Cell circuits as targets and biomarkers for liver disease and cancer prevention

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Veröffentlichungen

Omics‐derived hepatocellular carcinoma risk biomarkers for precision care of chronic liver diseases

Autoren: Naoto Fujiwara; Naoto Fujiwara; Tongqi Qian; Bhuvaneswari Koneru; Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Hepatol Res, Ausgabe 1, 2020, Seite(n) 817-830, ISSN 1872-034X
Herausgeber: The Japan Society of Hepatology
DOI: 10.1111/hepr.13506

Viral Exposure Signature Associated with Liver Cancer Risk.

Autoren: Naoto Fujiwara; Naoto Fujiwara; Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Trends Mol Med, Ausgabe 1, 2020, ISSN 1471-4914
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.molmed.2020.06.008

Unraveling the role of liver sinusoidal endothelial cells in COVID-19 liver injury

Autoren: Antonio Saviano, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: J Hepatol, 2021, Seite(n) 503–505, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2021.07.008

Perturbation of the circadian clock and pathogenesis of NAFLD

Autoren: Atish Mukherji, Mayssa Dachraoui, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: Metabolism, 2020, ISSN 0026-0495
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.metabol.2020.154337

Liver cell circuits and therapeutic discovery for advanced liver disease and cancer

Autoren: Emilie Crouchet, Catherine Schuster, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: Comptes Rendus Biologie, 2021, Seite(n) 233-248, ISSN 1631-0691
Herausgeber: Elsevier Masson
DOI: 10.5802/crbiol.64

A blood-based prognostic liver secretome signature and long-term hepatocellular carcinoma risk in advanced liver fibrosis

Autoren: Naoto Fujiwara, Masahiro Kobayashi,3 Austin J Fobar,4 Ayaka Hoshida,1 Cesia A Marquez,1 Bhuvaneswari Koneru,1 Gayatri Panda,1 Masataka Taguri,5 Tongqi Qian,1 Indu Raman,6 Quan-Zhen Li,6 Hiroki Hoshida,1 Hitomi Sezaki,3 Hiromitsu Kumada,3 Ryosuke Tateishi,2 Takeshi Yokoo,7 Adam C Yopp,8 Raymond T Chung,9 Bryan C Fuchs,10,11 Thomas F Baumert,12 Jorge A Marrero,1 Neehar D Parikh, Shijia Zhu, Amit G S
Veröffentlicht in: Med (N Y)., 2021, ISSN 2666-6340
Herausgeber: John Wiley
DOI: 10.1016/j.medj.2021.03.017

Transcriptome-Guided Design of Physiological Multilineage Liver Organoids

Autoren: Shijia Zhu, Naoto Kubota, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Trends Genet, 2021, ISSN 0168-9525
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2021.01.007

The Nobel Prize in Medicine 2020 for the Discovery of Hepatitis C Virus: Transforming Hepatology.

Autoren: Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: ISSN: 1600-0641, Ausgabe 25, 2020, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2020.10.017

Hepatitis B virus compartmentalization and single-cell differentiation in hepatocellular carcinoma.

Autoren: Frank Jühling; Antonio Saviano; Clara Ponsolles; Laura Heydmann; Emilie Crouchet; Sarah C. Durand; Houssein El Saghire; Emanuele Felli; Véronique Lindner; Patrick Pessaux; Nathalie Pochet; Nathalie Pochet; Catherine Schuster; Eloi R. Verrier; Thomas F. Baumert; Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Life Science Alliance, Ausgabe 1, 2021, ISSN 2575-1077
Herausgeber: Life Science Alliance LCC
DOI: 10.26508/lsa.202101036

Liver Abnormalities after Elimination of HCV Infection: Persistent Epigenetic and Immunological Perturbations Post-Cure

Autoren: Stephen J Polyak, I Nicholas Crispe, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: Pathogens, 2021, ISSN 2076-0817
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/pathogens10010044

Role of Hepatocyte-DerivedOsteopontinin Liver Carcinogenesis

Autoren: "Romain Desert # 1, Xiaodong Ge # 1 2, Zhuolun Song 1, Hui Han 1, Daniel Lantvit 1, Wei Chen 1, Sukanta Das 1, Dipti Athavale 1, Ioana Abraham-Enachescu 2, Chuck Blajszczak 1, Yu Chen 1, Orlando Musso 3, Grace Guzman 1, Yujin Hoshida, Natalia Nieto 1 2 5"
Veröffentlicht in: Hepatol Commun, 2022, ISSN 2471-254X
Herausgeber: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.1002/hep4.1845

Atorvastatin favorably modulates a clinical hepatocellular carcinoma risk gene signature

Autoren: Myung-Ho Kim 1, Mi-Young Kim 1 2 3, Shadi Salloum 1, Tongqi Qian 4, Lai Ping Wong 5 6, Min Xu 1, Yoojin Lee 1, Stuti G Shroff 7, Ruslan I Sadreyev 5 7, Kathleen E Corey 1, Thomas F Baumert 8 9, Yujin Hoshida, Raymond T Chung 1
Veröffentlicht in: Hepatol Commun, 2022, ISSN 2471-254X
Herausgeber: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.1002/hep4.1991

Conventional and artificial intelligence-based imaging for biomarker discovery in chronic liver disease

Autoren: Jérémy Dana,1,2,3,4 Aïna Venkatasamy, Antonio Saviano, Joachim Lupberger, Yujin Hoshida, Valérie Vilgrain,9 Pierre Nahon,10,11,12 Caroline Reinhold,4,13,14 Benoit Gallix,2,3,4 and Thomas F. Baumert1,3,7
Veröffentlicht in: Hepatol Int, 2022, ISSN 1936-0533
Herausgeber: Springer Pub. Co.
DOI: 10.1007/s12072-022-10303-0

Nuclear Pores Promote Lethal Prostate Cancer by Increasing POM121-Driven E2F1, MYC, and AR Nuclear Import

Autoren: Rodriguez-Bravo, Veronica; Pippa, Raffaella; Song, Won-Min; Carceles-Cordon, Marc; Dominguez-Andres, Ana; Fujiwara, Naoto; Woo, Jungreem; Koh, Anna P.; Ertel, Adam; Lokareddy, Ravi K.; Cuesta-Dominguez, Alvaro; Kim, Rosa S.; Rodriguez-Fernandez, Irene; Li, Peiyao; Gordon, Ronald; Hirschfield, Hadassa; Prats, Josep M.; Reddy, E. Premkumar; Fatatis, Alessandro; Petrylak, Daniel P.; Gomella, Leonard;
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 1, 2018, ISSN 1097-4172
Herausgeber: Elsevier Inc
DOI: 10.1016/j.cell.2018.07.015

Liver Disease and Coronavirus Disease 2019: From Pathogenesis to Clinical Care.

