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A Plan towards an eDNA reference library and data repository for Aquatic Organisms, navigating Europe towards the next generation biodiversity monitoring

Descrizione del progetto

Approccio basato sull’eDNA per la strategia UE Mission Ocean

L’UE ha fissato l’obiettivo di ripristinare gli oceani e le acque entro il 2030. L’analisi del DNA ambientale (eDNA) può svolgere un ruolo cruciale nel raggiungimento di questo obiettivo. Tuttavia, l’implementazione di metodi basati sull’eDNA incontra delle difficoltà a causa di biblioteche di riferimento incomplete e scollegate, nonché della mancanza di metadati armonizzati. Il progetto eDNAqua-plan, finanziato dall’UE, è in linea con la strategia Mission Ocean dell’UE. Si concentra sulla raccolta di informazioni su progetti, iniziative e infrastrutture di monitoraggio acquatico. Il progetto valuterà la fattibilità della creazione di un ecosistema digitale di depositi di eDNA e di una biblioteca di riferimento di specie marine e d’acqua dolce. L’obiettivo è quello di sostenere i programmi di monitoraggio della biodiversità acquatica e di sviluppare un approccio standardizzato per il monitoraggio acquatico utilizzando strumenti di eDNA.

Obiettivo

The EU Mission to restore our Oceans and Waters by 2030 relies on robust, reliable and ideally real-time biodiversity data. The analysis of environmental DNA (eDNA) extracted from water or sediment, represents a major source of innovation in aquatic ecosystem monitoring with great potential to support the EU Mission. The central limitation for the routine implementation of eDNA-based methods are incomplete, disconnected and non-standardized reference libraries for taxonomic assignment as well as a lack of harmonised metadata. To support the coordination of the EU Mission Ocean strategy, eDNAqua-Plan will 1) collect information on existing projects, initiatives and infrastructures for aquatic monitoring in the EU and associated countries, 2) provide an overview of all national and international activities of standardization and interoperationalisation of methods and data workflows and 3) assess the relevance and feasibility of the creation of a digital ecosystem of eDNA repositories and an integrated and dynamic reference library of marine and freshwater species that is open-access and based on FAIR principles to support future aquatic biodiversity monitoring programmes and mapping initiatives. The interdisciplinary eDNAqua-Plan consortium comprises 18 partner institutions from 11 countries, and one international (UN) institute, with complementary expertise in marine and freshwater monitoring, eDNA analysis as well as data science. The consortium cooperates with the large EU research projects and infrastructure such as EMODnet, BIOSCAN-Europe, the Ocean and Water knowledge system, LifeWatch, and international systems (ELIXIR/EBI and OBIS) etc. to maximise synergies and interoperability internationally. Possible implementation will be demonstrated by use cases from national and transnational water monitoring programs. Based on this, eDNAqua-Plan will deliver a roadmap for harmonized aquatic monitoring using eDNA tools in Europe and beyond.

Parole chiave

Coordinatore

EUROPEAN MARINE BIOLOGICAL RESOURCE CENTRE EUROPEAN RESEARCH INFRASTRUCTURE CONSORTIUM
Contribution nette de l'UE
€ 240 625,00
Indirizzo
4 PLACE JUSSIEU
75005 Paris
Francia

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Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
€ 240 625,00

Partecipanti (17)