Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Epigenetic editing to unravel the causal function of Marks of Active Chromatin: a quantitative and mechanistic dissection

Opis projektu

Ilościowe i mechanistyczne badania funkcji przyczynowych aktywnych znaczników chromatynowych

Modyfikacje chromatyny są nieodzowne z punktu widzenia programów transkrypcyjnych, które wspierają rozwój komórek i wpływają na ich tożsamość. Funkcje przyczynowe i mechanizmy znaczników chromatynowych występujące w procesach regulacji genów nie zostały dotychczas dobrze poznane. Zespół finansowanego ze środków działania „Maria Skłodowska-Curie” projektu MAChro stawia sobie za cel metodyczne zbadanie przyczynowej roli kluczowych aktywnych znaczników chromatynowych na poziomie mechanistycznym i ilościowym. Korzystając z nowego narzędzia do edycji epigenomu, badacze połączą specyficzne dla danego miejsca odkładanie aktywnych znaczników z odpowiedziami transkrypcyjnymi. Następnie wykorzystają narzędzie równolegle z badaniami CRISPR obejmującymi cały genom, aby systematycznie ujawniać mechanizmy molekularne, które dekodują funkcję aktywnych znaczników. Na koniec przeprowadzą analizę ilościowych efektów tych znaczników na transkrypcję przy użyciu konfigurowalnej platformy edycji epigenetycznej.

Cel

Chromatin modifications are essential for the transcriptional programmes underpinning development and cellular identity. However, an understanding of the causal function(s) of chromatin marks in gene regulation has lagged behind. Particularly, whether chromatin modifications linked with active transcription (active marks) have a causal function remains intensely debated, while the underlying mechanisms are poorly understood. This is due to technical limitations in the ability to precisely perturb chromatin marks in a locus-targeted manner. In this project, I will leverage cutting-edge (epi)genomic tools to systematically dissect the causal roles of key active chromatin marks—H3K4me3, H3/H4ac, and H3K79me2—, at a mechanistic and quantitative level. To directly link locus-specific active mark deposition to transcriptional responses, I will employ a novel epigenome editing technology that allows precise and targeted deposition of chromatin marks. By combining this advanced tool with unbiased genome-wide CRISPR screens using the orthogonal enCas12a system, I will systematically uncover the molecular mechanisms that decode the function of active marks. Additionally, I will dissect the quantitative effects of these marks on transcription at the single-cell level using a tunable epigenetic editing platform. If successful, this proposal will provide unprecedented mechanistic insights into the role of active chromatin marks, paving the way to new therapeutic strategies that harness precise epigenetic control of gene expression.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Wkład UE netto
€ 209 483,28
Koszt całkowity
Brak danych