Obiettivo
Mutations are the source of genetic variation in natural populations, provide material for molecular evolution and, importantly, cause human genetic diseases. Yet the mechanisms of mutagenesis are, to date, not completely understood. Low mutation frequencies limit direct observations in wet-lab experiments. However, hundreds of resequenced human genomes (including cancerous samples) and hundreds of completely sequenced genomes of other species are accumulating at a growing pace. Thus, bioinformatic analyses of mutations are becoming feasible. It is known that mutation rates fluctuate greatly from locus to locus in mammalian genomes, and that the rates of some mutation types co-vary regionally. The causes of this variation and co-variation remain largely unexplored, and deciphering them computationally is expected to unravel the intricacies of mutagenesis. Compared with wet-lab experiments, computational analyses enable us to study mutations in their native genomic environment and on a whole-genome scale. Here we propose to utilize human resequencing data in conjunction with completely sequenced mammalian genomes in order to study regional (primarily intrachromosomal) variation and co-variation in rates of different mutation types. Additionally, we will perform comparisons between cancerous and non-cancerous mutations, highlighting the unique features of mutations associated with cancer. Several statistical multivariate and multi-scale techniques will be utilized. The proposed research will advance our understanding of mutagenesis, including the unique aspects of mutagenesis during cancer. Additionally, it will provide information vital for improving models of the evolutionary process, alignment algorithms, and algorithms for the prediction of functional elements. The tools developed here are expected to bridge interdisciplinary differences in concepts and data between biology and statistics, as well as between bioinformatics and experimental biochemistry.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica
- scienze naturali scienze biologiche biologia evoluzionistica
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
- scienze naturali scienze biologiche biologia molecolare evoluzione molecolare
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2010-IIF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
69622 Villeurbanne Cedex
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.