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Epigenetic editing to unravel the causal function of Marks of Active Chromatin: a quantitative and mechanistic dissection

Projektbeschreibung

Quantitative und mechanistische Einblicke in die kausalen Funktionsweisen aktiver Chromatinmarkierungen

Chromatinmodifikationen sind von entscheidender Bedeutung für Transkriptionsprogramme, die die Entwicklung und die zelluläre Identität unterstützen. Die kausalen Funktionsweisen und Mechanismen von Chromatinmarkierungen bei der Genregulation sind jedoch noch nicht gut verstanden. Unterstützt über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahme beabsichtigt das Projekt MAChro, die kausalen Rollen wichtiger aktiver Chromatinmarkierungen auf mechanistischer und quantitativer Ebene systematisch zu untersuchen. Unter Verwendung eines neuartigen Epigenom-Editierungs-Werkzeugs wird es die Ablagerung lokusspezifischer aktiver Markierungen direkt mit Transkriptionsreaktionen verknüpfen. Dieses Werkzeug wird dann mit unvoreingenommenen genomweiten CRISPR-Screens kombiniert, um systematisch die molekularen Mechanismen aufzudecken, mit denen die Funktionsweise der aktiven Markierungen entschlüsselt werden. Schließlich werden die quantitativen Auswirkungen dieser Markierungen auf die Transkription mithilfe einer anpassbaren epigenetischen Editierungs-Plattform analysiert.

Ziel

Chromatin modifications are essential for the transcriptional programmes underpinning development and cellular identity. However, an understanding of the causal function(s) of chromatin marks in gene regulation has lagged behind. Particularly, whether chromatin modifications linked with active transcription (active marks) have a causal function remains intensely debated, while the underlying mechanisms are poorly understood. This is due to technical limitations in the ability to precisely perturb chromatin marks in a locus-targeted manner. In this project, I will leverage cutting-edge (epi)genomic tools to systematically dissect the causal roles of key active chromatin marks—H3K4me3, H3/H4ac, and H3K79me2—, at a mechanistic and quantitative level. To directly link locus-specific active mark deposition to transcriptional responses, I will employ a novel epigenome editing technology that allows precise and targeted deposition of chromatin marks. By combining this advanced tool with unbiased genome-wide CRISPR screens using the orthogonal enCas12a system, I will systematically uncover the molecular mechanisms that decode the function of active marks. Additionally, I will dissect the quantitative effects of these marks on transcription at the single-cell level using a tunable epigenetic editing platform. If successful, this proposal will provide unprecedented mechanistic insights into the role of active chromatin marks, paving the way to new therapeutic strategies that harness precise epigenetic control of gene expression.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.

Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 209 483,28
Adresse
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Deutschland

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Region
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0