Ziel
Antigenic variation is a common strategy utilized by intracellular pathogens to evade immune detection. Plasmodium falciparum, the causal agent of the most lethal form of malaria, modulates antigenic variation of the ~60 member 'var' virulence gene family by exhibiting mutually exclusive, monoallelic expression. This is achieved by spatially and epigenetically regulating var transcription such that silent var loci cluster at the nuclear periphery and are associated with nucleosomes modified by silencing epigenetic marks such as hypoacetylation and trimethylation of histone 3 lysine 9. However, the exact mechanism of clustering and placement of histone marks at var genes is poorly understood. The recent identification of the novel DNA- and RNA-binding protein family PfAlba in P. falciparum may provide new insights into these mechanisms. The PfAlbas bind to DNA and RNA in vitro, and localize to either the nuclear periphery or the parasite cytoplasm in a stage-dependent manner during intra-erythrocytic development. We therefore postulate a role for these proteins in var regulation and more generally, in chromatin biology and RNA metabolism. To determine this, we propose to: (1) Analyze the genome-wide localization of the PfAlbas using CHIP-seq and qPCR assays, (2) Identify PfAlba RNA substrates using in vitro and in vivo techniques such as SNAAP and iCLIP, and (3) Examine the effect of PfAlba knockdown on var regulation and RNA metabolism by qPCR assays and RNA-seq, respectively. The research will take place in Dr. Artur Scherf's laboratory at Insitut Pasteur, Paris. The host has the technological know-how to perform the assays described in this proposal while the fellow has the biochemical and genetic skills required to successfully achieve the goals. Overall, this study will result in the transfer of knowledge from the US to Europe and simultaneously train the fellow to become an independent researcher.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Gesundheitswissenschaften Infektionskrankheit Malaria
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2011-IIF
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
75724 Paris
Frankreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.