Leistungen
Global models for protein secretion and secretion stress progression.
Supervisory board of the network establishedSupervisory board of the network established for all partners
Model for protein trafficking through the secretory pathwayModel for protein trafficking through the secretory pathway.
List of common and critical conditions that are relevant during industrial fermentation processesNew method for predicting membrane protein complexes
New method for predicting membrane protein complexes.
First quantitative data for selected membrane proteinsMembrane proteome data sets for B. subtilis + E. coli under all growth regimes
Membrane proteome data sets for B. subtilis + E. coli under all growth regimes.
Secretion bottlenecks identifiedGlobal quantitative analysis of membrane proteome
Global quantitative analysis of membrane proteome.
Definition of protein production stress responses in E. coliDefinition of protein production stress responses in E. coli.
Refined regulatory model including membrane proteins validated with proteomics dataRefined regulatory model including membrane proteins validated with proteomics data.
New algorithms that predict inter-helix pairings in membrane proteinsNew algorithms that predict inter-helix pairings in membrane proteins.
Established model for secretion stress onsetEstablished model for secretion stress onset.
Validated membrane protein complexes and their dynamicsValidated membrane protein complexes and their dynamics.
Project website
Veröffentlichungen
Autoren:
Nepal S, Maaß S, Grasso S, Cavallo FM, Bartel J, Becher D, Bathoorn E, van Dijl JM
Veröffentlicht in:
Antibiotics (Basel), Ausgabe 10.5, 2021, Seite(n) 501, ISSN 2079-6382
Herausgeber:
MDPI
DOI:
10.3390/antibiotics10050501
Autoren:
Nicolaus, F., Metola, A., Mermans, D., Liljenström, A., Krč, A., Abdullahi, S. M., Zimmer, M., Miller Iii, T. F., & von Heijne, G
Veröffentlicht in:
eLife, Ausgabe 10, 2021, Seite(n) 64302, ISSN 2050-084X
Herausgeber:
eLife Sciences Publications
DOI:
10.7554/elife.64302
Autoren:
Alexandros Karyolaimos1†, Katarzyna Magdalena Dolata2†, Minia Antelo-Varela2†, Anna Mestre Borras1, Rageia Elfageih1, Susanne Sievers2, Dörte Becher2, Katharina Riedel2 and Jan-Willem de Gier
Veröffentlicht in:
Front Bioeng Biotech, 2020, Seite(n) 465, ISSN 2296-4185
Herausgeber:
Frontiers Media S.A.
DOI:
10.3389/fbioe.2019.00465
Autoren:
Alexandros Karyolaimos1†, Henry Ampah-Korsah1†, Tamara Hillenaar1, Anna Mestre Borras1, Katarzyna Magdalena Dolata2, Susanne Sievers2, Katharina Riedel2, Robert Daniels1 and Jan-Willem de Gier1*
Veröffentlicht in:
Front Bioeng Biotech, 2019, Seite(n) 1511, ISSN 1664-302X
Herausgeber:
Frontiers Media
DOI:
10.3389/fmicb.2019.01511
Autoren:
Antelo-Varela M, Bartel J, Quesada-Ganuza A, Appel K, Bernal-Cabas M, Sura T, Otto A, Rasmussen M, van Dijl JM, Nielsen A, Maaß S, Becher D
Veröffentlicht in:
Anal Chem, Ausgabe 91(18), 2019, Seite(n) 11972-11980, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.9b02869
Autoren:
Gabarrini G, Grasso S, van Winkelhoff AJ, van Dijl JM
Veröffentlicht in:
Brief Bioinformation, Ausgabe 22(4), 2021, Seite(n) 302, ISSN 1477-4054
Herausgeber:
Oxford Academic
DOI:
10.1093/bib/bbaa302
Autoren:
Aguilar Suárez R, Antelo-Varela M, Maaß S, Neef J, Becher D, van Dijl JM
Veröffentlicht in:
mSystems, Ausgabe 6(6), 2021, Seite(n) e0065521, ISSN 2379-5077
Herausgeber:
ASM Journals
DOI:
10.1128/msystems.00655-21
Autoren:
Mekonnen SA, Palma Medina LM, Glasner C, Tsompanidou E, de Jong A, Grasso S, Schaffer M, Mäder U, Larsen AR, Gumpert H, Westh H, Völker U, Otto A, Becher D, van Dijl JM
Veröffentlicht in:
Virulence, Ausgabe 18(6), 2017, Seite(n) 891-907, ISSN 2150-5594
Herausgeber:
Landes Bioscience
DOI:
10.1080/21505594.2017.1325064
Autoren:
Alexandros Karyolaimos and Jan-Willem de Gier
Veröffentlicht in:
Front Bioeng Biotech, 2021, Seite(n) 797334, ISSN 2296-4185
Herausgeber:
Frontiers Media S.A.
