HetERogeneous sEmantic Data integratIon for the guT-bRain interplaY

Informacje na temat projektu

HEREDITARY

Identyfikator umowy o grant: 101137074

DOI

10.3030/101137074

Data podpisania przez KE 13 Grudnia 2023

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2024

Data zakończenia 31 Grudnia 2027

Finansowanie w ramach

• Health

Koszt całkowity

€ 9 988 833,75

Wkład UE

€ 9 988 833,75

Koordynowany przez

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI PADOVA
Italy

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Conference proceedings (19)

Binomial Confidence Intervals for Knowledge Graph Accuracy Estimation (Extended Abstract)

Autorzy: Marchesin, Stefano; Silvello, Gianmaria
Opublikowane w: SEBD 2025, 2025
Wydawca: Ceur-Ws
DOI: 10.5281/ZENODO.15745400

Utility-Oriented Knowledge Graph Accuracy Estimation with LimitedAnnotations: A Case Study on DBpedia

Autorzy: Marchesin, Stefano; Silvello, Gianmaria; Alonso, Omar
Opublikowane w: HCOMP 2024, 2024
Wydawca: AAAI
DOI: 10.1609/hcomp.v12i1.31605

Extending Nanopublications with Knowledge Provenance for Multi-Source Scientific Assertions

Autorzy: Fabio Giachelle, Stefano Marchesin, Laura Menotti, and Gianmaria Silvello
Opublikowane w: IRCDL 2025, 2025
Wydawca: CEUR

Constrained Linked Entity ANnotation using RAG (CLEANR)

Autorzy: B. Kantz, S. Lengauer, P. Waldert, T. Schreck
Opublikowane w: CLEF 2025 BioASQ Report Paper for Task GutBrainIE on Gut-Brain Interplay Information Extraction, 2025
Wydawca: CEUR Workshop Proceedings

Doctron: A Web-based Collaborative Annotation Tool for Ground Truth Creation in IR

Autorzy: Ornella Irrera, Stefano Marchesin, Farzad Shami, Gianmaria Silvello
Opublikowane w: Proceedings of the 48th International ACM SIGIR Conference on Research and Development in Information Retrieval, 2025
Wydawca: ACM
DOI: 10.1145/3726302.3730286

MetaTron: Streamlining Collaborative Annotation for Biomedical Documents

Autorzy: Irrera, Ornella; Marchesin, Stefano; Silvello, Gianmaria
Opublikowane w: SWAT4HCLS, 2025
Wydawca: Arxiv
DOI: 10.5281/ZENODO.15656043

Advancing Inclusivity in a Medical Terminology Resource concerning the Gut-Brain Interplay: Insights from the HEREDITARY Project

Autorzy: Vanessa Bonato, Federica Vezzani, Giorgio Maria Di Nunzio
Opublikowane w: Semmelweis Medical Linguistics Conference 2025 Inclusivity and Diversity in Healthcare Communication Research, 2025
Wydawca: in press

Reusability of Biomedical Annotations for Gut-Brain Interplay Information Extraction as Terminological Data

Autorzy: Vanessa Bonato
Opublikowane w: MDTT 2025, 2025
Wydawca: CEUR-WS

Consumer-Centered Technology-Assisted Review: Insights and Challenges from the CLEF eHealth Tasks

Autorzy: Giorgio Maria Di Nunzio
Opublikowane w: Semmelweis Medical Linguistics Conference 2025 Inclusivity and Diversity in Healthcare Communication Research, 2025
Wydawca: in press

Reproducibility and Analysis of Scientific Dataset Recommendation Methods

Autorzy: Ornella Irrera; Matteo Lissandrini; Daniele Dell'Aglio; Gianmaria Silvello
Opublikowane w: 18th ACM Conference on Recommender Systems, 2024
Wydawca: ACM Press
DOI: 10.1145/3640457.3688071

