Ziel
The nuclear pore complex (NPC) is one of the most intricate multi-protein assemblies found in eukaryotic cells encompassing ~30 different components called nucleoporins (Nups). The structural determination of the NPC represents a major challenge due to its size and location in the nuclear envelope. Accurate quantitative data on NPC composition that are required to generate structural models at atomic resolution are currently lacking. Here, I propose to apply targeted mass spectrometry to study the stoichiometry and intracellular distribution of the human NPC components. For this purpose, I will establish an assay based on selected reaction monitoring (SRM) experiments that will allow the absolute quantitation of Nups in different cell compartments. The assay will be used to systematically analyze the effect of Nup perturbation on NPC composition by screening cell lines where single Nups are depleted by gene silencing. The compositional analysis of the gene silencing phenotypes will provide the base for complementary structural investigations performed using cryo-electron tomography. The integration of proteomic and structural data will provide accurate information on the stoichiometry and spatial arrangement of Nups within NPCs. In addition, by mapping the intracellular distribution of Nups, it will be possible to gain insights into their functional roles beyond transport. The multidisciplinary approach that will be developed has the potential to pave the way towards the integration of quantitative proteomic technologies in structural studies of other cellular substructures. This fellowship will give me the opportunity to lead an ambitious project at the interface between proteomics and structural biology, and to work in a collaborative interdisciplinary environment. The scientific and complementary skills I will acquire and the opportunity to work in a leading European institution will be fundamental for my development towards an independent scientific career.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2010-IEF
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
69117 Heidelberg
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.