Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
CORDIScovery podcast 50th episode CORDIScovery podcast 50th episode

Modulating the gut microbiome to enhance drug efficacy

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (36)
Phage display sequencing reveals that genetic, environmental, and intrinsic factors influence variation of human antibody epitope repertoire (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sergio Andreu-Sánchez, Arno R. Bourgonje, Thomas Vogl, Alexander Kurilshikov, Sigal Leviatan, Angel J. Ruiz-Moreno, Shixian Hu, Trishla Sinha, Arnau Vich Vila, Shelley Klompus, Iris N. Kalka, Karina de Leeuw, Suzanne Arends, Iris Jonkers, Sebo Withoff, Lifelines Cohort Study, Elisabeth Brouwer, Adina Weinberger, Cisca Wijmenga, Eran Segal, Rinse K. Weersma, Jingyuan Fu, Alexandra Zhernakova
Opublikowane w: Immunity, 2023, ISSN 1097-4180
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.immuni.2023.04.003

iPSC-derived organ-on-a-chip models for personalized human genetics and pharmacogenomics studies (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Victoria E.J.M. Palasantzas; Isabel Tamargo-Rubio; Kieu Le; Jelle Slager; Cisca Wijmenga; Iris H. Jonkers; Vinod Kumar; Jingyuan Fu; Sebo Withoff
Opublikowane w: Trends in Genetics, Numer 3, 2023, ISSN 1362-4555
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.tig.2023.01.002

Implications of blood type in personalised microbiome therapy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Yue Zhang, Ranko Gacesa, Jingyuan Fu
Opublikowane w: Clinical and Translational Medicine, Numer VOL 14 (3), 2024, ISSN 2001-1326
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/ctm2.1618

The long-term genetic stability and individual specificity of the human gut microbiome

Autorzy: Lianmin Chen, Daoming Wang, Sanzhima Garmaeva, Alexander Kurilshikov, Arnau Vich Vila, Ranko Gacesa, Trishla Sinha, Eran Segal, Rinse K Weersma, Cisca Wijmenga, Alexandra Zhernakova, Jingyuan Fu
Opublikowane w: CELL, 2021, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press

Dual UHPLC-HRMS Metabolomics and Lipidomics and Automated Data Processing Workflow for Comprehensive High-Throughput Gut Phenotyping (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: P Vangeenderhuysen, J Van Arnhem, B Pomian, M De Graeve, L De Commer, G Falony, J Raes, A Zhernakova, J Fu, L Y Hemeryck, L Vanhaecke
Opublikowane w: Analytical Chemistry, 2023, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.2c05371

CRISPR dynamics during the interaction between bacteria and phage in the first year of life (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jiqiu Wu, Hanyun Zhang, Rui Gan, Yan Xia, Fan Zhang, Daoming Wang, Jingyuan Fu, Timothy G Barraclough
Opublikowane w: Microbial Genomics, 2023, ISSN 2057-5858
Wydawca: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.001053

Large HDL particles negatively associate with leukocyte counts independent of cholesterol efflux capacity: A cross sectional study in the population-based LifeLines DEEP cohort (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Anouk G Groenen, Venetia Bazioti, Isabelle A van Zeventer, Lianmin Chen, Hilde E Groot, Jan-Willem Balder, Alexandra Zhernakova, Pim van der Harst, Antoine Rimbert, Jan Albert Kuivenhoven, Jingyuan Fu, Marit Westerterp
Opublikowane w: Atherosclerosis, 2022, ISSN 0021-9150
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.atherosclerosis.2022.01.008

Gut microbial DL-endopeptidase alleviates Crohn’s disease via the NOD2 pathway (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gao, Jie; Zhao, Xinmei; Hu, Shixian; Huang, Zhenhe; Hu, Mengyao; Jin, Shaoqin; Lu, Bingyun; Sun, Kai; Wang, Zhang; Fu, Jingyuan; Weersma, Rinse K; He, Xiaolong; Zhou, Hongwei
Opublikowane w: Cell Host & Microbe, 2022, ISSN 1934-6069
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.chom.2022.08.002