Publishing CoreKB Facts as Nanopublications

Autorzy: Fabio Giachelle; Stefano Marchesin; Laura Menotti; Gianmaria Silvello
Opublikowane w: IRCDL 2024, 2024, ISSN 1613-0073
Wydawca: CEUR

Exploring Terminological Collocations in Biomedical Texts

Autorzy: Costa, Rute; Ramos, Margarida; Canelas, Matilde; Mouro, Ana
Opublikowane w: MDTT 2025, 2025
Wydawca: Ceur-Ws
DOI: 10.5281/ZENODO.15863151

BioASQ at CLEF2025: The Thirteenth Edition of the Large-Scale Biomedical Semantic Indexing and Question Answering Challenge

Autorzy: Anastasios Nentidis, Georgios Katsimpras, Anastasia Krithara, Martin Krallinger, Miguel Rodriguez Ortega, Natalia Loukachevitch, Andrey Sakhovskiy, Elena Tutubalina, Grigorios Tsoumakas, George Giannakoulas, Alexandra Bekiaridou, Athanasios Samaras, Giorgio Maria Di Nunzio, Nicola Ferro, Stefano Marchesin, Laura Menotti, Gianmaria Silvello, Georgios Paliouras
Opublikowane w: Lecture Notes in Computer Science, Advances in Information Retrieval, 2025
Wydawca: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-88720-8_61

Veracity Estimation for Entity-Oriented Search with Knowledge Graphs

Autorzy: Marchesin, Stefano; Silvello, Gianmaria; Alonso, Omar
Opublikowane w: CIKM 2024, 2024
Wydawca: ACM
DOI: 10.1145/3627673.3679561

FAIR Terminology Meets CLEAR Global

Autorzy: Giorgio Maria Di Nunzio, Eszter Papp, Federica Vezzani, Ellie Kemp
Opublikowane w: Lecture Notes in Computer Science, Linking Theory and Practice of Digital Libraries, 2024
Wydawca: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-72440-4_17

Fact Verification in Knowledge Graphs Using LLMs

Autorzy: Farzad Shami, Stefano Marchesin, and Gianmaria Silvello
Opublikowane w: SIGIR 2025, 2025
Wydawca: THE 48TH INTERNATIONAL ACM SIGIR CONFERENCE ON RESEARCH AND DEVELOPMENT IN INFORMATION RETRIEVAL
DOI: 10.1145/3726302.3730142

The Elephant in the Room: The Impact of Domain-Expert (Dis)agreement. A Case Study on Cryptic Species

Autorzy: Giorgio Maria Di Nunzio, Lucia Manni, Emanuela De Lisa, Federica Vezzani
Opublikowane w: MDTT 2025, 2025
Wydawca: CEUR-WS

A Marker Design for visually enhancing Local Cluster Association

Autorzy: S. Lengauer, P. Waldert, T. Schreck
Opublikowane w: IEEE VIS 2024 Bio+MedVis Challenge, 2024
Wydawca: Zenodo

OnSET: Ontology and Semantic Exploration Toolkit

Autorzy: B. Kantz, K. Innerebner, P. Waldert, S. Lengauer, E. Lex, T. Schreck
Opublikowane w: ACM SIGIR 2025 Proceedings, 2025
Wydawca: ACM

Peer reviewed articles (18)

Behavioral Clusters and Lesion Distributions in Ischemic Stroke, Based on NIHSS Similarity Network

Autorzy: Louis Fabrice Tshimanga; Andrea Zanola; Silvia Facchini; Antonio Luigi Bisogno; Lorenzo Pini; Manfredo Atzori; Maurizio Corbetta
Opublikowane w: Journal of Healthcare Informatics Research, 2023, ISSN 2509-498X
Wydawca: Journal of Healthcare Informatics Research
DOI: 10.1101/2023.11.08.23297808

