Opis projektu
Badanie historii adaptacji komosy ryżowej
Komosa ryżowa to pochodząca z Ameryki Południowej roślina o wysokich właściwościach odżywczych, niezwykle istotna z punktu widzenia globalnego bezpieczeństwa żywnościowego. Zespół finansowanego ze środków UE projektu PALEOQUINOA wykorzysta zachowane cząsteczki kopalnego DNA z próbek archeologicznych, by przeanalizować genomiczne, transkryptomiczne i epigenomiczne zmiany, które zaszły w komosie ryżowej w ciągu ostatnich 3 500 lat. Łącząc techniki badania DNA i nowoczesne metody obliczeniowe, naukowcy utworzą pierwszy zestaw danych opisujący cały genom komosy ryżowej, co umożliwi prześledzenie historii jej udomowienia. Ponadto naukowcy zbadają – po raz pierwszy – transkryptom oraz epigenetyczne sieci regulacji ekspresji genów w pradawnych nasionach komosy ryżowej, analizując je w odniesieniu do zmian środowiskowych. Takie multidyscyplinarne podejście pozwoli także poprawić profil genetyczny komosy ryżowej, dzięki czemu wzrośnie przydatność tej rośliny uprawnej w kontekście kryzysu związanego z zanikaniem różnorodności biologicznej.
Cel
Quinoa is a highly nutritious grain identified by the UN as an essential crop to improve world food security. Pre-Columbian cultures started the domestication of quinoa about 7,000 years ago in the highland and coastal environments of the Andes where it is adapted to various biotic and abiotic stresses. The spread of quinoa out the centres of domestication likely required adaptation to new environments supported by favourable alleles at critical genetic and epigenetic loci. However, domestication as an intensive selection process can also lead to a reduction of the genetic diversity of domesticates, reducing their adaptability plants and threatening food security. Accessing the genetic makeup of dated archaeobotanical samples provides a powerful opportunity to examine the genomic information that has changed at various stages of domestication, enabling the identification of lost genetic diversity at key loci. Archaeological studies have reported quinoa remains dating back to 4,000 years before present, but the ancient genetic diversity remains under characterised. PALEOQUINOA will take advantage of the excellent preservation of ancient DNA molecules in archaeological specimens to track the genomic, transcriptomic and epigenomic changes in quinoa in the last 3,500 years. The unique combination of advanced ancient DNA techniques and cutting-edge computational methods will generate the first genome-scale dataset of ancient quinoa and characterise the domestication history of this crop. In addition to the genome, PALEOQUINOA will also investigate, for the first time, the transcriptome and epigenetic regulatory gene expression networks of ancient quinoa seeds, in relation to environmental changes. The new knowledge gained through this multidisciplinary approach will shed light into the evolutionary history of crop domestication and facilitate improvements in the genetic makeup of quinoa to increase its suitability as a crop at the time of ongoing biodiversity crisis.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaDNA
- nauki przyrodniczeinformatykanauki obliczeniowe
- medycyna i nauki o zdrowiunauki o zdrowiuodżywianie
- nauki przyrodniczenauki biologiczneekologiaekosystemy
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
75794 Paris
Francja