Eco-Epidemiological Intelligence for early Warning and response to mosquito-borne disease risk in Endemic and Emergence settings

Projektinformationen

E4Warning

ID Finanzhilfevereinbarung: 101086640

DOI

10.3030/101086640

EK-Unterschriftsdatum 4 Oktober 2022

Startdatum 1 Januar 2023

Enddatum 31 Dezember 2026

Finanziert unter

• Food, Bioeconomy Natural Resources, Agriculture and Environment

Gesamtkosten

€ 4 082 528,75

EU-Beitrag

€ 4 082 528,75

Koordiniert durch

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Spain

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Leistungen

Data sets, microdata, etc (1)

Modelled monthly bird habitat suitability and species composition for the study sites

Modelled monthly bird habitat suitability and species composition for the study sitesTask 5.1 contributes to this deliverable

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (33)

Augmenting community-driven vector surveillance with automated image classification: Lessons from the Artificial Intelligence Mosquito Alert (AIMA) system

Autoren: Monika Falk, Joan Garriga, Roger Eritja, Isis Sanpera-Calbet, Enric Pou, Alex Richter-Boix, John R.B. Palmer, Frederic Bartumeus
Veröffentlicht in: Epidemics, Ausgabe 53, 2026, ISSN 1755-4365
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.EPIDEM.2025.100863

Disruption of seasonal influenza circulation and evolution during the 2009 H1N1 and COVID-19 pandemics in Southeastern Asia

Autoren: Zhiyuan Chen, Joseph L.-H. Tsui, Jun Cai, Shuo Su, Cécile Viboud, Louis du Plessis, Philippe Lemey, Moritz U. G. Kraemer, Hongjie Yu
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-55840-Y

Short-term effect of temperature and precipitation on the incidence of West Nile Neuroinvasive Disease in Europe: a multi-country case-crossover analysis

Autoren: Giovenale Moirano, Chloe Fletcher, Jan C. Semenza, Rachel Lowe
Veröffentlicht in: The Lancet Regional Health - Europe, Ausgabe 48, 2025, ISSN 2666-7762
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.LANEPE.2024.101149

Compound and cascading effects of climatic extremes on dengue outbreak risk in the Caribbean: an impact-based modelling framework with long-lag and short-lag interactions

Autoren: Chloe Fletcher, Giovenale Moirano, Tilly Alcayna, Leslie Rollock, Cédric J Van Meerbeeck, Roché Mahon, Adrian Trotman, Laura-Lee Boodram, Tia Browne, Sabu Best, Daniela Lührsen, Avriel R Diaz, Willy Dunbar, Catherine A Lippi, Sadie J Ryan, Felipe J Colón-González, Anna M Stewart-Ibarra, Rachel Lowe
Veröffentlicht in: The Lancet Planetary Health, Ausgabe 9, 2025, ISSN 2542-5196
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.LANPLH.2025.06.003

Climate variation and serotype competition drive dengue outbreak dynamics in Singapore

Autoren: Emilie Finch, Chia-chen Chang, Adam Kucharski, Shuzhen Sim, Lee-Ching Ng, Rachel Lowe
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-66411-6

Introduction, establishment, and distribution of Aedes aegypti and dengue in a temperate capital of Brazil: a retrospective surveillance-based study

Autoren: Danielle Andreza da Cruz Ferreira, Laís Picinini Freitas, Rachel Lowe, Getúlio Dornelles Souza, Ricardo Toshio Fujiwara, Raquel Martins Lana
Veröffentlicht in: The Lancet Regional Health - Americas, Ausgabe 48, 2025, ISSN 2667-193X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.LANA.2025.101153

Routes of importation and spatial dynamics of SARS-CoV-2 variants during localised interventions in Chile