The composition and metabolic potential of the human small intestinal microbiota within the context of inflammatory bowel disease (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Renate AAA Ruigrok, Valerie Collij, Paula Sureda, Marjolein AY Klaassen, Laura A Bolte, Bernadien H Jansen, Michiel D Voskuil, Jingyuan Fu, Cisca Wijmenga, Alexandra Zhernakova, Rinse K Weersma, Arnau Vich Vila
Opublikowane w: Journal of Crohn's and Colitis, 2021, ISSN 1873-9946
Wydawca: Elsevier Science
DOI: 10.1093/ecco-jcc/jjab020

Gut dysbiosis associates with cytokine production capacity in viral-suppressed people living with HIV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Yue Zhang, Sergio Andreu-Sánchez, Nadira Vadaq, Daoming Wang, Vasiliki Matzaraki, Wouter A. van der Heijden, Ranko Gacesa, Rinse K. Weersma, Alexandra Zhernakova, Linos Vandekerckhove, Quirijn de Mast, Leo A. B. Joosten, Mihai G. Netea, André J. A. M. van der Ven, Jingyuan Fu
Opublikowane w: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2023, ISSN 2235-2988
Wydawca: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fcimb.2023.1202035

Gut microbiome dysbiosis is associated with increased mortality after solid organ transplantation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: J. Casper Swarte, Yanni Li, Shixian Hu, Johannes R. Björk, Ranko Gacesa, Arnau Vich Vila, Rianne M. Douwes, Valerie Collij, Alexander Kurilshikov, Adrian Post, Marjolein A. Y. Klaassen, Michele F. Eisenga, António W. Gomes-Neto, Daan Kremer, Bernadien H. Jansen, Tim J. Knobbe, Stefan P. Berger, Jan-Stephan F. Sanders, M. Rebecca Heiner-Fokkema, Robert J. Porte, Frans J. C. Cuperus, Vincent E. d
Opublikowane w: Science Translational Medicine, 2022, ISSN 1946-6234
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/scitranslmed.abn7566

Faecal metabolome and its determinants in inflammatory bowel disease (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Arnau Vich Vila, Shixian Hu, Sergio Andreu-Sánchez, Valerie Collij, Bernadien H Jansen, Hannah E Augustijn, Laura A Bolte, Renate A A A Ruigrok, Galeb Abu-Ali, Cosmas Giallourakis, Jessica Schneider, John Parkinson, Amal Al-Garawi, Alexandra Zhernakova, Ranko Gacesa, Jingyuan Fu, Rinse K Weersma
Opublikowane w: GUT, 2023, ISSN 1468-3288
Wydawca: BMJ Publishing Group Ltd & British Society of Gastroenterology
DOI: 10.1136/gutjnl-2022-328048

Gut microbiome and bile acids in obesity-related diseases (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rumei Li, Sergio Andreu-Sánchez, Folkert Kuipers, Jingyuan Fu
Opublikowane w: Best Practice & Research Clinical Endocrinology & Metabolism, 2021, ISSN 1521-690X
Wydawca: Bailliere Tindall And Cassell
DOI: 10.1016/j.beem.2021.101493

A benchmark of genetic variant calling pipelines using metagenomic short-read sequencing (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sergio Andreu-Sánchez, Lianmin Chen, Daoming Wang, Hannah E Augustijn, Alexandra Zhernakova, Jingyuan Fu
Opublikowane w: Frontiers in genetics, 2021, ISSN 1664-8021
Wydawca: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2021.648229

Microbial vitamin production mediates dietary effects on diabetic risk (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Daoming Wang, T. van Pham, Robert E. Steinert, Alexandra Zhernakova, Jingyuan Fu
Opublikowane w: Gut Microbes, 2022, ISSN 1949-0976
Wydawca: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2022.2154550