Autoren: Antonio Saviano; Florian Wrensch; Marc G. Ghany; Thomas F. Baumert; Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology (Baltimore, Md.), Ausgabe 20, 2021, Seite(n) 088-1100, ISSN 1527-3350
Herausgeber: John Wiley & Sons, Inc
DOI: 10.1002/hep.31684

Virus-Induced Risk of Hepatocellular Carcinoma: Recent Progress and Future Challenges

Autoren: Joachim Lupberger, and Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: J Clin Med, 2021, ISSN 2077-0383
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/jcm11010208

Plasma-Signature-Model for End-Stage Liver Disease Scoreto Predict Survival in Severe Alcoholic Hepatitis

Autoren: Naoto Fujiwara, Eric Trépo, Indu Raman, Quan-Zhen Li, Delphine Degré, Thierry Gustot, Christophe Moreno, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Clin Gastroenterol Hepatol, 2022, ISSN 1542-3565
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1016/j.cgh.2021.02.041

Viral manipulation of STAT3: Evade, exploit, and injure

Autoren: Armando Andres Roca Suarez, Nicolaas Van Renne, Thomas F. Baumert, Joachim Lupberger
Veröffentlicht in: PLOS Pathogens, Ausgabe 14/3, 2018, Seite(n) e1006839, ISSN 1553-7374
Herausgeber: Cold Spring Harbor, N.Y. : Cold Spring Harbor Laboratory Press, c2011.
DOI: 10.1371/journal.ppat.1006839

Hepatitis C Virus (HCV)–Apolipoprotein Interactions and Immune Evasion and Their Impact on HCV Vaccine Design

Autoren: Florian Wrensch, Emilie Crouchet, Gaetan Ligat, Mirjam B. Zeisel, Zhen-Yong Keck, Steven K. H. Foung, Catherine Schuster, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Frontiers in Immunology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-3224
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fimmu.2018.01436

Mapping Determinants of Virus Neutralization and Viral Escape for Rational Design of a Hepatitis C Virus Vaccine

Autoren: Mei-Le Keck, Florian Wrensch, Brian G. Pierce, Thomas F. Baumert, Steven K. H. Foung
Veröffentlicht in: Frontiers in Immunology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-3224
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fimmu.2018.01194

Hepatitis B virus evasion from cyclic guanosine monophosphate-adenosine monophosphate synthase sensing in human hepatocytes

Autoren: Eloi R. Verrier, Seung-Ae Yim, Laura Heydmann, Houssein El Saghire, Charlotte Bach, Vincent Turon-Lagot, Laurent Mailly, Sarah C. Durand, Julie Lucifora, David Durantel, Patrick Pessaux, Nicolas Manel, Ivan Hirsch, Mirjam B. Zeisel, Nathalie Pochet, Catherine Schuster, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology, 2018, ISSN 0270-9139
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hep.30054

Beyond viral dependence: The pathological consequences of HCV-induced EGF signaling

Autoren: Armando Andres Roca Suarez, Thomas F. Baumert, Joachim Lupberger
Veröffentlicht in: Journal of Hepatology, Ausgabe S0168-8278(18), 2018, Seite(n) 32118-4, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2018.05.033

Host-targeting therapies for hepatitis C virus infection: current developments and future applications

Autoren: Emilie Crouchet, Florian Wrensch, Catherine Schuster, Mirjam B. Zeisel, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Therapeutic Advances in Gastroenterology, Ausgabe 11, 2018, Seite(n) 175628481875948, ISSN 1756-2848
Herausgeber: London : Sage Publications
DOI: 10.1177/1756284818759483

A novel neutralizing human monoclonal antibody broadly abrogates hepatitis C virus infection in vitro and in vivo

Autoren: Isabelle Desombere, Ahmed Atef Mesalam, Richard A. Urbanowicz, Freya Van Houtte, Lieven Verhoye, Zhen-Yong Keck, Ali Farhoudi, Koen Vercauteren, Karin E. Weening, Thomas F. Baumert, Arvind H. Patel, Steven K.H. Foung, Jonathan Ball, Geert Leroux-Roels, Philip Meuleman
Veröffentlicht in: Antiviral Research, Ausgabe 148, 2017, Seite(n) 53-64, ISSN 0166-3542
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.antiviral.2017.10.015

Early Transcriptional Divergence Marks Virus-Specific Primary Human CD8 + T Cells in Chronic versus Acute Infection

Autoren: David Wolski, Peter K. Foote, Diana Y. Chen, Lia L. Lewis-Ximenez, Catherine Fauvelle, Jasneet Aneja, Andreas Walker, Pierre Tonnerre, Almudena Torres-Cornejo, Daniel Kvistad, Sabrina Imam, Michael T. Waring, Damien C. Tully, Todd M. Allen, Raymond T. Chung, Jörg Timm, W. Nicholas Haining, Arthur Y. Kim, Thomas F. Baumert, Georg M. Lauer
Veröffentlicht in: Immunity, Ausgabe 47/4, 2017, Seite(n) 648-663.e8, ISSN 1074-7613
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.immuni.2017.09.006

Zooming in on liver zonation

Autoren: Daniel J. Felmlee, Dominic Grün, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology, Ausgabe 67/2, 2018, Seite(n) 784-787, ISSN 0270-9139
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hep.29554

Protein kinase D at the Golgi controls NLRP3 inflammasome activation

Autoren: Zhirong Zhang, Gergö Meszaros, Wan-ting He, Yanfang Xu, Helena de Fatima Magliarelli, Laurent Mailly, Michael Mihlan, Yansheng Liu, Marta Puig Gámez, Alexander Goginashvili, Adrien Pasquier, Olga Bielska, Bénédicte Neven, Pierre Quartier, Rudolf Aebersold, Thomas F. Baumert, Philippe Georgel, Jiahuai Han, Romeo Ricci
Veröffentlicht in: The Journal of Experimental Medicine, Ausgabe 214/9, 2017, Seite(n) 2671-2693, ISSN 0022-1007
Herausgeber: Rockefeller University Press
DOI: 10.1084/jem.20162040

Hepatitis C virus–apolipoprotein interactions: molecular mechanisms and clinical impact

Autoren: Emilie Crouchet, Thomas F. Baumert, Catherine Schuster
Veröffentlicht in: Expert Review of Proteomics, Ausgabe 14/7, 2017, Seite(n) 593-606, ISSN 1478-9450
Herausgeber: Future Drugs Ltd.
DOI: 10.1080/14789450.2017.1344102

Entry Inhibitors: A Perspective for Prevention of Hepatitis C Virus Infection in Organ Transplantation

Autoren: Che C. Colpitts, Raymond T. Chung, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: ACS Infectious Diseases, Ausgabe 3/9, 2017, Seite(n) 620-623, ISSN 2373-8227
Herausgeber: Washington, DC : ACS Publications, [2015]-
DOI: 10.1021/acsinfecdis.7b00091

Advancing hepatitis B virus entry inhibitors

Autoren: Eloi R. Verrier, Catherine Schuster, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Journal of Hepatology, Ausgabe 66/4, 2017, Seite(n) 677-679, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2016.11.028

SCARB1 variants and HCV infection: Host susceptibility is lost in translation

Autoren: Che C. Colpitts, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Journal of Hepatology, Ausgabe 67/2, 2017, Seite(n) 211-213, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2017.04.013

SMAD About Hepatitis C Virus Cell Entry and Liver Disease

Autoren: Che C. Colpitts, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Gastroenterology, Ausgabe 152/1, 2017, Seite(n) 21-23, ISSN 0016-5085
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2016.11.029

miR-135a-5p-mediated downregulation of protein tyrosine phosphatase receptor delta is a candidate driver of HCV-associated hepatocarcinogenesis

Autoren: Nicolaas Van Renne, Armando Andres Roca Suarez, Francois H T Duong, Claire Gondeau, Diego Calabrese, Nelly Fontaine, Amina Ababsa, Simonetta Bandiera, Tom Croonenborghs, Nathalie Pochet, Vito De Blasi, Patrick Pessaux, Tullio Piardi, Daniele Sommacale, Atsushi Ono, Kazuaki Chayama, Masashi Fujita, Hidewaki Nakagawa, Yujin Hoshida, Mirjam B Zeisel, Markus H Heim, Thomas F Baumert, Joachim Lupberger
Veröffentlicht in: Gut, Ausgabe 67/5, 2018, Seite(n) 953-962, ISSN 0017-5749
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2016-312270

