

Startdatum 1 Oktober 2021

Enddatum 31 März 2028

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 999 805,00

EU-Beitrag

€ 1 999 805,00

Koordiniert durch

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
United Kingdom

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (10)

Ecological and evolutionary dynamics of cell-virus-virophage systems

Autoren: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Veröffentlicht in: PLoS Computational Biology, 2024, ISSN 1553-734X
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010925

Four principles to establish a universal virus taxonomy

Autoren: Peter Simmonds, Evelien M. Adriaenssens, F. Murilo Zerbini, Nicola G. A. Abrescia, Pakorn Aiewsakun, Poliane Alfenas-Zerbini, Yiming Bao, Jakub Barylski, Christian Drosten, Siobain Duffy, W. Paul Duprex, Bas E. Dutilh, Santiago F. Elena, Maria Laura García, Sandra Junglen, Aris Katzourakis, Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Amy J. Lambert, Elliot J. Lefkowitz, Małgorzata Łobocka, C
Veröffentlicht in: PLoS Biology, Ausgabe 21(2), 2023, Seite(n) e3001922, ISSN 1544-9173
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001922

Investigating the evolutionary origins of the first three SARS-CoV-2 variants of concern

Autoren: Mahan Ghafari, Qihan Liu, Arushi Dhillon, Aris Katzourakis, Daniel B. Weissman
Veröffentlicht in: Frontiers in virology, 2022, ISSN 2673-818X
Herausgeber: Fronteirs Media
DOI: 10.3389/fviro.2022.942555

Evolutionary Analysis of Placental Orthologues Reveals Two Ancient DNA Virus Integrations

Autoren: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Veröffentlicht in: Journal of Virology, 2022, ISSN 1098-5514
Herausgeber: American Society of Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.00933-22

Revisiting the origins of the Sobemovirus genus: A case for ancient origins of plant viruses

Autoren: Mahan Ghafari , Merike Sõmera, Cecilia Sarmiento, Annette Niehl, Eugénie Hébrard, Theocharis Tsoleridis, Jonathan Ball, Benoît Moury, Philippe Lemey, Aris Katzourakis, Denis Fargette
Veröffentlicht in: PLoS Pathogens, 2023, ISSN 1553-7366
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.ppat.1011911

Discovery of novel papillomaviruses in the critically endangered Malayan and Chinese pangolins

Autoren: Jose Gabriel Nino Barreat, Anselmo Jiro Kamada, Charles Reuben de Souza, Aris Katzourakis
Veröffentlicht in: Biology Letters, Ausgabe 19, 2023, Seite(n) 20220464, ISSN 1744-957X
Herausgeber: Royal Society
DOI: 10.1098/rsbl.2022.0464

Purifying selection determines the short-term time dependency of evolutionary rates in SARS-CoV-2 and pH1N1 influenza

Autoren: Mahan Ghafari, Louis du Plessis, Jayna Raghwani, Samir Bhatt, Bo Xu, Oliver G Pybus, Aris Katzourakis
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, Ausgabe Ausgabe 2, 2023, Seite(n) msac009, ISSN 1537-1719
Herausgeber: Oxford University Press on behalf of the Society for Molecular Biology and Evolution
DOI: 10.1093/molbev/msac009

The evolution of SARS-CoV-2

Autoren: Peter V. Markov, Mahan Ghafari, Martin Beer, Katrina Lythgoe, Peter Simmonds, Nikolaos I. Stilianakis & Aris Katzourakis
Veröffentlicht in: Nature Reviews Microbiology, 2023, ISSN 1740-1526
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-023-00878-2

Deep mining reveals the diversity of endogenous viral elements in vertebrate genomes

Autoren: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 9, 2024, Seite(n) 3013–3024, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41564-024-01825-4

A framework for reconstructing SARS-CoV-2 transmission dynamics using excess mortality data

Autoren: Mahan Ghafari, Oliver J. Watson, Ariel Karlinsky, Luca Ferretti, Aris Katzourakis
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, 2022, Seite(n) Article Number: 3015, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30711-y

Other (1)

Deep-mining of vertebrate genomes reveals an unexpected diversity of endogenous viral elements

Autoren: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2023
Herausgeber: biorxiv
DOI: 10.1101/2023.10.26.564176