Objectif
Ribosomes, large and dynamic particles made of RNA and proteins, are amongst the most complex macromolecular machines known to man. High resolution tools have provided exciting views of the ribosome structure. Revealing dynamics of ribosomal complexes in solution, however, has so far been challenging due to the restricted stability and homogeneity of ribosomes. A set of new tools developed by the Rappsilber lab, partly by me over the last few months, changes dramatically the feasibility of investigating ribosome dynamics. I aim to use these new mass spectrometry-based technologies to determine accurate sites and changes in yield of cross-linking between proteins and between RNA and proteins. Thereby, using protein-protein and RNA-protein cross-linking/mass spectrometry approaches, I aim to answer:
1. Is the final and rate-limiting step in the biogenesis of 50S ribosomal subunits a conformational rearrangement? This will prepare the subsequent analysis of the other steps during the biogenesis of ribosomes in E. coli and in future also in the eukaryote S. cerevisiae.
2. How does the structure and extra-ribosomal protein content of translating ribosomes change in response to different stress conditions? This will complement electron microscopy data and lead into the analysis of how translation links to virulence in pathogenic bacteria.
My project will showcase the potential of cross-linking/mass spectrometry for the study of ribonucleoprotein complexes and, indeed, for protein-nucleotide interactions in general, i.e. encompass DNA-protein interactions. Furthermore, results of this study may facilitate the development of next-generation antibacterial drugs, targeting assembly factors and conformational rearrangements during ribosome biogenesis. For my academic career, acquiring knowledge in cutting edge proteomics approaches will be a stepping stone and further strengthen my role as gatekeeper of proteomics knowledge and a catalyst of biological sciences in Estonia.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie electron microscopy
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Nous sommes désolés... Une erreur inattendue s’est produite.
Vous devez être authentifié. Votre session a peut-être expiré.
Merci pour votre retour d'information. Vous recevrez bientôt un courriel confirmant la soumission. Si vous avez choisi d'être informé de l'état de la déclaration, vous serez également contacté lorsque celui-ci évoluera.
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IEF
Voir d’autres projets de cet appel
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
EH8 9YL Edinburgh
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.