Cel
Discovering the causal mechanisms of a complex system of interacting components is necessary in order to control it. Computational Causal Discovery (CD) is a field that offers the potential to discover causal relations under certain conditions from observational data alone or with a limited number of interventions/manipulations.
An important, challenging biological problem that may take decades of experimental work is the induction of biological cellular pathways; pathways are informal causal models indispensable in biological research and drug design. Recent exciting advances in flow/mass cytometry biotechnology allow the generation of large-sample datasets containing measurements on single cells, thus setting the problem of pathway learning suitable for CD methods.
CAUSALPATH builds upon and further advances recent breakthrough developments in CD methods to enable the induction of biological pathways from cytometry and other omics data. As a testbed problem we focus on the differentiation of human T-cells; these are involved in autoimmune and inflammatory diseases, as well as cancer and thus, are targets of new drug development for a range of chronic diseases. The biological problem acts as our campus for general novel formalisms, practical algorithms, and useful tools development, pointing to fundamental CD problems: presence of feedback cycles, presence of latent confounding variables, CD from time-course data, Integrative Causal Analysis (INCA) of heterogeneous datasets and others.
Three features complement CAUSALPATH’s approach: (A) methods development will co-evolve with biological wet-lab experiments periodically testing the algorithmic postulates, (B) Open-source tools will be developed for the non-expert, and (C) Commercial exploitation of the results will be sought out.
CAUSALPATH brings together an interdisciplinary team, committed to this vision. It builds upon the PI’s group recent important results on INCA algorithms.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
ERC-2013-CoG
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Instytucja przyjmująca
741 00 RETHIMNO
Grecja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.