Autoren: Bernardo Gutierrez; Joseph L.-H. Tsui; Giulia Pullano; Mattia Mazzoli; Karthik Gangavarapu; Rhys P.D. Inward; Sumali Bajaj; Rosario Evans Pena; Simon Busch-Moreno; Marc A. Suchard; Oliver G. Pybus; Alejandra Dunner; Rodrigo Puentes; Salvador Ayala; Jorge Fernandez; Rafael Araos; Leo Ferres; Vittoria Colizza; Moritz U.G. Kraemer
Veröffentlicht in: PNAS Nexus, Ausgabe 3, 11, 2024, ISSN 2752-6542
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/pnasnexus/pgae483

Impacts of climate change-related human migration on infectious diseases

Autoren: Joseph L.-H. Tsui; Rosario Evans Pena; Monika Moir; Rhys P. D. Inward; Eduan Wilkinson; James Emmanuel San; Jenicca Poongavanan; Sumali Bajaj; Bernardo Gutierrez; Abhishek Dasgupta; Tulio de Oliveira; Moritz U. G. Kraemer; Houriiyah Tegally; Prathyush Sambaturu
Veröffentlicht in: Nature Climate Change, Ausgabe 14: 793–802, 2024, ISSN 1758-6798
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41558%2D024%2D02078%2Dz,-Oct%204%

Residual Longevity of Recaptured Sterile Mosquitoes as a Tool to Understand Field Performance and Reveal Quality

Autoren: Georgios Balatsos, Laura Blanco-Sierra, Vasileios Karras, Arianna Puggioli, Hugo Costa Osório, Romeo Bellini, Dimitrios P. Papachristos, Jérémy Bouyer, Frederic Bartumeus, Nikos T. Papadopoulos, Antonios Michaelakis
Veröffentlicht in: Insects, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2075-4450
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/INSECTS15110826

Strengthening resilience to emerging vector-borne diseases in Europe: lessons learnt from countries facing endemic transmission

Autoren: G.E.C. Charnley, T. Alcayna, A. Almuedo-Riera, C. Antoniou, A. Badolo, F. Bartumeus, L.-L. Boodram, R. Bueno-Marí, C. Codeço, F.C. Coelho, F. Costa, H. Cox, N. Haddad, N.A. Hamid, P. Kittayapong, G. Korukluoğlu, A. Michaelakis, R. Maciel-de-Freitas, T. Mo
Veröffentlicht in: The Lancet Regional Health Europe, Ausgabe 53, 101271, 2025, ISSN 2666-7762
Herausgeber: The Lancet
DOI: 10.1016/j.lanepe.2025.10127

Synchronized dynamics of dengue across the Americas

Autoren: Talia M. Quandelacy, Maria F. Vincente-González, Maria Eugenia Grillet, Manuel Colomé-Hidalgo, Demian Herrera, Jomil M. Torres Aponte, Melissa Marzán Rodríguez, Laura E. Adams, Gabriela Paz-Bailey, Dania M. Rodriguez, César Munayco, Laura Figueroa, Rolando Masis, Mercy Borbor-Cordova, Esteban Ortiz-Prado, Matias Piaggio, Leslie Rollock, Guillermo Barrenechea, Aníbal Carbajo, Elizabet L. Estallo, Thais dos Santos, Michael A. Robert, Isabel Rodriguez-Barraquer, Rachel Lowe, Anna M. Stewart-Ibarra, Bernardo Garcia-Carreras, Derek Cummings, Michael A. Johansson
Veröffentlicht in: Science Translational Medicine, Ausgabe 17, 2025, ISSN 1946-6234
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/SCITRANSLMED.ADQ4326

Suppression of the Asian tiger mosquito (Aedes albopictus) populations using the boosted sterile insect technique in Greece

Autoren: Athanasios Giatropoulos, Georgios Balatsos, Vasileios Karras, Renaud Lancelot, Jérémy Bouyer, Arianna Puggioli, Romeo Bellini, Nikos T. Papadopoulos, Dimitrios P. Papachristos, Ioannis Mouratidis, Antonios Michaelakis
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41598-025-22454-9

Two-Year Entomological Survey of Mosquito Fauna in the Attica Region, Greece: Species Composition