Phage-display immunoprecipitation sequencing of the antibody epitope repertoire in inflammatory bowel disease reveals distinct antibody signatures (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Arno R. Bourgonje, Sergio Andreu-Sánchez, Thomas Vogl, Shixian Hu, Arnau Vich Vila, Ranko Gacesa, Sigal Leviatan, Alexander Kurilshikov, Shelley Klompus, Iris N. Kalka, Hendrik M. van Dullemen, Adina Weinberger, Marijn C. Visschedijk, Eleonora A.M. Festen, Klaas Nico Faber, Cisca Wijmenga, Gerard Dijkstra, Eran Segal, Jingyuan Fu, Alexandra Zhernakova, Rinse K. Weersma
Opublikowane w: Immunity, 2023, ISSN 1097-4180
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.immuni.2023.04.017

Oral Microbiome in Relation to Periodontitis Severity and Systemic Inflammation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Adelina S Plachokova, Sergio Andreu-Sánchez, Marlies P Noz, Jingyuan Fu, Niels P Riksen
Opublikowane w: International Journal of Molecular Sciences, 2021, ISSN 1422-0067
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22115876

Stability of the human gut virome and effect of gluten-free diet (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sanzhima Garmaeva, Anastasia Gulyaeva, Trishla Sinha, Andrey N Shkoporov, Adam G Clooney, Stephen R Stockdale, Johanne E Spreckels, Thomas DS Sutton, Lorraine A Draper, Bas E Dutilh, Cisca Wijmenga, Alexander Kurilshikov, Jingyuan Fu, Colin Hill, Alexandra Zhernakova
Opublikowane w: Cell reports, 2021, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109132

Population-wide diversity and stability of serum antibody epitope repertoires against human microbiota (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Thomas Vogl, Shelley Klompus, Sigal Leviatan, Iris N Kalka, Adina Weinberger, Cisca Wijmenga, Jingyuan Fu, Alexandra Zhernakova, Rinse K Weersma, Eran Segal
Opublikowane w: Nature Medicine, 2021, ISSN 1078-8956
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-021-01409-3

Long non-coding RNAs involved in progression of non-alcoholic fatty liver disease to steatohepatitis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Biljana Atanasovska, Sander S Rensen, Glenn Marsman, Ronit Shiri-Sverdlov, Sebo Withoff, Folkert Kuipers, Cisca Wijmenga, Bart van de Sluis, Jingyuan Fu
Opublikowane w: Cells, 2021, ISSN 2073-4409
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/cells10081883

Environmental factors shaping the gut microbiome in a Dutch population (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: R. Gacesa, A. Kurilshikov, A. Vich Vila, T. Sinha, M. A. Y. Klaassen, L. A. Bolte, S. Andreu-Sánchez, L. Chen, V. Collij, S. Hu, J. A. M. Dekens, V. C. Lenters, J. R. Björk, J. C. Swarte, M. A. Swertz, B. H. Jansen, J. Gelderloos-Arends, S. Jankipersadsing, M. Ho!ker, R. C. H. Vermeulen, S. Sanna, H. J. M. Harmsen, C. Wijmenga, J. Fu, A. Zhernakova, R. K. Weersma
Opublikowane w: NATURE, 2022, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04567-7

Influence of the microbiome, diet and genetics on inter-individual variation in the human plasma metabolome (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Lianmin Chen, Daria V. Zhernakova, Alexander Kurilshikov, Sergio Andreu-Sánchez, Daoming Wang, Hannah E. Augustijn, Arnau Vich Vila, Lifelines Cohort Study, Rinse K. Weersma, Marnix H. Medema, Mihai G. Netea, Folkert Kuipers, Cisca Wijmenga, Alexandra Zhernakova, Jingyuan Fu
Opublikowane w: Nature Medicine, 2022, ISSN 1078-8956
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-022-02014-8

Challenges and future directions for studying effects of host genetics on the gut microbiome (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Serena Sanna, Alexander Kurilshikov, Adriaan van der Graaf, Jingyuan Fu, Alexandra Zhernakova
Opublikowane w: Nature genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-021-00983-z