Solute Carrier NTCP Regulates Innate Antiviral Immune Responses Targeting Hepatitis C Virus Infection of Hepatocytes

Autoren: Eloi R. Verrier, Che C. Colpitts, Charlotte Bach, Laura Heydmann, Laetitia Zona, Fei Xiao, Christine Thumann, Emilie Crouchet, Raphaël Gaudin, Camille Sureau, François-Loïc Cosset, Jane A. McKeating, Patrick Pessaux, Yujin Hoshida, Catherine Schuster, Mirjam B. Zeisel, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 17/5, 2016, Seite(n) 1357-1368, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2016.09.084

Cell Culture Models for the Investigation of Hepatitis B and D Virus Infection

Autoren: Eloi Verrier, Che Colpitts, Catherine Schuster, Mirjam Zeisel, Thomas Baumert
Veröffentlicht in: Viruses, Ausgabe 8/9, 2016, Seite(n) 261, ISSN 1999-4915
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v8090261

Claudins in viral infection: from entry to spread

Autoren: Che C. Colpitts, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Pflügers Archiv - European Journal of Physiology, Ausgabe 469/1, 2017, Seite(n) 27-34, ISSN 0031-6768
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00424-016-1908-4

Hepatitis B virus: is a cure possible?

Autoren: Mirjam B. Zeisel, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Expert Review of Clinical Pharmacology, Ausgabe 9/9, 2016, Seite(n) 1129-1130, ISSN 1751-2433
Herausgeber: Future Drugs Ltd.
DOI: 10.1080/17512433.2016.1206466

Hepatitis C virus vaccine candidates inducing protective neutralizing antibodies

Autoren: Catherine Fauvelle, Che C. Colpitts, Zhen-yong Keck, Brian G. Pierce, Steven K. H. Foung, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Expert Review of Vaccines, Ausgabe 15/12, 2016, Seite(n) 1535-1544, ISSN 1476-0584
Herausgeber: Future Drugs Ltd.
DOI: 10.1080/14760584.2016.1194759

Circulating microRNAs for early detection of hepatitis B-related hepatocellular carcinoma

Autoren: Simonetta Bandiera, Thomas F. Baumert, Mirjam B. Zeisel
Veröffentlicht in: HepatoBiliary Surgery and Nutrition, Ausgabe 5/3, 2016, Seite(n) 198-200, ISSN 2304-3881
Herausgeber: Hong Kong : AME Publishing Company
DOI: 10.21037/hbsn.2016.03.08

Multifaceted role of E-cadherin in hepatitis C virus infection and pathogenesis

Autoren: Che C. Colpitts, Joachim Lupberger, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 113/27, 2016, Seite(n) 7298-7300, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1607732113

Translation and protein expression of lncRNAs: Impact for liver disease and hepatocellular carcinoma

Autoren: Mirjam B. Zeisel, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology, Ausgabe 64/2, 2016, Seite(n) 671-674, ISSN 0270-9139
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hep.28653

Monoclonal anti-envelope antibody AP33 protects humanized mice against a patient-derived hepatitis C virus challenge

Autoren: Isabelle Desombere, Samira Fafi-Kremer, Freya Van Houtte, Patrick Pessaux, Ali Farhoudi, Laura Heydmann, Lieven Verhoye, Sarah Cole, Jane A. McKeating, Geert Leroux-Roels, Thomas F. Baumert, Arvind H. Patel, Philip Meuleman
Veröffentlicht in: Hepatology, Ausgabe 63/4, 2016, Seite(n) 1120-1134, ISSN 0270-9139
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hep.28428

Tailored Algorithms for Hepatocellular Carcinoma Surveillance: Is One-Size-Fits-All Strategy Outdated?

Autoren: Nicolas Goossens, C. Billie Bian, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Current Hepatology Reports, Ausgabe 16/1, 2017, Seite(n) 64-71, ISSN 2195-9595
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s11901-017-0336-z

Risk factors and prevention of hepatocellular carcinoma in the era of precision medicine

Autoren: Naoto Fujiwara, Scott L. Friedman, Nicolas Goossens, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Journal of Hepatology, Ausgabe 68/3, 2018, Seite(n) 526-549, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2017.09.016

Combination of Gene Expression Signature and Model for End-Stage Liver Disease Score Predicts Survival of Patients With Severe Alcoholic Hepatitis

Autoren: Eric Trépo, Nicolas Goossens, Naoto Fujiwara, Won-Min Song, Antonio Colaprico, Astrid Marot, Laurent Spahr, Pieter Demetter, Christine Sempoux, Gene Y. Im, Joan Saldarriaga, Thierry Gustot, Jacques Devière, Swan N. Thung, Charlotte Minsart, Thomas Sersté, Gianluca Bontempi, Karim Abdelrahman, Jean Henrion, Delphine Degré, Valerio Lucidi, Laura Rubbia-Brandt, Venugopalan D. Nair, Christophe Mor
Veröffentlicht in: Gastroenterology, Ausgabe 154/4, 2018, Seite(n) 965-975, ISSN 0016-5085
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2017.10.048

In vitro modeling of hepatocellular carcinoma molecular subtypes for anti-cancer drug assessment

Autoren: Hadassa Hirschfield, C Billie Bian, Takaaki Higashi, Shigeki Nakagawa, Tizita Z Zeleke, Venugopalan D Nair, Bryan C Fuchs, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Experimental & Molecular Medicine, Ausgabe 50/1, 2018, Seite(n) e419, ISSN 2092-6413
Herausgeber: Seoul : Korean Society of Medical Biochemistry and Molecular Biology
DOI: 10.1038/emm.2017.164

The autotaxin-lysophosphatidic acid pathway emerges as a therapeutic target to prevent liver cancer

Autoren: Derek J. Erstad, Andrew M. Tager, Yujin Hoshida, Bryan C. Fuchs
Veröffentlicht in: Molecular & Cellular Oncology, Ausgabe 4/3, 2017, Seite(n) e1311827, ISSN 2372-3556
Herausgeber: Taylor & Francis
DOI: 10.1080/23723556.2017.1311827

Generic chemoprevention of hepatocellular carcinoma

Autoren: Sai Krishna Athuluri-Divakar, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Annals of the New York Academy of Sciences, 2018, ISSN 0077-8923
Herausgeber: New York Academy of Sciences
DOI: 10.1111/nyas.13971

A simple diet- and chemical-induced murine NASH model with rapid progression of steatohepatitis, fibrosis and liver cancer

Autoren: Takuma Tsuchida, Youngmin A. Lee, Naoto Fujiwara, Maria Ybanez, Brittany Allen, Sebastiao Martins, M. Isabel Fiel, Nicolas Goossens, Hsin-I. Chou, Yujin Hoshida, Scott L. Friedman
Veröffentlicht in: Journal of Hepatology, Ausgabe 69/2, 2018, Seite(n) 385-395, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2018.03.011

The functional role of sodium taurocholate cotransporting polypeptide NTCP in the life cycle of hepatitis B, C and D viruses

Autoren: Carla Eller, Laura Heydmann, Che C. Colpitts, Eloi R. Verrier, Catherine Schuster, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Cellular and Molecular Life Sciences, Ausgabe 75/21, 2018, Seite(n) 3895-3905, ISSN 1420-682X
Herausgeber: Birkhauser Verlag
DOI: 10.1007/s00018-018-2892-y

