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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Mechanisms of retrotransposition in humans and consequences on cancer genomic plasticity

Obiettivo

Retrotransposons are a class of highly repetitive sequences, which are very abundant in the human genome. They disperse by an RNA-based copy-and-paste mechanism, called retrotransposition. This process can drive profound genome rearrangements. Although generally silent, they are expressed in germ cells, in the early embryo, and in embryonic stem cells, which occasionally results in genetic diseases. Retrotransposons are also massively re-expressed in the large majority of cancers, but the importance and consequences of retrotransposition in human tumors have been poorly studied. Somatic retrotransposition is difficult to track in human tissue due to the highly repetitive and dispersed nature of these elements. Thus the questions we wish to address in this research proposal are the following: (i) What cellular pathways control retrotransposon copy number? This will be achieved by combining functional genomics and proteomics approaches to identify positive and negative regulators of retrotransposition in humans. (ii) What are the molecular mechanisms of retrotransposons replication? To answer this question, we will develop a cell-free assay that will contain the complete retrotransposition machinery. (iii) How retrotransposons participate in the normal and pathological remodeling of the human genome? To this purpose we are currently developing innovative approaches to track retrotransposition events in clinical samples, especially in tumor samples. Since LINE-1 elements (L1) are the most active and autonomous retroelements in our genome, we focus, at the moment, our investigations on this family. Understanding how the activity of retrotransposons is controlled will impact our knowledge of the mechanisms that lead to new genetic diseases or to cancer progression. Since mobile genetic elements are becoming important tools in insertional mutagenesis or gene-transfer technologies in mammals, our work should also help to improve their use in mammalian functional genomics.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2009-StG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Istituzione ospitante

INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE
Contributo UE
€ 1 874 000,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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