Ziel
Non-pathogenic mycobacteria are efficiently phagocytosed by macrophages and killed within phagosomes by acid hydrolases, reactive nitrogen intermediates, and likely other still unidentified factors that are part of the macrophage pro-inflammatory response. In contrast, pathogenic mycobacteria such as M. tuberculosis survive and grow within phagosomes by blocking macrophage pro-inflammatory responses, including the NF-kB transcription system, phago-lysosome fusion, acidification and nitric oxide release. Activation of NF-kB has recently been shown, by the host group, to be essential for macrophages to kill the non-pathogen M. smegmatis.
Here two genomic screening assays are proposed: the first (A) will use RNA micrroarray chips to identify macrophage mRNA¿s t hat are up-regulated in response to M.smegmatis or M.bovis BCG, that behaves like a pathogen. Emphasis will be given to identify macrophage proteins that are potentially involved in killing M.smegmatis; some of these proteins are predicted to be under the control of the NF-kB system. It is also expected that the potential killing proteins may not be up-regulated in BCG-infected cells, that therefore serve as a control.
The second screen (B) involves a recently developed high throughput RNAi approach that will be used to identify proteins that, when knocked down block the ability of GFP-M.smegmatis to fuse with lysosomes labelled with a red marker (rhodamine gold or lysotracker red). These proteins should be positive regulators of phagosome maturation and their identification should facilitate future efforts to understand how the pathogenic mycobacteria block phagosome maturation.
In parallel, RNAi knockdown of putative macrophage killing factors identified in screen A will allow us to test the hypothesis that these proteins indeed facilitate killing of M.smegmatis. The final proof of killing will be sought by testing purified factors for their effects on M.smegmatis growth and survival in vitro.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP6-2005-MOBILITY-7
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Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
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IIF - Marie Curie actions-Incoming International Fellowships
Koordinator
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