Opis projektu
Wykorzystanie naturalnego wroga bakterii do eliminacji antybiotykoopornych biofilmów
Staphylococcus aureus to powszechnie występująca bakteria, którą wiele osób nieświadomie przenosi na skórę i błony śluzowe. W przypadku kontaktu ze zdrową skórą zwykle nie powoduje zakażenia, jednak przeniknięcie bakterii do organizmu może wywołać poważną, a nawet śmiertelną chorobę. W wyniku zakażenia bakterie tworzą biofilm, który wymaga zwalczania przy pomocy antybiotyków w wysokich dawkach, na którą patogen stał się w dużej mierze oporny. Fagoterapia, czyli wykorzystanie wirusów zwalczających bakterie do leczenia zakażeń, stanowi obiecującą opcję, ale wymaga lepszego zrozumienia mechanizmów leżących u jej podstaw. Badacze finansowanego ze środków Unii Europejskiej projektu BioPhage zajmą się analizą rozprzestrzeniania się fagów w biofilmie, zbadają odporność zbiorowiskową na zakażenie fagami oraz przeanalizują proces replikacji fagów w komórkach w warunkach biologicznych i klinicznych.
Cel
In 2017, the World Health Organization declared Staphylococcus aureus to be an antibiotic-resistant pathogen for which new therapeutics are urgently needed. Upon infection, S. aureus forms biofilms that can only be treated by the long-term application of several antibiotics in high doses or the surgical removal of the infected tissues. An alternative approach, phage therapy, has not been approved for clinical use, because the effects of phage infection on a biofilm are not sufficiently characterized. We propose to study the dynamics of the propagation of Herelleviridae phage phi812 in a S. aureus biofilm and molecular details of phi812 replication in a cell. We integrated a microfluidic system into a light-sheet microscope to enable continuous multi-day observation of the phage infection of a biofilm. We will determine how sub-populations of metabolically dormant or phage-resistant cells in a biofilm provide herd immunity against phi812 infection. Our system enables the fixation of biofilm segments for subsequent correlative imaging by serial block-face scanning electron microscopy to identify the interactions of phages with bacterial cells. We will use focused ion beam milling together with cryo-electron microscopy and tomography to determine high-resolution structures of previously uncharacterized phi812 replication and assembly intermediates in S. aureus cells. We will study the function of bacterial membranes and macromolecular complexes in the initiation and completion of phage genome delivery, the assembly of phage portal complexes and heads, and the mechanisms of genome packaging and head-tail attachment. This proposal’s biological significance lies in its focus on the as-yet uncharacterized interactions of phages and bacteria under biologically and clinically relevant conditions. Our analyses of phage spread in a biofilm, herd immunity against phage infection, and phage replication in cells may identify approaches for making phage therapy more effective.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez zespół projektowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez zespół projektowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia bakteriologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia wirusologia
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka mikroskopia electron microscopy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia molekularna
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
- Virus
- phage
- bacterium
- infection
- biofilm
- biofilm matrix
- therapy
- lightsheet
- fluorescence
- microscopy
- fluorescent protein
- CRICPR
- Cas
- genetic modification
- recombinant
- time-lapse
- imaging
- development
- antibiotic resistance
- herd immunity
- serial-block face microscopy
- correlative imaging
- cryo-electron microscopy
- tomography
- single particle reconstruction
- focused ion beam milling
- in situ
- genome ejection
- replication
- head assembly
- replication factories
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2021-COG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
601 77 Brno
Czechy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.