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GenomeDia: a personalized medicine tool for diabetes

Descrizione del progetto

Sottocategorizzazione dei bambini affetti da diabete con la medicina personalizzata basata sulla genetica

Il diabete nei bambini piccoli, il diabete di tipo 1, è una condizione grave che richiede iniezioni giornaliere di insulina per mantenere i livelli di glucosio nel sangue nella norma. I test genetici possono determinare la causa precisa solo in un piccolo gruppo di giovani pazienti. La maggior parte dei casi viene classificata in base al giudizio clinico. Un recente studio genetico su quasi 1 500 giovani pazienti affetti da diabete ha gettato nuova luce sulle varianti genetiche coinvolte, sviluppando approcci per definire i difetti genetici non codificanti alla base della malattia umana. Il progetto GenomeDia, finanziato dal CER, mira a sviluppare e convalidare uno strumento di medicina personalizzata basato su questa e su nuove scoperte per sottocategorizzare i giovani pazienti con diabete.

Obiettivo

Diabetes Mellitus affects nearly 600 million people worldwide. It is a major cause of premature death, blindness, end stage kidney disease, and limb amputation. However, it is not a single disease. Most patients are catalogued as type 2 diabetes, which is itself highly heterogeneous, while others have autoimmune type 1 diabetes. Genetic testing is currently able to define the precise cause of diabetes in a small group of young patients, although the categorization of diabetes subtypes is in most cases largely based on clinical judgement, rather than on specific tests. It is known, however, that the classification of diabetes subtypes has major implications for treatment. The emergence of whole genome sequencing in clinical practice provides new opportunities for classification of diabetes subtypes, but also entails major challenges such as the interpretation of non protein-coding variants. The recently funded ERC project DecodeDiabetes analyzed sequences from nearly 1500 young patients who had typical features of genetic forms of diabetes, but negative genetic tests in specialized genetic diagnostic laboratories. This study revealed different groups of genetic variants that cause diabetes in young patients with diabetes. It also developed approaches that leverage regulatory genomic knowledge to define noncoding genetic defects underlying human disease. The current proposal aims to compile new findings with existing knowledge, and to build a genetic interpretation solution to subcategorize young patients with diabetes. It will then validate this tool in patient cohorts. This proposal can thus translate fundamental knowledge derived from the ERC-funded Decode Diabetes project into applications whose valorization can bridge the gap to market and provide added value for society.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Meccanismo di finanziamento

HORIZON-ERC-POC -

Istituzione ospitante

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Contributo netto dell'UE
€ 150 000,00
Indirizzo
CARRER DOCTOR AIGUADER 88
08003 Barcelona
Spagna

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Regione
Este Cataluña Barcelona
Tipo di attività
Organizzazioni di ricerca
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato

Beneficiari (1)