Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-06-16

Scalable modelling and analysis techniques to study emergent cell behaviour -- understanding the E. coli stress response

Cel

The aim of our research is to enhance our understanding of the molecular mechanisms underlying the behavior of complex living systems. In particular, we investigate how large and complex regulatory networks control the response of a living cell to its ever-changing environment.

The stress response to environmental events is induced by the interaction of several interwoven modules with complex dynamic behavior, acting on different time scales. To deal with this complexity we need mathematical modeling and computer-supported analysis. So far, the methods of systems biology are mostly applied to individual modules, such as particular metabolic pathways and genetic networks. But to understand the global behavior, we need an integrated description of the regulatory network. We must develop new, scalable methods for modeling and analysis of integrated networks.

We will apply our methods to the stress response system of the enterobacterium Escherichia coli, one of the best-studied organisms and a model for several pathogenic bacteria. In the project, we will develop an integrated model of the stress response system of E. coli, including key metabolic, genetic and signaling modules. We also develop methods to reduce high-dimensional nonlinear systems of equations, and to approximate them by discrete automata. Parallel model checking algorithms will be developed for verifying specific properties at the model. So we can explore the models and predict the outcome of experiments.

Finally, we will validate our model by experimentally testing predicted properties in our labs. Our cross-disciplinary European team of biologists, mathematicians and computer scientists will develop a coherent and generic methodology, generalizable to other complex (biological) systems. Our models will be accessible via the Silicon Cell and the International E. coli Alliance. They could improve many medical and biotechnological applications, e.g. strain improvement and rational drug design.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

FP6-2005-NEST-PATH
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

STREP - Specific Targeted Research Project

Koordynator

UNIVERSITEIT TWENTE
Wkład UE
Brak danych
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych

Uczestnicy (6)

Moja broszura 0 0