Autoren: Marina Bisia, Georgios Balatsos, Maria Sakellariou Sofianou, Stavroula Beleri, Nikolaos Tegos, Evangelia Zavitsanou, Vasileios Karras, Dimitra Kollia, Antonios Michaelakis, Eleni Patsoula
Veröffentlicht in: Insects, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2075-4450
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/INSECTS16040406

Multi-model approach to understand and predict past and future dengue epidemic dynamics

Autoren: Cathal Mills, Francesca Falconi-Agapito, Jean-Paul Carrera, Cesar Munayco, Moritz U.G. Kraemer, Christl A. Donnelly
Veröffentlicht in: Royal Society Open Science, Ausgabe 12, 2025, ISSN 2054-5703
Herausgeber: The Royal Society
DOI: 10.1098/RSOS.241870

Nature Communications

Autoren: Chen, Z; Tsui, JL; Cai, J; Su, S; Viboud, C; du Plessis, L; Lemey, P; Kraemer, MUG; Yu, H
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 475, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1038/s41467-025-55840-y

Spatiotemporal dynamics and determinants of yellow fever outbreaks in 21st century Brazil: an ecological study

Autoren: Fabricio T O Ker, Chloe Fletcher, Sophie A Lee, Adriano Pinter, Mariângela Carneiro, Rachel Lowe, David S Barbosa
Veröffentlicht in: Transactions of The Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene, Ausgabe 119, 2025, ISSN 0035-9203
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/TRSTMH/TRAF081

Genomic Characterization of Circulating Dengue Virus, Ethiopia, 2022–2023

Autoren: Adugna Abera, Houriiyah Tegally, Geremew Tasew, Eduan Wilkinson, Abraham Ali, Feyisa Regasa, Molalegne Bitew, Mahlet Belachew, Lucious Chabuka, Gaspary Mwanyika, Derek Tshiabuila, Jennifer Giandhari, Sureshnee Pillay, Jenicca Poogavanan, Monika Moir, Moritz U.G. Kraemer, Kamran Khan, Carmen Huber, Getachew Tollera, Tobias F. Rinke de Wit, Cheryl Baxter, Richard Lessells, Dawit Wolday, Dereje Beyene, Tulio de Oliveira, null null
Veröffentlicht in: Emerging Infectious Diseases, Ausgabe 31, 2025, ISSN 1080-6040
Herausgeber: Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
DOI: 10.3201/EID3103.240996

Automated classification of mixed populations of Aedes aegypti and Culex quinquefasciatus mosquitoes under field conditions

Autoren: Fábio Castelo Branco Fontes Paes Njaime, Renato Cesar Máspero, André de Souza Leandro, Rafael Maciel-de-Freitas
Veröffentlicht in: Parasites & Vectors, Ausgabe 17, 2024, ISSN 1756-3305
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13071-024-06417-z

Dengue virus importation risks in Africa: a modelling study

Autoren: Poongavanan, Jenicca; Lourenço, José; Tsui, Joseph L.H.; Colizza, Vittoria; Ramphal, Yajna; Baxter, Cheryl; Kraemer, Moritz U. G.; Dunaiski, Marcel; Oliveira, Tulio de; Tegally, Houriiyah
Veröffentlicht in: The Lancet Planetary Health, Ausgabe 8, 12, E1043-E1054, 2024, ISSN 2542-5196
Herausgeber: The Lancet
DOI: 10.1016/s2542-5196(24)00272-9

Insects

Autoren: Balatsos, Georgios; Blanco-Sierra, Laura; Karras, Vasileios; Puggioli, Arianna; Costa Osório, Hugo; Bellini, Romeo; Papachristos, Dimitrios P.; Bouyer, Jérémy; Bartumeus, Frederic; Papadopoulos, Nikos T.; Michaelakis, Antonios
Veröffentlicht in: Insects, Ausgabe 15(11), 826, 2024, ISSN 2075-4450
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/insects15110826

<scp>MoveTraits</scp> —A Database for Integrating Animal Behaviour Into Trait‐Based Ecology