BMC Bioinformatics

Autorzy: Ornella Irrera; Stefano Marchesin; Gianmaria Silvello
Opublikowane w: BMC Bioinformatics, Numer 25(112), 2024, ISSN 1471-2105
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/S12859-024-05730-9

Efficient and Reliable Estimation of Knowledge Graph Accuracy

Autorzy: Stefano Marchesin; Gianmaria Silvello
Opublikowane w: PVLDB, Numer 17(9), 2024, ISSN 2150-8097
Wydawca: VLDB Endowment
DOI: 10.14778/3665844.3665865

Changes to Average Survival of Patients With Amyotrophic Lateral Sclerosis (1995–2018)

Autorzy: Rosario Vasta, Filippo De Mattei, Salvatore Tafaro, Antonio Canosa, Umberto Manera, Maurizio Grassano, Francesca Palumbo, Sara Cabras, Enrico Matteoni, Francesca Di Pede, Grazia Zocco, Giorgio Pellegrino, Emilio Minerva, Daniela Pascariu, Barbara Iazzolino, Stefano Callegaro, Giuseppe Fuda, Paolina Salamone, Fabiola De Marchi, Letizia Mazzini, Cristina Moglia, Andrea Calvo, Adriano Chiò
Opublikowane w: Neurology, Numer 104, 2025, ISSN 0028-3878
Wydawca: Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health)
DOI: 10.1212/WNL.0000000000213467

Credible Intervals for Knowledge Graph Accuracy Estimation

Autorzy: Stefano Marchesin, Gianmaria Silvello
Opublikowane w: Proceedings of the ACM on Management of Data, Numer 3, 2025, ISSN 2836-6573
Wydawca: Association for Computing Machinery (ACM)
DOI: 10.1145/3725279

The More, the Better? Evaluating the Role of EEG Preprocessing for Deep Learning Applications

Autorzy: Federico Del Pup, Andrea Zanola, Louis Fabrice Tshimanga, Alessandra Bertoldo, Manfredo Atzori
Opublikowane w: IEEE Transactions on Neural Systems and Rehabilitation Engineering, Numer 33, 2025, ISSN 1534-4320
Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
DOI: 10.1109/TNSRE.2025.3547616

An extensible and unifying approach to retrospective clinical data modeling: the BrainTeaser Ontology

Autorzy: Guglielmo Faggioli, Laura Menotti, Stefano Marchesin, Adriano Chió, Arianna Dagliati, Mamede de Carvalho, Marta Gromicho, Umberto Manera, Eleonora Tavazzi, Giorgio Maria Di Nunzio, Gianmaria Silvello, Nicola Ferro
Opublikowane w: Journal of Biomedical Semantics, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1480
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S13326-024-00317-Y

Le rôle du référent en terminologie : enquête sur la perception du trouble dysmorphique corporel

Autorzy: Federica Vezzani; Rute Costa
Opublikowane w: Roczniki Humanistyczne, 2024, ISSN 0035-7707
Wydawca: Towarzystwo Naukowe Kul & Katolicki Uniwersytet Lubelski Jana Pawła II – Wydział Nauk Humanistycznych
DOI: 10.18290/RH24728.5

Variation in psychopathological terminology

Autorzy: Federica Vezzani, Rute Costa
Opublikowane w: Terminology. International Journal of Theoretical and Applied Numers in Specialized Communication, Terminology / International Journal of Theoretical and Applied Numers in Specialized Communication, Terminology, Numer 30, 2024, ISSN 0929-9971
Wydawca: John Benjamins Publishing Company
DOI: 10.1075/TERM.00078.VEZ

Phosphatemia is an Independent Prognostic Factor in Amyotrophic Lateral Sclerosis

