Opis projektu
Wykorzystywanie ukrytych produktów naturalnych w mikrobiologicznej ciemnej materii
Ze względu na fakt, że bakterii nie rozwija się w warunkach laboratoryjnych, ogromny świat „mikrobiologicznej ciemnej materii” pozostaje niemożliwy do zbadania. To ogranicza nasze możliwości odkrywania leków i rozwiązań biotechnologicznych nowej generacji. Zespół finansowanego ze środków działania „Maria Skłodowska-Curie” projektu NewRiPPMaturases koncentruje się na peptydach syntetyzowanych przez rybosomy i modyfikowanych potranslacyjnie. W ramach projektu zespół połączy metody eksploracji bioinformatycznej w celu znalezienia nowych klastrów genów z ekspresją heterologiczną w celu wytworzenia tych związków. W ramach projektu powstanie mapa tej nieznanej przestrzeni genetycznej. Przeprowadzone badania biochemiczne wyjaśnią, w jaki sposób niezwykłe enzymy biosyntezy (maturazy RiPP) wpływają na ten proces, otwierając dostęp do nowych narzędzi biologicznych.
Cel
Studying secondary metabolites from bacterial sources has provided us with many essential medicines and biotechnologically valuable enzymes that construct these highly complex molecules. However, only a handful of talented, chemically rich bacterial producer taxa are the source of these compounds. Identifying new talented producers has been hampered by the as-yet unculturable nature of most bacteria, thus exploring this ‘microbial dark matter’ to identify new bioactive compounds and enzymology is an outstanding challenge.
The Piel lab, in collaboration with several other research groups across several studies, has recently identified a vast number of new and chemically rich and diverse BGCs from 'Entotheonella' and Acidobacteria that are sponge and coral symbionts, respectively. These producers contain a plethora of unusual, putative biosynthetic gene clusters (BGCs) for ribosomally-synthesised post-translationally modified peptides (RiPPs). These are a largely untapped natural product superfamily, found in all domains of life, that feature unprecedented enzymology to generate highly modified and structurally complex bioactive peptide products with numerous indications. Biochemical studies into RiPPs, in particular from 'Entotheonella', has identified RiPP maturases with both previously unknown mechanisms and biotechnological applications, thus highlighting the potential of investigating RiPP pathways from microbial dark matter.
NewRiPPMaturases will explore the RiPP BGCs from 'Entotheonella' and Acidobacteria, a fraction of which have only been previously studied, to expand the repertoire of RiPP natural products and RiPP maturase biochemistry. This will be achieved using a combination of bioinformatic workflows for identifying unusual RiPP gene clusters with high confidence, characterisation of RiPP compounds produced using heterologous expression, and biochemical studies into the substrate profile and mechanism of the unusual RiPP maturases.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez człowieka.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez człowieka.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
8092 Zuerich
Szwajcaria
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.