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Contenuto archiviato il 2024-05-28

Genetic mapping of complex trait intermediates

Obiettivo

Many important traits are heritable, and have a strong genetic component. Numerous genome-wide association studies of common human diseases have corroborated that no single gene explains all or even a large part of their heritable variability. Each effect of a single locus genotype on such a global trait has to be mediated by cellular, tissue, and organ phenotypes. Thus, genetics of intermediate cellular traits is central to developing an understanding of the genetic basis of complex traits. Studies in model organisms, where causality can be addressed by reverse genetic tools, are required for mechanistic understanding of these phenotypes.

We aim to develop most powerful ways to understand the mechanism of moderate effect genetic variants in yeast Saccharomyces cerevisiae. The effect of genetic variation is via protein sequence, level, and localisation, as well as metabolite concentrations. Thus, we seek to assay all these traits on large scale to trace the effect of alleles contributing to a global complex fitness phenotype. The measurements will be made from very large pools of genetically diverse individuals using cutting edge assays, measuring either population average in low throughput, or many individuals in medium throughput. We will then compare genetically adapted and reference populations to understand which traits underlie the complex fitness, how the alleles that have moderate effects on the global trait contribute, and where potential targets for modulation lie.

This project combines state of the art cellular assays with leading methods for genetic mapping to understand mechanisms behind complex traits. The intermediate traits have not been mapped with high power thus far in any organism. The project will result in a researcher trained at the intersection of quantitative analysis and experimental genomics, and deliver methods for understanding mechanism of alleles with small effect sizes, for both of which there is an acute need.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2012-IOF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IOF - International Outgoing Fellowships (IOF)

Coordinatore

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Contributo UE
€ 167 249,02
Indirizzo
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Germania

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Regione
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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