HBV core variants, liver fibrosis and hepatocellular carcinoma

Autoren: Gaetan Ligat, Catherine Schuster, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology, 2018, ISSN 0270-9139
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hep.30231

Status of Direct-acting Antiviral Therapy for HCV Infection and Remaining Challenges

Autoren: Thomas F. Baumert, Thomas Berg, Joseph K. Lim, David R. Nelson
Veröffentlicht in: Gastroenterology, 2018, ISSN 0016-5085
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2018.10.024

Oncogenic Signaling Induced by HCV Infection

Autoren: Alessia Virzì, Armando Roca Suarez, Thomas Baumert, Joachim Lupberger
Veröffentlicht in: Viruses, Ausgabe 10/10, 2018, Seite(n) 538, ISSN 1999-4915
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v10100538

Molecular heterogeneity in hepatocellular carcinoma

Autoren: Shijia Zhu, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Hepatic Oncology, Ausgabe 5/1, 2018, Seite(n) HEP10, ISSN 2045-0923
Herausgeber: future medicine
DOI: 10.2217/hep-2018-0005

Inhibition of Acetyl-CoA Carboxylase by Phosphorylation or the Inhibitor ND-654 Suppresses Lipogenesis and Hepatocellular Carcinoma

Autoren: James S.V. Lally, Sarani Ghoshal, Danielle K. DePeralta, Omeed Moaven, Lan Wei, Ricard Masia, Derek J. Erstad, Naoto Fujiwara, Vivian Leong, Vanessa P. Houde, Alexander E. Anagnostopoulos, Alice Wang, Lindsay A. Broadfield, Rebecca J. Ford, Robert A. Foster, Jamie Bates, Hailing Sun, Ting Wang, Henry Liu, Adrian S. Ray, Asish K. Saha, Jeremy Greenwood, Sathesh Bhat, Geraldine Harriman, Wenyan Miao
Veröffentlicht in: Cell Metabolism, 2018, ISSN 1550-4131
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cmet.2018.08.020

Tight junction proteins in gastrointestinal and liver disease

Autoren: Mirjam B Zeisel, Punita Dhawan, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: Gut, 2018, Seite(n) gutjnl-2018-316906, ISSN 0017-5749
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2018-316906

Autophagy is a gatekeeper of hepatic differentiation and carcinogenesis by controlling the degradation of Yap

Autoren: Youngmin A. Lee, Luke A. Noon, Kemal M. Akat, Maria D. Ybanez, Ting-Fang Lee, Marie-Luise Berres, Naoto Fujiwara, Nicolas Goossens, Hsin-I Chou, Fatemeh P. Parvin-Nejad, Bilon Khambu, Elisabeth G. M. Kramer, Ronald Gordon, Cathie Pfleger, Doris Germain, Gareth R. John, Kirk N. Campbell, Zhenyu Yue, Xiao-Ming Yin, Ana Maria Cuervo, Mark J. Czaja, M. Isabel Fiel, Yujin Hoshida, Scott L. Friedman
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-07338-z

Combined Analysis of Metabolomes, Proteomes, and Transcriptomes of Hepatitis C Virus–Infected Cells and Liver to Identify Pathways Associated With Disease Development

Autoren: Joachim Lupberger, Tom Croonenborghs, Armando Andres Roca Suarez, Nicolaas Van Renne, Frank Jühling, Marine A. Oudot, Alessia Virzì, Simonetta Bandiera, Carole Jamey, Gergö Meszaros, Daniel Brumaru, Atish Mukherji, Sarah C. Durand, Laura Heydmann, Eloi R. Verrier, Hussein El Saghire, Nourdine Hamdane, Ralf Bartenschlager, Shaunt Fereshetian, Evelyn Ramberger, Rileen Sinha, Mohsen Nabian, Celine
Veröffentlicht in: Gastroenterology, Ausgabe 157/2, 2019, Seite(n) 537-551.e9, ISSN 0016-5085
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2019.04.003

A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors

Autoren: Nadim Aizarani, Antonio Saviano, Sagar, Laurent Mailly, Sarah Durand, Josip S. Herman, Patrick Pessaux, Thomas F. Baumert, Dominic Grün
Veröffentlicht in: Nature, 2019, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1373-2

HCV-Induced Epigenetic Changes Associated With Liver Cancer Risk Persist After Sustained Virologic Response

Autoren: Nourdine Hamdane, Frank Jühling, Emilie Crouchet, Houssein El Saghire, Christine Thumann, Marine A. Oudot, Simonetta Bandiera, Antonio Saviano, Clara Ponsolles, Armando Andres Roca Suarez, Shen Li, Naoto Fujiwara, Atsushi Ono, Irwin Davidson, Nabeel Bardeesy, Christian Schmidl, Christoph Bock, Catherine Schuster, Joachim Lupberger, François Habersetzer, Michel Doffoël, Tullio Piardi, Daniele So
Veröffentlicht in: Gastroenterology, Ausgabe 156/8, 2019, Seite(n) 2313-2329.e7, ISSN 0016-5085
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2019.02.038

Functional microRNA screen uncovers O-linked N-acetylglucosamine transferase as a host factor modulating hepatitis C virus morphogenesis and infectivity

Autoren: Katharina Herzog, Simonetta Bandiera, Sophie Pernot, Catherine Fauvelle, Frank Jühling, Amélie Weiss, Anne Bull, Sarah C Durand, Béatrice Chane-Woon-Ming, Sébastien Pfeffer, Marion Mercey, Hervé Lerat, Jean-Christophe Meunier, Wolfgang Raffelsberger, Laurent Brino, Thomas F Baumert, Mirjam B Zeisel
Veröffentlicht in: Gut, 2019, Seite(n) gutjnl-2018-317423, ISSN 0017-5749
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2018-317423

Combined small molecule and loss-of-function screen uncovers estrogen receptor alpha and CAD as host factors for HDV infection and antiviral targets

Autoren: Eloi R Verrier, Amélie Weiss, Charlotte Bach, Laura Heydmann, Vincent Turon-Lagot, Arnaud Kopp, Houssein El Saghire, Emilie Crouchet, Patrick Pessaux, Thomas Garcia, Patrick Pale, Mirjam B Zeisel, Camille Sureau, Catherine Schuster, Laurent Brino, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: Gut, 2019, Seite(n) gutjnl-2018-317065, ISSN 0017-5749
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2018-317065

IFITM s mediate viral evasion in acute and chronic hepatitis C virus infection

Autoren: Florian Wrensch, Gaëtan Ligat, Laura Heydmann, Catherine Schuster, Mirjam B. Zeisel, Patrick Pessaux, François Habersetzer, Barnabas J. King, Alexander W. Tarr, Jonathan K. Ball, Michael Winkler, Stefan Pöhlmann, Zhen‐yong Keck, Steven K.H. Foung, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology, 2019, ISSN 0270-9139
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hep.30699

Oxidative Stress Triggers Selective tRNA Retrograde Transport in Human Cells during the Integrated Stress Response

Autoren: Hagen Schwenzer, Frank Jühling, Alexander Chu, Laura J. Pallett, Thomas F. Baumert, Mala Maini, Ariberto Fassati
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 26/12, 2019, Seite(n) 3416-3428.e5, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.02.077

In vivo combination of human anti-envelope glycoprotein E2 and -Claudin-1 monoclonal antibodies for prevention of hepatitis C virus infection

