Paleovirology, the evolutionary dynamics of viral cross-species transmissions, and the consequences of virus-host gene exchange

Informacje na temat projektu

PALVIREVOL

Identyfikator umowy o grant: 101001623

DOI

10.3030/101001623

Data podpisania przez KE 30 Marca 2021

Data rozpoczęcia 1 Października 2021

Data zakończenia 31 Marca 2028

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 999 805,00

Wkład UE

€ 1 999 805,00

Koordynowany przez

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
United Kingdom

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (10)

Ecological and evolutionary dynamics of cell-virus-virophage systems

Autorzy: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Opublikowane w: PLoS Computational Biology, 2024, ISSN 1553-734X
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010925

Four principles to establish a universal virus taxonomy

Autorzy: Peter Simmonds, Evelien M. Adriaenssens, F. Murilo Zerbini, Nicola G. A. Abrescia, Pakorn Aiewsakun, Poliane Alfenas-Zerbini, Yiming Bao, Jakub Barylski, Christian Drosten, Siobain Duffy, W. Paul Duprex, Bas E. Dutilh, Santiago F. Elena, Maria Laura García, Sandra Junglen, Aris Katzourakis, Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Amy J. Lambert, Elliot J. Lefkowitz, Małgorzata Łobocka, C
Opublikowane w: PLoS Biology, Numer 21(2), 2023, Strona(/y) e3001922, ISSN 1544-9173
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001922

Investigating the evolutionary origins of the first three SARS-CoV-2 variants of concern

Autorzy: Mahan Ghafari, Qihan Liu, Arushi Dhillon, Aris Katzourakis, Daniel B. Weissman
Opublikowane w: Frontiers in virology, 2022, ISSN 2673-818X
Wydawca: Fronteirs Media
DOI: 10.3389/fviro.2022.942555

Evolutionary Analysis of Placental Orthologues Reveals Two Ancient DNA Virus Integrations

Autorzy: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Opublikowane w: Journal of Virology, 2022, ISSN 1098-5514
Wydawca: American Society of Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.00933-22

Revisiting the origins of the Sobemovirus genus: A case for ancient origins of plant viruses

Autorzy: Mahan Ghafari , Merike Sõmera, Cecilia Sarmiento, Annette Niehl, Eugénie Hébrard, Theocharis Tsoleridis, Jonathan Ball, Benoît Moury, Philippe Lemey, Aris Katzourakis, Denis Fargette
Opublikowane w: PLoS Pathogens, 2023, ISSN 1553-7366
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.ppat.1011911

Discovery of novel papillomaviruses in the critically endangered Malayan and Chinese pangolins

Autorzy: Jose Gabriel Nino Barreat, Anselmo Jiro Kamada, Charles Reuben de Souza, Aris Katzourakis
Opublikowane w: Biology Letters, Numer 19, 2023, Strona(/y) 20220464, ISSN 1744-957X
Wydawca: Royal Society
DOI: 10.1098/rsbl.2022.0464

Purifying selection determines the short-term time dependency of evolutionary rates in SARS-CoV-2 and pH1N1 influenza

Autorzy: Mahan Ghafari, Louis du Plessis, Jayna Raghwani, Samir Bhatt, Bo Xu, Oliver G Pybus, Aris Katzourakis
Opublikowane w: Molecular Biology and Evolution, Numer Numer 2, 2023, Strona(/y) msac009, ISSN 1537-1719
Wydawca: Oxford University Press on behalf of the Society for Molecular Biology and Evolution
DOI: 10.1093/molbev/msac009

The evolution of SARS-CoV-2

Autorzy: Peter V. Markov, Mahan Ghafari, Martin Beer, Katrina Lythgoe, Peter Simmonds, Nikolaos I. Stilianakis & Aris Katzourakis
Opublikowane w: Nature Reviews Microbiology, 2023, ISSN 1740-1526
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-023-00878-2

Deep mining reveals the diversity of endogenous viral elements in vertebrate genomes

Autorzy: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Opublikowane w: Nature Microbiology, Numer 9, 2024, Strona(/y) 3013–3024, ISSN 2058-5276
Wydawca: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41564-024-01825-4

A framework for reconstructing SARS-CoV-2 transmission dynamics using excess mortality data

Autorzy: Mahan Ghafari, Oliver J. Watson, Ariel Karlinsky, Luca Ferretti, Aris Katzourakis
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 13, 2022, Strona(/y) Article Number: 3015, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30711-y

Other (1)

Deep-mining of vertebrate genomes reveals an unexpected diversity of endogenous viral elements

Autorzy: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Opublikowane w: bioRxiv, 2023
Wydawca: biorxiv
DOI: 10.1101/2023.10.26.564176