Defining how environmental factors influence downstream effects of immune-mediated disease risk-SNPs

Projektinformationen

ImmRisk

ID Finanzhilfevereinbarung: 637640

DOI 10.3030/637640

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 13 Mai 2015

Startdatum 1 September 2015

Enddatum 28 Februar 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 496 690,00

EU-Beitrag € 1 496 690,00

Koordiniert durch

ACADEMISCH ZIEKENHUIS GRONINGEN
Netherlands

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (8)

Large-scale cis- and trans-eQTL analyses identify thousands of genetic loci and polygenic scores that regulate blood gene expression

Autoren: Urmo Võsa, Annique Claringbould, Harm-Jan Westra, Marc Jan Bonder, Patrick Deelen, Biao Zeng, Holger Kirsten, Ashis Saha, Roman Kreuzhuber, Seyhan Yazar, Harm Brugge, Roy Oelen, Dylan H. de Vries, Monique G. P. van der Wijst, Silva Kasela, Natalia Pervjakova, Isabel Alves, Marie-Julie Favé, Mawussé Agbessi, Mark W. Christiansen, Rick Jansen, Ilkka Seppälä, Lin Tong, Alexander Teumer, Katharin
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 53/9, 2021, Seite(n) 1300-1310, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-021-00913-z

Improving the diagnostic yield of exome- sequencing by predicting gene–phenotype associations using large-scale gene expression analysis

Autoren: Patrick Deelen, Sipko van Dam, Johanna C. Herkert, Juha M. Karjalainen, Harm Brugge, Kristin M. Abbott, Cleo C. van Diemen, Paul A. van der Zwaag, Erica H. Gerkes, Evelien Zonneveld-Huijssoon, Jelkje J. Boer-Bergsma, Pytrik Folkertsma, Tessa Gillett, K. Joeri van der Velde, Roan Kanninga, Peter C. van den Akker, Sabrina Z. Jan, Edgar T. Hoorntje, Wouter P. te Rijdt, Yvonne J. Vos, Jan D. H. Jongbl
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-10649-4

Translational insights from single-cell technologies across the cardiovascular disease continuum

Autoren: Irene V. van Blokland, Hilde E. Groot, Lude H. Franke, Monique G.P. van der Wijst, Pim van der Harst
Veröffentlicht in: Trends in Cardiovascular Medicine, 2021, ISSN 1050-1738
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tcm.2021.02.009

The single-cell eQTLGen consortium

Autoren: MGP van der Wijst, DH de Vries, HE Groot, G Trynka, CC Hon, MJ Bonder, O Stegle, MC Nawijn, Y Idaghdour, P van der Harst, CJ Ye, J Powell, FJ Theis, A Mahfouz, M Heinig, L Franke
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 9, 2020, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.52155

Correction for both common and rare cell types in blood is important to identify genes that correlate with age

Autoren: Damiano Pellegrino-Coppola, Annique Claringbould, Maartje Stutvoet, Dorret I. Boomsma, M. Arfan Ikram, P. Eline Slagboom, Harm-Jan Westra, Lude Franke
Veröffentlicht in: BMC Genomics, Ausgabe 22/1, 2021, ISSN 1471-2164
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12864-020-07344-w

Overlapping SETBP1 gain-of-function mutations in Schinzel-Giedion syndrome and hematologic malignancies

Autoren: Rocio Acuna-Hidalgo, Pelagia Deriziotis, Marloes Steehouwer, Christian Gilissen, Sarah A. Graham, Sipko van Dam, Julie Hoover-Fong, Aida B. Telegrafi, Anne Destree, Robert Smigiel, Lindsday A. Lambie, Hülya Kayserili, Umut Altunoglu, Elisabetta Lapi, Maria Luisa Uzielli, Mariana Aracena, Banu G. Nur, Ercan Mihci, Lilia M. A. Moreira, Viviane Borges Ferreira, Dafne D. G. Horovitz, Katia M. da Roch
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 13/3, 2017, Seite(n) e1006683, ISSN 1553-7404
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1006683

Single-cell RNA sequencing identifies celltype-specific cis-eQTLs and co-expression QTLs

Autoren: Monique G. P. van der Wijst, Harm Brugge, Dylan H. de Vries, Patrick Deelen, Morris A. Swertz, Lude Franke
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 50/4, 2018, Seite(n) 493-497, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0089-9

Integrating GWAS with bulk and single-cell RNA-sequencing reveals a role for LY86 in the anti-Candida host response

Autoren: Dylan H. de Vries, Vasiliki Matzaraki, Olivier B. Bakker, Harm Brugge, Harm-Jan Westra, Mihai G. Netea, Lude Franke, Vinod Kumar, Monique G. P. van der Wijst
Veröffentlicht in: PLOS Pathogens, Ausgabe 16/4, 2020, Seite(n) e1008408, ISSN 1553-7374
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.ppat.1008408