Obiettivo
Protein dynamics is essentially linked to protein function, aggregation, and folding. Time-resolved spectroscopy is specially suited to reveal these dynamics, counterbalancing the static pure-structural information provided by X-ray crystallographic structures. In equilibrium, protein conformation fluctuates, eventually visiting all possible higher-energy states in equilibrium with the ground state conformation. For soluble proteins the dynamics of such fluctuations have been successfully detected and characterized by hydrogen/deuterium exchange (HDX) combined with NMR spectroscopy. However, experimental limitations of NMR spectroscopy have precluded a similar level of understanding of the dynamics of membrane proteins. Proteins dynamics manifest themselves also when a fast perturbation is applied, such as when a laser pulse is applied to proteins with photocycles. Both in HDX and in perturbation experiments the time-resolved response of the system is a multi-exponential relaxation process. However, the relevant information to characterize and understand the protein dynamics is not the relaxation process itself, but the number, value, and nature (discrete/distributed) of the rate constants of the relaxation process. In this project our first goal is the improvement, development and application of maximum entropy and Bayesian methods to analyze the multi-exponential data arising in the HDX of membrane proteins, and in the photocycles of membrane proteins. Simultaneously, we will implement new experimental approaches of HDX to obtain dynamics information of membrane proteins by infrared spectroscopy, and apply them to at least three membrane protein systems: the melibiose transporter, bacteriorhodopsin, and a G-protein coupled receptor chimera. The combined success of both interdisciplinary goals should provide unique and fundamental information for a better understanding of membrane protein dynamics.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/it/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/it/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- scienze naturali matematica matematica applicata statistica e probabilità statistica bayesiana
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze fisiche ottica spettroscopia spettroscopia di assorbimento
- scienze naturali scienze fisiche ottica fisica dei laser
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-IRG-2008
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
08193 Cerdanyola Del Valles
Spagna
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.