Autoren: Laurent Mailly, Florian Wrensch, Laura Heydmann, Catherine Fauvelle, Nicolas Brignon, Mirjam B. Zeisel, Patrick Pessaux, Zhen-yong Keck, Catherine Schuster, Thomas R. Fuerst, Steven K.H. Foung, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Antiviral Research, Ausgabe 162, 2019, Seite(n) 136-141, ISSN 0166-3542
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.antiviral.2018.12.018

An E. coli-produced single-chain variable fragment (scFv) targeting hepatitis B virus surface protein potently inhibited virion secretion

Autoren: Cheng Li, Yang Wang, Tiantian Liu, Matthias Niklasch, Ke Qiao, Sarah Durand, Li Chen, Mifang Liang, Thomas F. Baumert, Shuping Tong, Michael Nassal, Yu-Mei Wen, Yong-Xiang Wang
Veröffentlicht in: Antiviral Research, Ausgabe 162, 2019, Seite(n) 118-129, ISSN 0166-3542
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.antiviral.2018.12.019

Imaging-based surrogate markers of transcriptome subclasses and signatures in hepatocellular carcinoma: preliminary results

Autoren: Bachir Taouli, Yujin Hoshida, Suguru Kakite, Xintong Chen, Poh Seng Tan, Xiaochen Sun, Shingo Kihira, Kensuke Kojima, Sara Toffanin, M. Isabel Fiel, Hadassa Hirschfield, Mathilde Wagner, Josep M. Llovet
Veröffentlicht in: European Radiology, Ausgabe 27/11, 2017, Seite(n) 4472-4481, ISSN 0938-7994
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00330-017-4844-6

Ultrasound‐Guided Approaches to Improve Orthotopic Mouse Xenograft Models for Hepatocellular Carcinoma

Autoren: Ghina Bou About, Emilie Thiebault, Marie Wattenhofer‐Donzé, Hugues Jacobs, Alain Guimond, Tania Sorg, Eric Robinet, Thomas F. Baumert, Laurent Monassier, Yann Herault
Veröffentlicht in: Current Protocols in Mouse Biology, Ausgabe 9/2, 2019, ISSN 2161-2617
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/cpmo.62

Learning from a clinical cohort for HCV vaccine development

Autoren: Florian Wrensch, Zhen-yong Keck, Steven K.H. Foung, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Journal of Hepatology, Ausgabe 71/1, 2019, Seite(n) 9-11, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2019.03.030

The circadian clock and liver function in health and disease

Autoren: Atish Mukherji, Shannon M. Bailey, Bart Staels, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Journal of Hepatology, Ausgabe 71/1, 2019, Seite(n) 200-211, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2019.03.020

Editorial: Current Progress and Challenges in the Development of a B Cell Based Hepatitis C Virus Vaccine

Autoren: Steven K. H. Foung, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Frontiers in Immunology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-3224
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fimmu.2018.02577

Hepatocellular Carcinoma Risk Stratification by Genetic Profiling in Patients with Cirrhosis

Autoren: Naoto Fujiwara, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Seminars in Liver Disease, Ausgabe 39/02, 2019, Seite(n) 153-162, ISSN 0272-8087
Herausgeber: Thieme Medical Publishers
DOI: 10.1055/s-0039-1681031

Addressing the Challenges of Hepatitis C Cure and Persistent Risk of Hepatocellular Carcinoma

Autoren: Thomas F. Baumert, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Viruses, Ausgabe 11/5, 2019, Seite(n) 441, ISSN 1999-4915
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v11050441

Mortality from liver cirrhosis and HCC in the DAA era: success in viral control is darkened by raise of metabolic disease

Autoren: Antonio Saviano, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: HepatoBiliary Surgery and Nutrition, Ausgabe 8/3, 2019, Seite(n) 307-310, ISSN 2304-3881
Herausgeber: AME Publishing Company
DOI: 10.21037/hbsn.2019.01.21

Use of big data in drug development for precision medicine: an update

Autoren: Tongqi Qian, Shijia Zhu, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Expert Review of Precision Medicine and Drug Development, Ausgabe 4/3, 2019, Seite(n) 189-200, ISSN 2380-8993
Herausgeber: Taylor & Francis
DOI: 10.1080/23808993.2019.1617632

Hepatitis C Virus-Induced Upregulation of MicroRNA miR-146a-5p in Hepatocytes Promotes Viral Infection and Deregulates Metabolic Pathways Associated with Liver Disease Pathogenesis

Autoren: Simonetta Bandiera, Sophie Pernot, Hussein El Saghire, Sarah C. Durand, Christine Thumann, Emilie Crouchet, Tao Ye, Isabel Fofana, Marine A. Oudot, Jochen Barths, Catherine Schuster, Patrick Pessaux, Markus H. Heim, Thomas F. Baumert, Mirjam B. Zeisel
Veröffentlicht in: Journal of Virology, Ausgabe 90/14, 2016, Seite(n) 6387-6400, ISSN 0022-538X
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/JVI.00619-16

Extracellular lipid-free apolipoprotein E inhibits HCV replication and induces ABCG1-dependent cholesterol efflux

Autoren: Emilie Crouchet, Mathieu Lefèvre, Eloi R Verrier, Marine A Oudot, Thomas F Baumert, Catherine Schuster
Veröffentlicht in: Gut, Ausgabe 66/5, 2017, Seite(n) 896-907, ISSN 0017-5749
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2015-311289

Multimodal imaging of a humanized orthotopic model of hepatocellular carcinoma in immunodeficient mice

Autoren: Tao Wu, Emilie Heuillard, Véronique Lindner, Ghina Bou About, Mihaela Ignat, Jean-Philippe Dillenseger, Nicolas Anton, Eugénie Dalimier, Francine Gossé, Gael Fouré, Franck Blindauer, Céline Giraudeau, Hussein El-Saghire, Mourad Bouhadjar, Cynthia Calligaro, Tania Sorg, Philippe Choquet, Thierry Vandamme, Christophe Ferrand, Jacques Marescaux, Thomas F. Baumert, Michele Diana, Patrick Pessaux,
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 6/1, 2016, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/srep35230

Molecular Liver Cancer Prevention in Cirrhosis by Organ Transcriptome Analysis and Lysophosphatidic Acid Pathway Inhibition

Autoren: Shigeki Nakagawa, Lan Wei, Won Min Song, Takaaki Higashi, Sarani Ghoshal, Rosa S. Kim, C. Billie Bian, Suguru Yamada, Xiaochen Sun, Anu Venkatesh, Nicolas Goossens, Gretchen Bain, Gregory Y. Lauwers, Anna P. Koh, Mohamed El-Abtah, Noor B. Ahmad, Hiroki Hoshida, Derek J. Erstad, Ganesh Gunasekaran, Youngmin Lee, Ming-Lung Yu, Wan-Long Chuang, Chia-Yen Dai, Masahiro Kobayashi, Hiromitsu Kumada, Toru
Veröffentlicht in: Cancer Cell, Ausgabe 30/6, 2016, Seite(n) 879-890, ISSN 1535-6108
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.ccell.2016.11.004

Humanisation of a claudin-1-specific monoclonal antibody for clinical prevention and cure of HCV infection without escape

Autoren: Che C Colpitts, Rajiv G Tawar, Laurent Mailly, Christine Thumann, Laura Heydmann, Sarah C Durand, Fei Xiao, Eric Robinet, Patrick Pessaux, Mirjam B Zeisel, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: Gut, 2017, Seite(n) gutjnl-2016-312577, ISSN 0017-5749
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2016-312577

