Descrizione del progetto
Decifrare l’espressione genica nei parassiti
I cinetoplastidi, parassiti eucarioti unicellulari che causano patologie come la malattia del sonno, la malattia di Chagas e la leishmaniosi, presentano un modello di espressione genica unico che produce lunghe catene di RNA da più geni, successivamente trasformati in singoli mRNA. Il progetto TranSplice, finanziato dal CER, si prefigge di far luce su questo processo, noto come trans-splicing SL. Il team di ricerca impiegherà tecniche come la microscopia crioelettronica e l’editing del genoma al fine di delineare il meccanismo alla base del trans-splicing SL, offrendo risultati che forniranno conoscenze fondamentali e consentiranno di svelare nuovi bersagli farmacologici, aprendo la strada a nuove terapie per curare le malattie legate ai cinetoplastidi.
Obiettivo
Kinetoplastids are unicellular eukaryotic parasites responsible for severe human pathologies, such as sleeping sickness, Chagas disease and leishmaniasis. Kinetoplastids have diverged early during evolution and harbor many intriguing cellular and molecular peculiarities. Among these is their remarkably streamlined nuclear genome characterized by a high gene density and significantly divergent and specialized gene expression systems. A main example of such divergence is the polycistronic transcription of all their genes producing long messenger RNA precursors (pre-mRNAs) containing tens to hundreds of coding sequences. These pre-mRNAs are dissected into monocistronic mRNAs by SL trans-splicing, a process during which a spliced leader (SL) RNA is intermolecularly fused to the 5’end of all mRNAs by the trans-spliceosome. Although this machinery is essential for gene expression, the lack of structural information and the high divergence of its RNA and protein elements have hindered a mechanistic understanding of how kinetoplastids employ SL trans-splicing to generate their entire mRNA transcriptome. Here, we will use innovative approaches to provide the structural and mechanistic basis of SL trans-splicing in kinetoplastids by using cutting-edge structural biology techniques and state-of-the-art genetic and in silico tools. By combining genome editing, purification of endogenous trans-splicing machineries, high-resolution cryo-electron microscopy, AI-based interactome approaches, and novel in vivo assays, we will reveal the mechanism of SL snRNP biogenesis, the molecular basis for SL snRNP intermolecular recognition and activation by the trans-spliceosome, and the central mechanism of trans-splicing orchestrated by the highly divergent kinetoplastids trans-spliceosome. The outcome of this research will transform our understanding of RNA trans-splicing in eukaryotes and will pave the way for developing new drugs that specifically target this unique and essential pathway.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze fisiche ottica microscopia
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA trascrittomi
- scienze mediche e della salute medicina di base patologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2024-STG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
4000 LIEGE
Belgio
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.