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Targeting mRNA Structure to Control Translation with Small Molecules

Descrizione del progetto

L’RNA messaggero come bersaglio terapeutico

Sebbene la maggior parte dei medicinali agisca legandosi alle proteine, molte proteine coinvolte nelle malattie rimangono difficili o impossibili da colpire direttamente. Gli RNA messaggeri (mRNA) , ossia gli intermedi molecolari che trasmettono le istruzioni dal DNA per la produzione delle proteine, rappresentano un’alternativa vasta e in gran parte inesplorata. Le piccole molecole che si legano a regioni strutturate all’interno degli mRNA potrebbero modulare la produzione proteica senza interferire con la proteina stessa. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto TranStructRx svilupperà un quadro razionale per l’identificazione di motivi strutturali bersagliabili negli mRNA rilevanti per le malattie. Ciò contribuirà inoltre a migliorare la comprensione di come il legame delle piccole molecole si traduca in esiti biologici funzionali. Il progetto punta a sbloccare il potenziale degli mRNA come nuova classe di bersagli farmacologici e ad aprire nuove strade terapeutiche per malattie attualmente non trattabili con farmaci.

Obiettivo

mRNAs represent a vast and underexploited space for drug discovery. As direct regulators of protein synthesis, they provide a direct conduit to function. Current efforts to target RNAs in cells with small molecules often fail to robustly yield function in a predictable manner and usually need to be tailored on a target basis. A major reason is that most approaches prioritize binding affinity over biological outcome assuming, by analogy to proteins, that tighter binding necessarily induces greater efficacy. Yet for RNA, functional output depends more on structural context, temporal accessibility, and interaction dynamics than on affinity alone.
This proposal aims to discover structured, ligandable motifs in messenger RNAs (mRNAs) and to decode the mechanistic principles by which small-molecule binding can alter mRNA function. Because mRNAs control protein output directly, they offer a unique opportunity to modulate disease-relevant pathways, especially in cancers and intractable proteins. Recent unpublished work I conducted on targeting the ABL1 mRNA demonstrates this concept. We identified a functional structured element in the coding sequence of ABL1 through data-guided computational modeling. The motif we uncovered is responsive to small-molecule binding in cells. We aim to expand to other mRNAs and discover general, transferable routes to modulate translation via RNA structure.
Specifically, we will focus on three interconnected aims: (1) to discover functional, structured and targetable motifs in key mRNAs, (2) to understand how small-molecule binding can be transformed into biological function, (3) to elaborate a high-throughput screening platform to efficiently explore the functional RNA-ligand chemical landscape. Establishing a rational, generalizable framework for mRNA-targeted small molecules would open new therapeutic avenues, especially for currently undruggable and orphan disease targets.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinatore

INSTITUT CURIE
Contributo netto dell'UE
€ 242 260,56
Indirizzo
RUE D ULM 26
75231 Paris
Francia
Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato

Partner (1)