Plasmodium P36 determines host cell receptor usage during sporozoite invasion

Autoren: Giulia Manzoni, Carine Marinach, Selma Topçu, Sylvie Briquet, Morgane Grand, Matthieu Tolle, Marion Gransagne, Julien Lescar, Chiara Andolina, Jean-François Franetich, Mirjam B Zeisel, Thierry Huby, Eric Rubinstein, Georges Snounou, Dominique Mazier, François Nosten, Thomas F Baumert, Olivier Silvie
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 6, 2017, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.25903

Tracking HCV protease population diversity during transmission and susceptibility of founder populations to antiviral therapy

Autoren: Tanvi Khera, Daniel Todt, Koen Vercauteren, C. Patrick McClure, Lieven Verhoye, Ali Farhoudi, Sabin Bhuju, Robert Geffers, Thomas F. Baumert, Eike Steinmann, Philip Meuleman, Thomas Pietschmann, Richard J.P. Brown
Veröffentlicht in: Antiviral Research, Ausgabe 139, 2017, Seite(n) 129-137, ISSN 0166-3542
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.antiviral.2017.01.001

Cost-Effectiveness of Risk Score–Stratified Hepatocellular Carcinoma Screening in Patients with Cirrhosis

Autoren: Nicolas Goossens, Amit G Singal, Lindsay Y King, Karin L Andersson, Bryan C Fuchs, Cecilia Besa, Bachir Taouli, Raymond T Chung, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Clinical and Translational Gastroenterology, Ausgabe 8/6, 2017, Seite(n) e101, ISSN 2155-384X
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ctg.2017.26

Hepatic stellate cells as key target in liver fibrosis

Autoren: Takaaki Higashi, Scott L. Friedman, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Advanced Drug Delivery Reviews, 2017, ISSN 0169-409X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.addr.2017.05.007

Quantification of hepatocellular carcinoma heterogeneity with multiparametric magnetic resonance imaging

Autoren: Stefanie J. Hectors, Mathilde Wagner, Octavia Bane, Cecilia Besa, Sara Lewis, Romain Remark, Nelson Chen, M. Isabel Fiel, Hongfa Zhu, Sacha Gnjatic, Miriam Merad, Yujin Hoshida, Bachir Taouli
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-02706-z

Persisting risk of hepatocellular carcinoma after HCV cure monitored by a liver transcriptome signature

Autoren: Atsushi Ono, Nicolas Goossens, Richard S Finn, Warren N Schmidt, Swan N Thung, Gene Y Im, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Hepatology, 2017, ISSN 0270-9139
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hep.29203

Using Big Data to Discover Diagnostics and Therapeutics for Gastrointestinal and Liver Diseases

Autoren: Benjamin Wooden, Nicolas Goossens, Yujin Hoshida, Scott L. Friedman
Veröffentlicht in: Gastroenterology, Ausgabe 152/1, 2017, Seite(n) 53-67.e3, ISSN 0016-5085
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2016.09.065

Novel substituted aminothiazoles as potent and selective anti-hepatocellular carcinoma agents

Autoren: Huagang Lu, John Rogowskyj, Wenquan Yu, Anu Venkatesh, Noshena Khan, Shigeki Nakagawa, Nicolas Goossens, Anna P. Koh, Takaaki Higashi, Ganesh Gunasekaran, Myron E. Schwarz, Spiros P. Hiotis, Xiaodong Xu, William Kinney, Yujin Hoshida, Timothy Block, Andrea Cuconati, Yanming Du
Veröffentlicht in: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, Ausgabe 26/23, 2016, Seite(n) 5819-5824, ISSN 0960-894X
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.bmcl.2016.10.015

Transcriptome-based repurposing of apigenin as a potential anti-fibrotic agent targeting hepatic stellate cells

Autoren: Daniel F. Hicks, Nicolas Goossens, Ana Blas-García, Takuma Tsuchida, Benjamin Wooden, Michael C. Wallace, Natalia Nieto, Abigale Lade, Benjamin Redhead, Arthur I Cederbaum, Joel T. Dudley, Bryan C. Fuchs, Youngmin A. Lee, Yujin Hoshida, Scott L. Friedman
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 7, 2017, Seite(n) 42563, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/srep42563

New perspectives for preventing hepatitis C virus liver graft infection

Autoren: Daniel J Felmlee, Audrey Coilly, Raymond T Chung, Didier Samuel, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: The Lancet Infectious Diseases, Ausgabe 16/6, 2016, Seite(n) 735-745, ISSN 1473-3099
Herausgeber: The Lancet Publishing Group
DOI: 10.1016/S1473-3099(16)00120-1

Hepatitis B virus receptors and molecular drug targets

Autoren: Eloi R. Verrier, Che C. Colpitts, Camille Sureau, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology International, Ausgabe 10/4, 2016, Seite(n) 567-573, ISSN 1936-0533
Herausgeber: Springer Pub. Co.
DOI: 10.1007/s12072-016-9718-5

Chronic hepatitis C virus infection and pathogenesis of hepatocellular carcinoma

Autoren: Simonetta Bandiera, C Billie Bian, Yujin Hoshida, Thomas F Baumert, Mirjam B Zeisel
Veröffentlicht in: Current Opinion in Virology, Ausgabe 20, 2016, Seite(n) 99-105, ISSN 1879-6257
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.coviro.2016.09.010

Autoren: Thomas F. Baumert, Frank Jühling, Atsushi Ono, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: BMC Medicine, Ausgabe 15/1, 2017, ISSN 1741-7015
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12916-017-0815-7

Toward novel immunocompetent animal models for hepatitis B virus infection

Autoren: Laurent Mailly, Mirjam B. Zeisel, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology, 2017, ISSN 0270-9139
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hep.29249

Characterisation of endogenous Claudin‐1 expression, motility and susceptibility to hepatitis C virus in CRISPR knock‐in cells

Autoren: Camille M.H. Clément, Maika S. Deffieu, Cristina M. Dorobantu, Thomas F. Baumert, Nilda Vanesa Ayala‐Nunez, Yves Mély, Philippe Ronde, Raphael Gaudin
Veröffentlicht in: Biology of the Cell, Ausgabe 112/5, 2020, Seite(n) 140-151, ISSN 0248-4900
Herausgeber: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1111/boc.201900085

Addressing the next challenges: A summary of the 22nd international symposium on hepatitis C virus and related viruses

Autoren: Thomas F. Baumert, Catherine Schuster, François-Loïc Cosset, Jean Dubuisson, Maike Hofmann, Norbert Tautz, Mirjam B. Zeisel, Robert Thimme
Veröffentlicht in: Journal of Hepatology, Ausgabe 64/4, 2016, Seite(n) 968-973, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2015.12.021

Hepatitis C virus cell entry: a target for novel antiviral strategies to address limitations of direct acting antivirals

Autoren: Che C. Colpitts, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology International, Ausgabe 10/5, 2016, Seite(n) 741-748, ISSN 1936-0533
Herausgeber: Springer Pub. Co.
DOI: 10.1007/s12072-016-9724-7

A genome-wide gain-of-function screen identifies CDKN2C as a HBV host factor

Autoren: Carla Eller, Laura Heydmann, Che C. Colpitts, Houssein El Saghire, Federica Piccioni, Frank Jühling, Karim Majzoub, Caroline Pons, Charlotte Bach, Julie Lucifora, Joachim Lupberger, Michael Nassal, Glenn S. Cowley, Naoto Fujiwara, Sen-Yung Hsieh, Yujin Hoshida, Emanuele Felli, Patrick Pessaux, Camille Sureau, Catherine Schuster, David E. Root, Eloi R. Verrier, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-16517-w

