Opis projektu
Badanie biegunowości komórek podczas ewolucji
Komórki funkcjonują dzięki skomplikowanym mechanizmom, w ramach których białka wykonują podstawowe zadania, wchodząc ze sobą w interakcje. Co zaskakujące, blisko spokrewnionym gatunkom może brakować głównych białek, a mimo to mogą zachować podstawowe funkcje komórkowe. Badania wskazują, że drożdże są w stanie dostosować się do sytuacji utraty kluczowego białka poprzez eliminację innych białek, przywracając w ten sposób biegunowość komórek i wpływając na wiele procesów biologicznych. Zespół finansowanego przez Europejską Radę ds. Badań Naukowych projektu PolarRobustness zamierza zbadać ewoluujące sieci biegunowości u pączkujących drożdży. Analiza zmiany w liczbie kopii białek, modyfikacji potranslacyjnych i samoorganizacji posłuży do wyjaśnienia, w jaki sposób biegunowość komórkowa pozostaje stabilna w procesie ewolucji. Zespół wykona analizę komórkową w wykorzystaniem sekwencjonowania transpozonów, oceni stabilność biegunowości za pomocą mikroskopii przyżyciowej, a także przeprowadzi badanie ekspresji genów i interakcji białek przy użyciu spektrometrii mas.
Cel
Cells are often viewed as intricate machines, in which specific proteins work together in a tightly coordinated fashion to give rise to cellular functions. Surprisingly however, some proteins that are essential for core cellular functions in one species are absent in closely related species, while the core function itself is maintained. How this robustness is achieved, while the underlying molecular networks dramatically diversify during evolution is currently not understood. As a post-doc I showed that the polarity network in yeast can evolutionarily adapt to the loss of an important protein by losing three more proteins. My lab showed that these losses repair polarity through a collective adaptive response, affecting many cellular processes rather than only a few proteins. How do intricate cellular networks collectively achieve such evolutionary robustness?
We will address this question with a library of experimentally evolved polarity networks in budding yeast to (1) investigate how general a collective adaptive response is, (2) examine which spatiotemporal aspects of polarity establishment are evolutionary robust, (3) determine how changes in (i) protein copy-numbers, (ii) post-translational modifications (PTMs), and (iii) buffering by self-organization, contribute to evolutionary robustness, and (4) dissect the molecular mechanisms. We will use transposon sequencing to identify the cellular processes involved, live cell microscopy to compare the robustness of various aspects of polarity, and mass spectrometry to compare changes in gene expression, PTMs and interaction partners. We will use multiscale simulations, rooted in statistical physics and constrained by our experimental results, to dissect how molecular changes propagate through the polarity network to achieve evolutionary robustness.
Our approach will go beyond yeast polarity, because it can be applied to any functional protein network to deepen our understanding of how life works and evolves.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka mikroskopia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2024-COG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
2628 CN Delft
Niderlandy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.