Autoren: Larissa T. Beumer, Anne G. Hertel, Raphaël Royauté, Marlee A. Tucker, Jörg Albrecht, Roxanne S. Beltran, Francesca Cagnacci, Sarah C. Davidson, Nandintsetseg Dejid, Roland Kays, Andrea Kölzsch, Ashley Lohr, Eike Lena Neuschulz, Kamran Safi, Anne K. Scharf, Matthias Schleuning, Martin Wikelski, Thomas Mueller
Veröffentlicht in: Ecology Letters, Ausgabe 29, 2026, ISSN 1461-023X
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1111/ELE.70297

Toward optimal disease surveillance with graph-based active learning

Autoren: Joseph L.-H. Tsui; Mengyan Zhang; Prathyush Sambaturu; Simon Busch-Moreno; Marc A. Suchard; Oliver G. Pybus; Seth Flaxman; Elizaveta Semenova; Moritz U. G. Kraemer
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 121 (52) e2412424121, 2024, ISSN 1091-6490
Herausgeber: PNAS
DOI: 10.1073/pnas.2412424121

The overlapping global distribution of dengue, chikungunya, Zika and yellow fever

Autoren: Ahyoung Lim, Freya M. Shearer, Kara Sewalk, David M. Pigott, Joseph Clarke, Azhar Ghouse, Ciara Judge, Hyolim Kang, Jane P. Messina, Moritz U. G. Kraemer, Katy A. M. Gaythorpe, William M. de Souza, Elaine O. Nsoesie, Michael Celone, Nuno Faria, Sadie J. Ryan, Ingrid B. Rabe, Diana P. Rojas, Simon I. Hay, John S. Brownstein, Nick Golding, Oliver J. Brady
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-58609-5

Artificial intelligence for modelling infectious disease epidemics

Autoren: Moritz U. G. Kraemer; Joseph L.-H. Tsui; Serina Y. Chang; Spyros Lytras; Mark P. Khurana; Samantha Vanderslott; Sumali Bajaj; Neil Scheidwasser; Jacob Liam Curran-Sebastian; Elizaveta Semenova; Mengyan Zhang; H. Juliette T. Unwin; Oliver J. Watson; Cathal Mills; Abhishek Dasgupta; Luca Ferretti; Samuel V. Scarpino; Etien Koua; Oliver Morgan; Houriiyah Tegally; Ulrich Paquet; Loukas Moutsianas; Christophe Fraser; Neil M. Ferguson; Eric J. Topol; David A. Duchêne; Tanja Stadler; Patricia Kingori; Michael J. Parker; Francesca Dominici; Nigel Shadbolt; Marc A. Suchard; Oliver Ratmann; Seth Flaxman; Edward C. Holmes; Manuel Gomez-Rodriguez; Bernhard Schölkopf; Christl A. Donnelly; Oliver G. Pybus; Simon Cauchemez; Samir Bhatt
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 638, pages 623–635, 2025, ISSN 1476-4687
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1038/s41586-024-08564-w

Renewal equations for mosquito‐borne diseases

Autoren: Cathal Mills, Tarek Alrefae, William S. Hart, Moritz U. G. Kraemer, Kris V. Parag, Robin N. Thompson, Christl A. Donnelly, Ben Lambert
Veröffentlicht in: Methods in Ecology and Evolution, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-210X
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1111/2041-210X.70110

Sequential Federated Analysis of Early Outbreak Data Applied to Incubation Period Estimation

Autoren: Simon Busch-Moreno, Moritz U.G. Kraemer
Veröffentlicht in: Epidemics, 2026, ISSN 1755-4365
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.EPIDEM.2026.100890

Protocols for spatial modelling of vector habitat suitability

Autoren: William Wint, Cedric Marsboom
Veröffentlicht in: EFSA Supporting Publications, Ausgabe 22, 2025, ISSN 2397-8325
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.2903/SP.EFSA.2025.EN-9749

Ecological drivers of arboviral disease risk: Vector-host interfaces in a Mediterranean wetland of Northeastern Spain