Targeting clinical epigenetic reprogramming for chemoprevention of metabolic and viral hepatocellular carcinoma

Autoren: Frank Jühling, Nourdine Hamdane, Emilie Crouchet, Shen Li, Houssein El Saghire, Atish Mukherji, Naoto Fujiwara, Marine A Oudot, Christine Thumann, Antonio Saviano, Armando Andres Roca Suarez, Kaku Goto, Ricard Masia, Mozhdeh Sojoodi, Gunisha Arora, Hiroshi Aikata, Atsushi Ono, Parissa Tabrizian, Myron Schwartz, Stephen J Polyak, Irwin Davidson, Christian Schmidl, Christoph Bock, Catherine Schuste
Veröffentlicht in: Gut, 2020, Seite(n) gutjnl-2019-318918, ISSN 0017-5749
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2019-318918

Hepatitis C Virus and Hepatocellular Carcinoma: When the Host Loses Its Grip

Autoren: Kaku Goto, Armando Andres Roca Suarez, Florian Wrensch, Thomas F. Baumert, Joachim Lupberger
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 21/9, 2020, Seite(n) 3057, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms21093057

Signalome-wide assessment of host cell response to hepatitis C virus

Autoren: Gholamreza Haqshenas, Jianmin Wu, Kaylene J. Simpson, Roger J. Daly, Hans J. Netter, Thomas F. Baumert, Christian Doerig
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 8/1, 2017, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms15158

Broadly neutralizing antibodies from an individual that naturally cleared multiple hepatitis C virus infections uncover molecular determinants for E2 targeting and vaccine design

Autoren: Zhen-Yong Keck, Brian G. Pierce, Patrick Lau, Janine Lu, Yong Wang, Alexander Underwood, Rowena A. Bull, Jannick Prentoe, Rodrigo Velázquez-Moctezuma, Melanie R. Walker, Fabio Luciani, Johnathan D. Guest, Catherine Fauvelle, Thomas F. Baumert, Jens Bukh, Andrew R. Lloyd, Steven K. H. Foung
Veröffentlicht in: PLOS Pathogens, Ausgabe 15/5, 2019, Seite(n) e1007772, ISSN 1553-7374
Herausgeber: PLOS
DOI: 10.1371/journal.ppat.1007772

Hepatitis C virus infection and tight junction proteins: The ties that bind

Autoren: Laurent Mailly, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, Ausgabe 1862/7, 2020, Seite(n) 183296, ISSN 0005-2736
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamem.2020.183296

The Innate Antiviral Response in Animals: An Evolutionary Perspective from Flagellates to Humans

Autoren: Karim Majzoub, Florian Wrensch, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Viruses, Ausgabe 11/8, 2019, Seite(n) 758, ISSN 1999-4915
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v11080758

Uncovering the mechanism of action of aspirin in HCC chemoprevention

Autoren: Natascha Roehlen, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: EBioMedicine, Ausgabe 46, 2019, Seite(n) 21-22, ISSN 2352-3964
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ebiom.2019.07.047

Liver Fibrosis: Mechanistic Concepts and Therapeutic Perspectives

Autoren: Natascha Roehlen, Emilie Crouchet, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Cells, Ausgabe 9/4, 2020, Seite(n) 875, ISSN 2073-4409
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/cells9040875

Tight Junction Proteins and the Biology of Hepatobiliary Disease

Autoren: Natascha Roehlen, Armando Andres Roca Suarez, Houssein El Saghire, Antonio Saviano, Catherine Schuster, Joachim Lupberger, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 21/3, 2020, Seite(n) 825, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms21030825

Single-cell genomics and spatial transcriptomics: discovery of novel cell states and cellular interactions in liver physiology and disease biology

Autoren: Antonio Saviano, Neil C. Henderson, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Journal of Hepatology, 2020, ISSN 0168-8278
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhep.2020.06.004

Follicular T helper cells shape the HCV-specific CD4+ T cell repertoire after virus elimination

Autoren: Maike Smits, Katharina Zoldan, Naveed Ishaque, Zuguang Gu, Katharina Jechow, Dominik Wieland, Christian Conrad, Roland Eils, Catherine Fauvelle, Thomas F. Baumert, Florian Emmerich, Bertram Bengsch, Christoph Neumann-Haefelin, Maike Hofmann, Robert Thimme, Tobias Boettler
Veröffentlicht in: Journal of Clinical Investigation, Ausgabe 130/2, 2019, Seite(n) 998-1009, ISSN 0021-9738
Herausgeber: American Society for Clinical Investigation
DOI: 10.1172/jci129642

Hepatitis B Virus–Hepatocyte Interactions and Innate Immune Responses: Experimental Models and Molecular Mechanisms

Autoren: Emmanuel Thomas, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Seminars in Liver Disease, Ausgabe 39/03, 2019, Seite(n) 301-314, ISSN 0272-8087
Herausgeber: Thieme Medical Publishers
DOI: 10.1055/s-0039-1685518

Radiomics in hepatocellular carcinoma: a quantitative review

Autoren: Taiga Wakabayashi, Farid Ouhmich, Cristians Gonzalez-Cabrera, Emanuele Felli, Antonio Saviano, Vincent Agnus, Peter Savadjiev, Thomas F. Baumert, Patrick Pessaux, Jacques Marescaux, Benoit Gallix
Veröffentlicht in: Hepatology International, Ausgabe 13/5, 2019, Seite(n) 546-559, ISSN 1936-0533
Herausgeber: Springer Pub. Co.
DOI: 10.1007/s12072-019-09973-0

Rewiring Host Signaling: Hepatitis C Virus in Liver Pathogenesis

Autoren: Alessia Virzì, Armando Andres Roca Suarez, Thomas F. Baumert, Joachim Lupberger
Veröffentlicht in: Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine, Ausgabe 10/1, 2020, Seite(n) a037366, ISSN 2157-1422
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/cshperspect.a037366

The circadian clock components BMAL1 and REV-ERBα regulate flavivirus replication

Autoren: Xiaodong Zhuang, Andrea Magri, Michelle Hill, Alvina G. Lai, Abhinav Kumar, Srinivasa Bhargav Rambhatla, Claire L. Donald, Andrea F. Lopez-Clavijo, Simon Rudge, Katherine Pinnick, Wai Hoong Chang, Peter A. C. Wing, Ryan Brown, Ximing Qin, Peter Simmonds, Thomas F. Baumert, David Ray, Andrew Loudon, Peter Balfe, Michael Wakelam, Sam Butterworth, Alain Kohl, Catherine L. Jopling, Nicole Zitzmann, Ja
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-08299-7

MPIC: Molecular Prognostic Indicators in Cirrhosis Database for Clinical Context-Specific in Silico Prognostic Biomarker Validation

Autoren: Shun H. Yip, Naoto Fujiwara, Jason Burke, Anand Shetler, Celina Peralta, Tongqi Qian, Hiroki Hoshida, Shijia Zhu, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Frontiers in Genetics, Ausgabe 10, 2019, ISSN 1664-8021
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2019.00830

Gene signature-MELD score and alcohol relapse determine long-term prognosis of patients with severe alcoholic hepatitis

Autoren: Pierre Deltenre 1 2, Eric Trépo 1 3, Naoto Fujiwara, Nicolas Goossens 4 5, Astrid Marot 6, Margaux Dubois 7, Laurent Spahr 5, Jean Henrion 8, Christophe Moreno 1 3, Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Liver Int, 2020, ISSN 1478-3231
Herausgeber: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.1111/liv.14265

FIB-4 score and hepatocellular carcinoma risk after hepatitis C virus cure: time to revise surveillance?

