In situ genetic perturbation of gut bacteria with engineered phage vectors and CRISPR

Informazioni relative al progetto

crInSitu

ID dell’accordo di sovvenzione: 101044479

DOI 10.3030/101044479

Data della firma CE 22 Aprile 2022

Data di avvio 1 Settembre 2022

Data di completamento 31 Agosto 2027

Finanziato da

• European Research Council (ERC)

Costo totale € 1 999 780,00

Contributo UE € 1 999 780,00

Coordinato da

INSTITUT PASTEUR
Francia

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Articoli sottoposti a revisione paritaria (6)

Computational design of novel Cas9 PAM-interacting domains using evolution-based modelling and structural quality assessment

Autori: Cyril Malbranke; William Rostain; Florence Depardieu; Simona Cocco; Rémi Monasson; David Bikard
Pubblicato in: PLoS Computational Biology, Vol 19, Iss 11, p e1011621 (2023), 2023, ISSN 1553-7358
Editore: PLoS Computational Biology
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1011621

Generation of a Biotin-Tagged Dual-Display Phage

Autori: De Plano, Laura Maria; Oddo, Salvatore; Bikard, David; Caccamo, Antonella; Conoci, Sabrina
Pubblicato in: Cells, 2024, ISSN 2073-4409
Editore: MDPI
DOI: 10.3390/CELLS13201696

Nucleic Acids Research

Autori: William Rostain; Theophile Grebert; Danylo Vyhovskyi; Paula Thiel Pizarro; Gatwa Tshinsele-Van Bellingen; Lun Cui; David Bikard
Pubblicato in: "Nucleic Acids Research, 2023, 51 (7), pp.3485-3496. ⟨10.1093/nar/gkad170⟩", 2023, ISSN 0305-1048
Editore: Nucleic Acids Research
DOI: 10.1093/nar/gkad170

A virally encoded tRNA neutralizes the PARIS antiviral defence system

Autori: Nathaniel Burman, Svetlana Belukhina, Florence Depardieu, Royce A. Wilkinson, Mikhail Skutel, Andrew Santiago-Frangos, Ava B. Graham, Alexei Livenskyi, Anna Chechenina, Natalia Morozova, Trevor Zahl, William S. Henriques, Murat Buyukyoruk, Christophe Rouillon, Baptiste Saudemont, Lena Shyrokova, Tatsuaki Kurata, Vasili Hauryliuk, Konstantin Severinov, Justine Groseille, Agnès Thierry, Romain Koszul, Florian Tesson, Aude Bernheim, David Bikard, Blake Wiedenheft, Artem Isaev
Pubblicato in: Nature, Numero 634, 2024, ISSN 0028-0836
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41586-024-07874-3

In situ targeted base editing of bacteria in the mouse gut

Autori: Andreas K. Brödel; Loïc H. Charpenay; Matthieu Galtier; Fabien J. Fuche; Rémi Terrasse; Chloé Poquet; Jan Havránek; Simone Pignotti; Antonina Krawczyk; Marion Arraou; Gautier Prevot; Dalila Spadoni; Matthew T. N. Yarnall; Edith M. Hessel; Jesus Fernandez-Rodriguez; Xavier Duportet; David Bikard
Pubblicato in: Nature, 2024, ISSN 1476-4687
Editore: Nature
DOI: 10.1038/s41586-024-07681-w

Delivery of functional Cas:DNA nucleoprotein complexes into recipient bacteria through a type IV secretion system

Autori: Dolores L. Guzmán-Herrador; Andrea Fernández-Gómez; Florence Depardieu; David Bikard; Matxalen Llosa
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, 2024, ISSN 1091-6490
Editore: Proceedings of the National Academy of Science
DOI: 10.1073/PNAS.2408509121