Obiettivo
Rhomboids are widely conserved intramembrane proteases. They are known to control important biological processes in model insect, worm, yeast and protozoan species, but their functions in most organisms including mammals and bacteria are unknown. The key to the understanding of rhomboid functions are their natural substrates, but it has been unclear how these are selected and recognized and methods for substrate identification have been lacking, which is limiting progress in the field.
The core of this proposal aims to discover the biological roles of highly conserved rhomboids by identifying their natural substrates using a combination of advanced substrate specificity analysis, quantitative proteomics and genetics. I will initially focus on representative conserved bacterial rhomboids and identify their substrate repertoire using an in vitro biochemical screen. Subsequent biochemical and genetic analysis in vivo will reveal the biology of the substrates and rhomboids and indicate functions of their orthologues in pathogens. Enzymatic analysis of the identified substrates will elucidate rhomboid specificity and help us solve the three dimensional structure of a rhomboid substrate complex. In a complementary approach, I will use quantitative proteomics to identify substrate repertoire and elucidate substrate specificity of mammalian endoplasmic reticulum (ER) localised rhomboid RHBDL4, which will enable me to understand its biological role in ER-stress-induced cell death, indicated by preliminary experiments.
This project will yield novel biological insights, provide a platform for rhomboid substrate discovery applicable to other biological contexts including pathogens, and provide a deep mechanistic and structural insight into rhomboid protease function, which will help us design new effective rhomboid inhibitors that are needed as experimental tools and have medical potential.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/it/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- scienze naturali scienze biologiche genetica
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia batteriologia
- scienze naturali scienze biologiche zoologia entomologia
- scienze naturali scienze biologiche zoologia mammologia
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2011-CIG
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinatore
16610 Praha 6
Cechia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.