Autoren: Júlia Froxán-Grabalosa, Simone Mariani, Catuxa Cerecedo-Iglesias, Alex Richter-Boix, Alex Ollé Torner, Magda Pla, Lluís Brotons, Frederic Bartumeus
Veröffentlicht in: PLOS Neglected Tropical Diseases, Ausgabe 19, 2025, ISSN 1935-2735
Herausgeber: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/JOURNAL.PNTD.0013447

Scalable, open-access and multidisciplinary data integration pipeline for climate-sensitive diseases

Autoren: Abhishek Dasgupta, Iago Perez-Fernandez, Tuyen Huynh, Cathal Mills, Rowan C. Nicholls, Prathyush Sambaturu, Marc Choisy, David Wallom, Tung Nguyen-Duy, Rhys P. D. Inward, John-Stuart Brittain, Sarah Sparrow, Moritz U.G. Kraemer
Veröffentlicht in: Wellcome Open Research, Ausgabe 10, 2025, ISSN 2398-502X
Herausgeber: F1000 Research Ltd
DOI: 10.12688/WELLCOMEOPENRES.24774.2

Climate change, thermal anomalies, and the recent progression of dengue in Brazil.

Autoren: Barcellos, C., Matos, V., Lana, R. M., & Lowe, R
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 14, 2024, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-56044-y

Understanding Mosquito Vector Invasion Pathways: Synergistic Effects of Human Mobility, Climate and Natural Dispersal

Autoren: Marta Pardo‐Araujo, Egor Kotov, David Alonso, Frederic Bartumeus
Veröffentlicht in: Ecology Letters, Ausgabe 29, 2026, ISSN 1461-023X
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1111/ELE.70317DIGITALOBJECTIDENTIFIER(DOI)

Adult Aedes albopictus in winter: implications for mosquito surveillance in southern Europe

Autoren: Daniela Sofie Lührsen; Evangelia Zavitsanou; Catuxa Cerecedo-Iglesias; Marta Pardo-Araujo; John R B Palmer; Frederic Bartumeus; Tomás Montalvo; Antonios Michaelakis; Rachel Lowe
Veröffentlicht in: The Lancet Planetary Health, Ausgabe Volume 7: E729-E731, 2023, ISSN 2542-5196
Herausgeber: The Lancet Group / Elsevier
DOI: 10.1016/S2542

Harmonizing Multisource Data to Inform Vector-Borne Disease Risk Management Strategies

Autoren: Rachel Lowe, Claudia Torres Codeço
Veröffentlicht in: Annual Review of Entomology, Ausgabe 70, 2025, ISSN 0066-4170
Herausgeber: Annual Reviews
DOI: 10.1146/ANNUREV-ENTO-040124-015101

Conference proceedings (2)

XIth International EMCA Conference

Autoren: null EMCA Scientific Committee
Veröffentlicht in: Journal of the European Mosquito Control Association, 2023, ISSN 2054-930X
Herausgeber: Wageningen Academi
DOI: 10.52004/jemca2023.s1

The role of entomological surveillance in mitigating vector risks and monitoring points of entry

Autoren: Antonios Michaelakis, Georgios Balatsos, Vasileios Karras, Marina Bisia, Maria Sakellariou Sofianou, Stavroula Beleri, Evangelia Zavitsano, Dimitra Kollia, Antonios Psarris, Eleni Patsoula
Veröffentlicht in: Population Medicine, Ausgabe vol. 7, no 1, 2025
Herausgeber: European Publishing

Monographic books (1)

Early warning systems for vector-borne diseases: engagement, methods and implementation

Autoren: Emilie Finch, Martín Lotto Batista, Tilly Alcayna, Sophie A. Lee, Isabel K. Fletcher, Rachel Lowe
Veröffentlicht in: Planetary health approaches to understand and control vector-borne diseases, 2024, ISBN 9789004688650
Herausgeber: Wageningen Academic
DOI: 10.1163/9789004688650