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Contenuto archiviato il 2024-05-27

HumanRib: metal ion binding - stucture - function relations of the human CPEB3 ribozyme

Obiettivo

Until recently, ribozymes (enzymes composed of folded RNA) were found only in lower organisms. The discovery of the human CPEB3 ribozyme, related to the Hepatitis Delta Virus one, was an enormous breakthrough, which gave rise to numerous scientific questions.
In the scope of this project, I want to answer the most emerging ones; I aim to solve the NMR structure of the whole CPEB3 ribozyme (we already have some promising preliminary results), as well as to crystallize it (in collaboration with another group) and compare the solution NMR and solid state X-ray structure. To understand changes in dynamics and folding of the ribozyme in the presence of Mg(II) (the natural cofactor), and also in the presence of other metal ions, single-molecule FRET (Förster Resonance Energy Transfer) experiments will be performed. As a long–term goal (after the repatriation to my home University), I will use NMR to characterize specific metal binding sites, structural and thermodynamic changes within the ribozyme upon the addition of metal ions.
A big advantage of this project is that the ribozyme will be studied as a whole unit and not cut down into smaller parts. Although much more challenging, this will give a complete and clear view on the metal ion binding - structure - function relations.
I am convinced that the proposed interdisciplinary project, which combines structural biology with coordination chemistry, is an exciting and necessary field of study, crucial for understanding not only the complicated structure and pathway of metal – mediated cleavage of the only known human ribozyme, but also for providing insight into its evolutional background, after being compared to the mechanism in which the viral HDV ribozyme functions.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2012-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

University of Zurich
Contributo UE
€ 144 466,65
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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