Cel
Cytosine methylation of CpG dinucleotide sequence is an epigenetic mark on the DNA that regulates gene expression, chromatin structure, and genome stability. Patterns of DNA methylation propagate with fidelity greater than 99% and their stable inheritance for more than 80 cell divisions. This robustness is essential as evidenced by the observation that cancer cells commonly exhibit aberrant methylation patterns. Inheritance and maintenance of methylation patterns are mediated by Dnmt1 during chromosome replication and repair. A crucial step in this process is the ability to distinguish hemi-methylated from either unmethylated or symmetrically di-methylated CpG sequences. Recently, it was shown that the protein UHRF1 recruits Dnmt1 to hemi-methylated CpG sites. The interaction between UHRF1 and hemi-methylated DNA involves the flipping of the methylcytosine out of the DNA helix as revealed by three different crystal structures. Using molecular dynamics simulations, the proposed research is aimed at answering the following questions: (I) What is the energetic basis that allows UHRF1 to discriminate between binding to hemi-methylated DNA versus binding to unmethylated or symmetrically di-methylated DNA? In particular, a disfavored binding to unmethylated DNA can arise due to a cavity at the location of the 'missing' methyl group. Half of the atoms surrounding this cavity are hydrophilic with potential of forming hydrogen bonds. Whether this space is taken up by a water molecule or whether it is 'dry' and the consequences on the UHRF1-DNA binding constant, will be investigated. (II) What is the flip-out mechanism of hemi-methylated methylcytosine? Does UHRF1 play an active role in the flipping event? The process of methylating the target cytosine on the complementary strand by Dnmt1 also involves base flipping. How does the flipped methylcytosine, interacting with UHRF1, influence the barrier and propensity for flipping the target cytosine to be methylated?
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- inżynieria i technologia inżynieria materiałowa kryształy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka chromosomy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP7-PEOPLE-2009-RG
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
48940 LEIOA
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.