Microbiome-Related Indole and Serotonin Metabolites are Linked to Inflammation and Psychiatric Symptoms in People Living with HIV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Nadira Vadaq, Yue Zhang, Elise Meeder, Lisa Van De Wijer, Muhammad Hussein Gasem, Leo AB Joosten, Mihai G Netea, Quirijn De Mast, Vasiliki Matzaraki, Arnt Schellekens, Jingyuan Fu, André JAM Van Der Ven
Opublikowane w: International Journal of Tryptophan Research, 2022, ISSN 1178-6469
Wydawca: Libertas Academica Ltd.
DOI: 10.1177/11786469221126888

Effect of host genetics on the gut microbiome in 7,738 participants of the Dutch Microbiome Project (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Esteban A Lopera-Maya, Alexander Kurilshikov, Adriaan van der Graaf, Shixian Hu, Sergio Andreu-Sánchez, Lianmin Chen, Arnau Vich Vila, Ranko Gacesa, Trishla Sinha, Valerie Collij, Marjiolein AY Klaassen, Laura A Bolte, Milla F Brandao Gois, Pieter BT Neerincx, Morris A Swertz, Hermie JM Harmsen, Cisca Wijmenga, Jingyuan Fu, Rinse K Weersma, Alexandra Zhernakova, Serena Sanna
Opublikowane w: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-021-00992-y

the challenge of the cytochrome P450 family (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Isabel Tamargo-Rubio; Anna Bella Simpson; Joanne A. Hoogerland; Joanne A. Hoogerland; Jingyuan Fu; Jingyuan Fu
Opublikowane w: Frontiers in Pharmacology, Vol 14 (2023), Numer 3, 2023, ISSN 1663-9812
Wydawca: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fphar.2023.1223108

Systematic analysis of relationships between plasma branched-chain amino acid concentrations and cardiometabolic parameters: an association and Mendelian randomization study (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Marwah Doestzada, Daria V Zhernakova, Inge C L van den Munckhof, Daoming Wang, Alexander Kurilshikov, Lianmin Chen, Vincent W Bloks, Martijn van Faassen, Joost H W Rutten, Leo A B Joosten, Mihai G Netea, Cisca Wijmenga, Niels P Riksen, Alexandra Zhernakova, Folkert Kuipers, Jingyuan Fu
Opublikowane w: BMC Medicine, Numer VOL 20, (485), 2022, ISSN 1741-7015
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12916-022-02688-4

Transmission and dynamics of mother-infant gut viruses during pregnancy and early life (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Lifelines NEXT cohort study, Sanzhima Garmaeva, Trishla Sinha, Anastasia Gulyaeva, Nataliia Kuzub, Johanne E Spreckels, Sergio Andreu-Sánchez, Ranko Gacesa, Arnau Vich Vila, Siobhan Brushett, Marloes Kruk, Jackie Dekens, Jan Sikkema, Folkert Kuipers, Andrey N Shkoporov, Colin Hill, Sicco Scherjon, Cisca Wijmenga, Jingyuan Fu, Alexander KurilshikovAlexandra Zhernakova
Opublikowane w: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45257-4

Long-term dietary patterns are associated with pro-inflammatory and anti-inflammatory features of the gut microbiome (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Laura A Bolte, Arnau Vich Vila, Floris Imhann, Valerie Collij, Ranko Gacesa, Vera Peters, Cisca Wijmenga, Alexander Kurilshikov, Marjo JE Campmans-Kuijpers, Jingyuan Fu, Gerard Dijkstra, Alexandra Zhernakova, Rinse K Weersma
Opublikowane w: GUT, 2021, ISSN 0017-5749
Wydawca: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2020-322670