DOI:
10.3389/fbioe.2021.797334
Autoren:
Bernal-Cabas M, Miethke M, Antelo-Varela M, Aguilar Suárez R, Neef J, Schön L, Gabarrini G, Otto A, Becher D, Wolf D, van Dijl JM
Veröffentlicht in:
Biochim Biophys Acta Mol Cell Res, Ausgabe 1867(8), 2020, Seite(n) 19, ISSN 2079-6382
Herausgeber:
Elsevier
DOI:
10.1016/j.bbamcr.2020.118719
Autoren:
George A. Sutherland, Katie J. Grayson, Nathan B. P. Adams, Daphne M. J. Mermans, Alexander S. Jones, Angus J. Robertson, Dirk B. Auman, Amanda A. Brindley, Fabio Sterpone, Pierre Tuffery, Philippe Derreumaux, P. Leslie Dutton, Colin Robinson, Andrew Hitchcock, C. Neil Hunter
Veröffentlicht in:
Journal of Biological Chemistry, Ausgabe 293/18, 2018, Seite(n) 6672-6681, ISSN 0021-9258
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/jbc.ra117.000880
Autoren:
Katarzyna M. Dolata, Isabel Guerrero Montero, Wayne Miller, Susanne Sievers, Thomas Sura, Christian Wolff, Rabea Schlüter, Katharina Riedel, Colin Robinson
Veröffentlicht in:
Microbiological Research, Ausgabe 218, 2019, Seite(n) 97-107, ISSN 0944-5013
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.micres.2018.10.008
Autoren:
Isabel Guerrero Montero, Katarzyna Magdalena Dolata, Rabea Schlüter, Gilles Malherbe, Susanne Sievers, Daniela Zühlke, Thomas Sura, Emma Dave, Katharina Riedel, Colin Robinson
Veröffentlicht in:
Microbial Cell Factories, Ausgabe 18/1, 2019, ISSN 1475-2859
Herausgeber:
BioMed Central
DOI:
10.1186/s12934-019-1071-7
Autoren:
Grietje Kuipers, Alexandros Karyolaimos, Zhe Zhang, Nurzian Ismail, Gianluca Trinco, David Vikström, Dirk Jan Slotboom, Jan-Willem de Gier
Veröffentlicht in:
Microbial Cell Factories, Ausgabe 16/1, 2017, ISSN 1475-2859
Herausgeber:
BioMed Central
DOI:
10.1186/s12934-017-0840-4
Autoren:
Suruchi Nepal, Florian Bonn, Stefano Grasso, Tim Stobernack, Anne de Jong, Kai Zhou, Ronald Wedema, Sigrid Rosema, Dörte Becher, Andreas Otto, John W. Rossen, Jan Maarten van Dijl, Erik Bathoorn
Veröffentlicht in:
Virulence, Ausgabe 9/1, 2018, Seite(n) 1377-1389, ISSN 2150-5594
Herausgeber:
Landes Bioscience
DOI:
10.1080/21505594.2018.1509666
Autoren:
Henriques G, McGovern S, Neef J, Antelo-Varela M, Götz F, Otto A, Becher D, van Dijl JM, Jules M, Delumeau O
Veröffentlicht in:
mSphere, Ausgabe 5(5), 2020, Seite(n) 00724-20, ISSN 2379-5042
Herausgeber:
ASM Journals
DOI:
10.1128/msphere.00724-20
Autoren:
Nicolaus, F., Ibrahimi, F., den Besten, A., & von Heijne, G
Veröffentlicht in:
FEBS letters, Ausgabe 10.1002, 2022, ISSN 0014-5793
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1002/1873-3468.14286
Autoren:
Prajapati B, Bernal-Cabas M, López-Álvarez M, Schaffer M, Bartel J, Rath H, Steil L, Becher D, Völker U, Mäder U, van Dijl JM
Veröffentlicht in:
Biochim Biophys Acta Mol Cell Res, Ausgabe 1868(2), 2020, Seite(n) 118914, ISSN 0167-4889
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.bbamcr.2020.118914
Autoren:
Antelo-Varela M, Aguilar Suárez R, Bartel J, Bernal-Cabas M, Stobernack T, Sura T, van Dijl JM, Maaß S, Becher D
Veröffentlicht in:
Front Bioeng Biotechnol, Ausgabe 8, 2020, Seite(n) 143, ISSN 2296-4185
Herausgeber:
Frontiers Media S.A
DOI:
10.3389/fbioe.2020.00143
Suche nach OpenAIRE-Daten ...
Bei der Suche nach OpenAIRE-Daten ist ein Fehler aufgetreten
Es liegen keine Ergebnisse vor