Paleovirology, the evolutionary dynamics of viral cross-species transmissions, and the consequences of virus-host gene exchange

Informazioni relative al progetto

PALVIREVOL

ID dell’accordo di sovvenzione: 101001623

DOI

10.3030/101001623

Data della firma CE 30 Marzo 2021

Data di avvio 1 Ottobre 2021

Data di completamento 31 Marzo 2028

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 999 805,00

Contributo UE

€ 1 999 805,00

Coordinato da

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
United Kingdom

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (10)

Ecological and evolutionary dynamics of cell-virus-virophage systems

Autori: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Pubblicato in: PLoS Computational Biology, 2024, ISSN 1553-734X
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010925

Four principles to establish a universal virus taxonomy

Autori: Peter Simmonds, Evelien M. Adriaenssens, F. Murilo Zerbini, Nicola G. A. Abrescia, Pakorn Aiewsakun, Poliane Alfenas-Zerbini, Yiming Bao, Jakub Barylski, Christian Drosten, Siobain Duffy, W. Paul Duprex, Bas E. Dutilh, Santiago F. Elena, Maria Laura García, Sandra Junglen, Aris Katzourakis, Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Amy J. Lambert, Elliot J. Lefkowitz, Małgorzata Łobocka, C
Pubblicato in: PLoS Biology, Numero 21(2), 2023, Pagina/e e3001922, ISSN 1544-9173
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001922

Investigating the evolutionary origins of the first three SARS-CoV-2 variants of concern

Autori: Mahan Ghafari, Qihan Liu, Arushi Dhillon, Aris Katzourakis, Daniel B. Weissman
Pubblicato in: Frontiers in virology, 2022, ISSN 2673-818X
Editore: Fronteirs Media
DOI: 10.3389/fviro.2022.942555

Evolutionary Analysis of Placental Orthologues Reveals Two Ancient DNA Virus Integrations

Autori: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Pubblicato in: Journal of Virology, 2022, ISSN 1098-5514
Editore: American Society of Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.00933-22

Revisiting the origins of the Sobemovirus genus: A case for ancient origins of plant viruses

Autori: Mahan Ghafari , Merike Sõmera, Cecilia Sarmiento, Annette Niehl, Eugénie Hébrard, Theocharis Tsoleridis, Jonathan Ball, Benoît Moury, Philippe Lemey, Aris Katzourakis, Denis Fargette
Pubblicato in: PLoS Pathogens, 2023, ISSN 1553-7366
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.ppat.1011911

Discovery of novel papillomaviruses in the critically endangered Malayan and Chinese pangolins

Autori: Jose Gabriel Nino Barreat, Anselmo Jiro Kamada, Charles Reuben de Souza, Aris Katzourakis
Pubblicato in: Biology Letters, Numero 19, 2023, Pagina/e 20220464, ISSN 1744-957X
Editore: Royal Society
DOI: 10.1098/rsbl.2022.0464

Purifying selection determines the short-term time dependency of evolutionary rates in SARS-CoV-2 and pH1N1 influenza

Autori: Mahan Ghafari, Louis du Plessis, Jayna Raghwani, Samir Bhatt, Bo Xu, Oliver G Pybus, Aris Katzourakis
Pubblicato in: Molecular Biology and Evolution, Numero Numero 2, 2023, Pagina/e msac009, ISSN 1537-1719
Editore: Oxford University Press on behalf of the Society for Molecular Biology and Evolution
DOI: 10.1093/molbev/msac009

The evolution of SARS-CoV-2

Autori: Peter V. Markov, Mahan Ghafari, Martin Beer, Katrina Lythgoe, Peter Simmonds, Nikolaos I. Stilianakis & Aris Katzourakis
Pubblicato in: Nature Reviews Microbiology, 2023, ISSN 1740-1526
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-023-00878-2

Deep mining reveals the diversity of endogenous viral elements in vertebrate genomes

Autori: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Pubblicato in: Nature Microbiology, Numero 9, 2024, Pagina/e 3013–3024, ISSN 2058-5276
Editore: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41564-024-01825-4

A framework for reconstructing SARS-CoV-2 transmission dynamics using excess mortality data

Autori: Mahan Ghafari, Oliver J. Watson, Ariel Karlinsky, Luca Ferretti, Aris Katzourakis
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 13, 2022, Pagina/e Article Number: 3015, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30711-y

Other (1)

Deep-mining of vertebrate genomes reveals an unexpected diversity of endogenous viral elements

Autori: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Pubblicato in: bioRxiv, 2023
Editore: biorxiv
DOI: 10.1101/2023.10.26.564176