Genetic, parental and lifestyle factors influence telomere length (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sergio Andreu-Sánchez, Geraldine Aubert, Aida Ripoll-Cladellas, Sandra Henkelman, Daria V. Zhernakova, Trishla Sinha, Alexander Kurilshikov, Maria Carmen Cenit, Marc Jan Bonder, Lude Franke, Cisca Wijmenga, Jingyuan Fu, Monique G. P. van der Wijst, Marta Melé, Peter Lansdorp & Alexandra Zhernakova
Opublikowane w: Communications Biology, 2022, ISSN 2399-3642
Wydawca: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42003-022-03521-7

Prevotella copri alleviates sarcopenia via attenuating muscle mass loss and function decline (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Xiaolei Liu, Jiqiu Wu, Jingyi Tang, Zhigang Xu, Bailing Zhou, Yang Liu, Fengjuan Hu, Gongchang Zhang , Rui Cheng, Xin Xia, Yilong Chen, Hongyu Wu, Daoming Wang, Jirong Yue, Biao Dong, Jingyuan Fu, Haopeng Yu, Birong Dong
Opublikowane w: J Cachexia Sarcopenia Muscle, Numer VOL 14 (5), 2023, ISSN 2190-5991
Wydawca: Springer Verlag
DOI: 10.1002/jcsm.13313

Discovery, diversity, and functional associations of crAss-like phages in human gut metagenomes from four Dutch cohorts (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Anastasia Gulyaeva, Sanzhima Garmaeva, Renate AAA Ruigrok, Daoming Wang, Niels P Riksen, Mihai G Netea, Cisca Wijmenga, Rinse K Weersma, Jingyuan Fu, Arnau Vich Vila, Alexander Kurilshikov, Alexandra Zhernakova
Opublikowane w: Cell Reports, 2022, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2021.110204

Diversity and Ecology of Caudoviricetes Phages with Genome Terminal Repeats in Fecal Metagenomes from Four Dutch Cohorts (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Anastasia Gulyaeva, Sanzhima Garmaeva, Alexander Kurilshikov, Arnau Vich Vila, Niels P Riksen, Mihai G Netea, Rinse K Weersma, Jingyuan Fu, Alexandra Zhernakova
Opublikowane w: Virusus, Numer VOL 14 (10), 2022, ISSN 1999-4915
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v14102305

Characterization of gut microbial structural variations as determinants of human bile acid metabolism (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Daoming Wang, Marwah Doestzada, Lianmin Chen, Sergio Andreu-Sánchez, Inge C.L. van den Munckhof, Hannah E. Augustijn, Martijn Koehorst, Angel J. Ruiz-Moreno, Vincent W. Bloks, Niels P. Riksen, Joost H.W. Rutten, Leo A.B. Joosten, Mihai G. Netea, Cisca Wijmenga, Alexandra Zhernakova, Folkert Kuipers, Jingyuan Fu
Opublikowane w: Cell Host Microbe, 2021, ISSN 1931-3128
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2021.11.003

Beyond personal space: Unveiling the transmission pattern of the human gut and oral microbiome (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sergio Andreu-Sánchez, Jiafei Wu, Jingyuan Fu
Opublikowane w: iMeta, 2023, ISSN 2770-596x
Wydawca: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/imt2.98

Choice of DNA extraction method affects stool microbiome recovery and subsequent phenotypic association analyses (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Asier Fernández-Pato, Trishla Sinha, Ranko Gacesa, Sergio Andreu-Sánchez, Milla F Brandao Gois, Jody Gelderloos-Arends, Dianne B H Jansen, Marloes Kruk, Martin Jaeger, Leo A B Joosten, Mihai G Netea, Rinse K Weersma, Cisca Wijmenga, Hermie J M Harmsen, Jingyuan Fu, Alexandra Zhernakova, Alexander Kurilshikov
Opublikowane w: Scientific Reports, 2024, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-54353-w

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Udostępnij tę stronę Udostępnij tę stronę w mediach społecznościowych

Pobierz Pobierz zawartość strony

Ostatnia aktualizacja: 17 Marca 2025

Moja broszura

Permalink: https://cordis.europa.eu/project/id/101001678/results/pl

European Union, 2025

Moja broszura 0 0