Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Establishing an atlas of LAD morphologies and its relationship with cellular function

Opis projektu

Spostrzeżenia na temat kształtu genomu

Trójwymiarowa organizacja DNA ma kluczowe znaczenie dla aktywności genów, tożsamości komórek i reakcji na stres. Coraz więcej dowodów podkreśla rolę domen związanych z laminami (LAD) – regionów nieaktywnego DNA przyłączonych do błony jądrowej, które pomagają w organizacji genomu. Zaburzenie tych struktur może prowadzić do starzenia się organizmu i nowotworów. Projekt MorphoLADs, realizowany przy wsparciu programu działania „Maria Skłodowska-Curie”, ma na celu stworzenie atlasu kształtów LAD w trakcie rozwoju. Naukowcy wykorzystają nicienie Caenorhabditis elegans jako organizm modelowy do zbadania, w jaki sposób wzorce LAD różnią się między typami komórek, wykorzystując w tym celu zaawansowaną mikroskopię, sztuczną inteligencję i narzędzia mapowania molekularnego. Wyniki projektu pozwolą na określenie wpływu różnic we wzorcach LAD na funkcję, ujawniając nowe zasady organizacji genomu i związanego z tym zdrowia.

Cel

The three-dimensional organization of the genome is emerging as a critical regulator of nuclear functions. But we are only beginning to define the diverse nuclear morphologies of different cell types and understand their cell-specific functions. To address this issue, I will focus on Lamina-Associated Domains (LAD), which are large heterochromatic domains anchored to the nuclear lamina. LADs help partition silent heterochromatin from active euchromatin enabling the tridimensional organization of the genome. These domains are crucial for gene silencing, cell signaling, and protecting DNA from UV damage, and their loss often leads to cellular dysfunction, for example in cancer or aging. Studies have shown that LAD morphologies vary considerably in different cell types. I propose to leverage the stereotyped development of C. elegans to generate an atlas of LAD morphologies through embryogenesis. In Aim 1, I will use an automated cell identification AI-based algorithm (ceSCALE, recently developed in the Mango lab) coupled with super-resolution microscopy to extract temporally evolving heterochromatin features across time and space, with a special focus on lamina-associated heterochromatin. I will complement this by defining cell-specific components near the lamina (TurboID, DamID) to uncover some of the governing rules that dictate the formation of specific LAD morphologies. In Aim 2, I will focus on a specific cell type that our preliminary data show contains unusual LADs: gut cells. I will relocate heterochromatin to the nuclear periphery of gut cells through ectopic tethering to determine whether changing gut LAD morphology affects its function. I hypothesize that the almost complete localization of heterochromatin in the interior of the nucleus of gut cells enables effective nuclear export and appropriated response to environmental cues. Altogether, MorphoLADs will define cell-specific LAD morphologies and open an avenue to explore their cellular functions.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

UNIVERSITAT BASEL
Wkład UE netto
€ 292 118,88
Koszt całkowity
Brak danych