Projektbeschreibung
Die Genexpression bei Parasiten entschlüsseln
Kinetoplastiden sind einzellige eukaryotische Parasiten, die Erkrankungen wie Schlafkrankheit, Chagas-Krankheit und Leishmaniose verursachen. Sie weisen ein einzigartiges Genexpressionsmuster auf und produzieren lange RNA-Ketten aus mehreren Genen, die danach zu einzelnen mRNAs verarbeitet werden. Im Rahmen des ERC-finanzierten Projekts TranSplice soll dieser Prozess, der als SL-Trans-Spleißen bezeichnet wird, ergründet werden. Das Forschungsteam wird Verfahren wie Kryo-Elektronenmikroskopie und Genomeditierung einsetzen, um den Mechanismus des SL-Trans-Spleißens zu entschlüsseln. Neben grundlegenden Erkenntnissen werden die Projektergebnisse neue Wirkstoffziele aufdecken und den Weg für neue Therapien gegen kinetoplastidbedingte Erkrankungen ebnen.
Ziel
Kinetoplastids are unicellular eukaryotic parasites responsible for severe human pathologies, such as sleeping sickness, Chagas disease and leishmaniasis. Kinetoplastids have diverged early during evolution and harbor many intriguing cellular and molecular peculiarities. Among these is their remarkably streamlined nuclear genome characterized by a high gene density and significantly divergent and specialized gene expression systems. A main example of such divergence is the polycistronic transcription of all their genes producing long messenger RNA precursors (pre-mRNAs) containing tens to hundreds of coding sequences. These pre-mRNAs are dissected into monocistronic mRNAs by SL trans-splicing, a process during which a spliced leader (SL) RNA is intermolecularly fused to the 5’end of all mRNAs by the trans-spliceosome. Although this machinery is essential for gene expression, the lack of structural information and the high divergence of its RNA and protein elements have hindered a mechanistic understanding of how kinetoplastids employ SL trans-splicing to generate their entire mRNA transcriptome. Here, we will use innovative approaches to provide the structural and mechanistic basis of SL trans-splicing in kinetoplastids by using cutting-edge structural biology techniques and state-of-the-art genetic and in silico tools. By combining genome editing, purification of endogenous trans-splicing machineries, high-resolution cryo-electron microscopy, AI-based interactome approaches, and novel in vivo assays, we will reveal the mechanism of SL snRNP biogenesis, the molecular basis for SL snRNP intermolecular recognition and activation by the trans-spliceosome, and the central mechanism of trans-splicing orchestrated by the highly divergent kinetoplastids trans-spliceosome. The outcome of this research will transform our understanding of RNA trans-splicing in eukaryotes and will pave the way for developing new drugs that specifically target this unique and essential pathway.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften Optik Mikroskopie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS Transkriptome
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Pathologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2024-STG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
4000 LIEGE
Belgien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.