Autorzy: Vasta, Rosario; Koumantakis, Emanuele; Canosa, Antonio; Manera, Umberto; Grassano, Maurizio; Palumbo, Francesca; Cabras, Sara; Matteoni, Enrico; Di Pede, Francesca; De Mattei, Filippo; Vergnano, Filippo; Mandrioli, Jessica; Simonini, Cecilia; Martinelli, Ilaria; De Marchi, Fabiola; Mazzini, Letizia; Moglia, Cristina; Calvo, Andrea; Chiò, Adriano
Opublikowane w: Annals of Neurology, 2025, ISSN 1531-8249
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/ANA.27252

When LMF and TMF meet

Autorzy: Federica Vezzani, Giorgio Maria Di Nunzio, Ana Salgado, Rute Costa
Opublikowane w: Terminology. International Journal of Theoretical and Applied Numers in Specialized Communication, Terminology / International Journal of Theoretical and Applied Numers in Specialized Communication, Terminology, Numer 31, 2025, ISSN 0929-9971
Wydawca: John Benjamins Publishing Company
DOI: 10.1075/TERM.00084.VEZ

Exploring Publicly Accessible Optical Coherence Tomography Datasets: A Comprehensive Overview

Autorzy: Anastasiia Rozhyna; Gábor Márk Somfai; Manfredo Atzori; Delia Cabrera DeBuc; Amr Saad; Jay Zoellin; Henning Müller
Opublikowane w: Diagnostics, 2024, ISSN 2075-4418
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/DIAGNOSTICS14151668

MetaTron: advancing biomedical annotation empowering relation annotation and collaboration

Autorzy: Ornella Irrera, Stefano Marchesin, Gianmaria Silvello
Opublikowane w: BMC Bioinformatics, Numer 25, 2024, ISSN 1471-2105
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S12859-024-05730-9

Toward improving reproducibility in neuroimaging deep learning studies

Autorzy: Federico Del Pup; Federico Del Pup; Federico Del Pup; Manfredo Atzori; Manfredo Atzori; Manfredo Atzori
Opublikowane w: Frontiers in Neuroscience, 2024, ISSN 1662-453X
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/FNINS.2024.1509358

SelfEEG: A Python library for Self-Supervised Learning in Electroencephalography

Autorzy: Federico Del Pup; Andrea Zanola; Louis Fabrice Tshimanga; Paolo Emilio Mazzon; Manfredo Atzori
Opublikowane w: The Journal of Open Source Software, Numer 9(95), 2024, ISSN 2475-9066
Wydawca: Journal of Open Source Software
DOI: 10.48550/arxiv.2401.05405

BIDSAlign: a library for automatic merging and preprocessing of multiple EEG repositories

Autorzy: Andrea Zanola; Federico Del Pup; Camillo Porcaro; Manfredo Atzori
Opublikowane w: Journal of Neural Engineering, 2024, ISSN 1741-2552
Wydawca: Springer
DOI: 10.1088/1741-2552/AD6A8C

The role of data partitioning on the performance of EEG-based deep learning models in supervised cross-subject analysis: A preliminary study

Autorzy: Federico Del Pup, Andrea Zanola, Louis Fabrice Tshimanga, Alessandra Bertoldo, Livio Finos, Manfredo Atzori
Opublikowane w: Computers in Biology and Medicine, Numer 196, 2025, ISSN 0010-4825
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.COMPBIOMED.2025.110608

Can We Measure the Impact of a Database?

Autorzy: Peter Buneman, Dennis Dosso, Matteo Lissandrini, Gianmaria Silvello, He Sun
Opublikowane w: Communications of the ACM, Numer 68, 2025, ISSN 0001-0782
Wydawca: Association for Computing Machinery (ACM)
DOI: 10.1145/3704723

Book chapters (1)

Content-Based Dataset Retrieval Methods: Reproducibility of the ACORDAR Test Collection

Autorzy: Laura Menotti, Manuel Barusco, Riccardo Forzan, Gianmaria Silvello
Opublikowane w: Lecture Notes in Computer Science, Linking Theory and Practice of Digital Libraries, 2024
Wydawca: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-72437-4_18