Autoren: Antonio Saviano, Simona Tripon, Thomas F Baumert
Veröffentlicht in: Hepatobiliary Surgery and Nutrition, 2020, Seite(n) 661-664, ISSN 2304-3881
Herausgeber: AME Publishing Company
DOI: 10.21037/hbsn.2020.01.05

Steatohepatitic Variant of Hepatocellular Carcinoma Is Associated With Both Alcoholic Steatohepatitis and Nonalcoholic Steatohepatitis: A Study of 2 Cohorts With Molecular Insights.

Autoren: Jia Qin, MD, PhD,1 Takaaki Higashi, MD, PhD,2 Shigeki Nakagawa, MD, PhD,2 Yo-ichi Yamashita, MD, PhD,2 Toru Beppu, MD, PhD,2 Hideo Baba, MD, PhD,2 Masahiro Kobayashi, MD,3 Hiromitsu Kumada, MD,3 Ganesh Gunasekaran, MD,4 Thomas D. Schiano, MD,5 Swan N. Thung, MD,6 M. Isabel Fiel, MD, Yujin Hoshida, and Stephen C. Ward, MD, PhD6
Veröffentlicht in: Am J Surg Pathol, 2021, ISSN 0147-5185
Herausgeber: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1097/pas.0000000000001533

Composite vector formulation for multiple siRNA delivery as a host targeting antiviral in a cell culture model of hepatitis C virus (HCV) infection

Autoren: E Crouchet, R Saad, C Affolter-Zbaraszczuk, J Ogier, T F Baumert, C Schuster, F Meyer
Veröffentlicht in: Journal of Materials Chemistry B, 2016, Seite(n) 858-865, ISSN 2050-7518
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c6tb01718e

International Liver Cancer Association (ILCA) White Paper on Biomarker Development for Hepatocellular Carcinoma

Autoren: Amit G. Singal,Yujin Hoshida,1 David J. Pinato,2 Jorge Marrero,1 Jean-Charles Nault,3,4,5 Valerie Paradis,6 Nabihah Tayob,7 Morris Sherman,8 Young Suk Lim,9 Ziding Feng,10 Anna S. Lok,11 Jo Ann Rinaudo,12 Sudhir Srivastava,12 Josep Llovet,13,14,15 and Augusto Villanueva13
Veröffentlicht in: Gastroenterology, 2021, ISSN 0016-5085
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2021.01.233

Inhibiting SCAP/SREBP exacerbates liver injury and carcinogenesis in murine nonalcoholic steatohepatitis

Autoren: Satoshi Kawamura 1, Yuki Matsushita 1, Shigeyuki Kurosaki 1, Mizuki Tange 1, Naoto Fujiwara 1 2, Yuki Hayata 1, Yoku Hayakawa 1, Nobumi Suzuki 1, Masahiro Hata 1, Mayo Tsuboi 1, Takahiro Kishikawa 1, Hiroto Kinoshita 3, Takuma Nakatsuka 1, Masaya Sato 1, Yotaro Kudo 1, Yujin Hoshida, Atsushi Umemura 4, Akiko Eguchi 5, Tsuneo Ikenoue 6, Yoshihiro Hirata 7, Motonari Uesugi 8, Ryosuke Tateishi 1, Kei
Veröffentlicht in: J Clin Invest., 2022, ISSN 0021-9738
Herausgeber: American Society for Clinical Investigation
DOI: 10.1172/jci151895

Broad neutralization of hepatitis C virus-resistant variants by Civacir hepatitis C immunoglobulin

Autoren: Rajiv G. Tawar, Laura Heydmann, Charlotte Bach, Jörg Schüttrumpf, Shailesh Chavan, Barnabas J. King, C. Patrick McClure, Jonathan K. Ball, Patrick Pessaux, François Habersetzer, Ralf Bartenschlager, Mirjam B. Zeisel, Thomas F. Baumert
Veröffentlicht in: Hepatology, 2016, Seite(n) 1495-1506, ISSN 1527-3350
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/hep.28767

Cell type-specific pharmacological kinase inhibition for cancer chemoprevention.

Autoren: Manjeet Deshmukh; Shigeki Nakagawa; Shigeki Nakagawa; Takaaki Higashi; Takaaki Higashi; Adam Vincek; Anu Venkatesh; Marina Ruiz de Galarreta; Anna P. Koh; Nicolas Goossens; Nicolas Goossens; Hadassa Hirschfield; C Billie Bian; Naoto Fujiwara; Naoto Fujiwara; Atsushi Ono; Atsushi Ono; Hiroki Hoshida; Mohamed El-Abtah; Noor B. Ahmad; Amaia Lujambio; Roberto Sanchez; Bryan C. Fuchs; Klaas Poelstra; J
Veröffentlicht in: Nanomedicine, Ausgabe 1, 2018, Seite(n) 317-325, ISSN 1748-6963
Herausgeber: Elsevier Inc
DOI: 10.1016/j.nano.2017.11.004

Dose and Duration of Aspirin Use to Reduce Incident Hepatocellular Carcinoma

Autoren: Naoto Fujiwara; Naoto Fujiwara; Amit G. Singal; Yujin Hoshida
Veröffentlicht in: Hepatology, Ausgabe 1, 2019, ISSN 1527-3350
Herausgeber: John Wiley & Sons, Inc
DOI: 10.1002/hep.30813

Un criblage gain-de-fonction identifie CDKN2C comme facteur d'hôte impliqué dans le cycle viral du virus de l'hépatite B

Autoren: Eller, Carla
Veröffentlicht in: https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02924142, Ausgabe 1, 2019
Herausgeber: University of Strasbourg

Rechte des geistigen Eigentums

ANTI-CLAUDIN 1 MONOCLONAL ANTIBODIES FOR THE PREVENTION AND TREATMENT OF HEPATOCELLULAR CARCINOMA

Antrags-/Publikationsnummer: 20 16055942
Datum: 2016-03-18
Antragsteller: UNIVERSITE DE STRASBOURG

ANTI-CLAUDIN 1 MONOCLONAL ANTIBODIES FOR THE PREVENTION AND TREATMENT OF HEPATOCELLULAR CARCINOMA

Antrags-/Publikationsnummer: 20 16055942
Datum: 2016-03-18
Antragsteller: INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE

CLINICAL GENE SIGNATURE-BASED HUMAN CELL CULTURE MODEL AND USES THEREOF

Antrags-/Publikationsnummer: EP 16719852
Datum: 2016-04-28
Antragsteller: UNIVERSITE DE STRASBOURG

METHOD FOR DIAGNOSIS AND/OR PROGNOSIS OF LIVER DISEASE PROGRESSION AND RISK OF HEPATOCELLULAR CARCINOMA AND DISCOVERY OF THERAPEUTIC COMPOUNDS AND TARGETS TO TREAT LIVER DISEASE AND CANCER

Antrags-/Publikationsnummer: 20 21055203
Datum: 2021-03-02
Antragsteller: INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE

HUMANIZED ANTI-CLAUDIN-1 ANTIBODIES AND USES THEREOF

Antrags-/Publikationsnummer: 20 17056703
Datum: 2016-03-22
Antragsteller: INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE

H2 BLOCKERS TARGETING LIVER MACROPHAGES FOR THE PREVENTION AND TREATMENT OF LIVER DISEASE AND CANCER

Antrags-/Publikationsnummer: 20 21072341
Datum: 2021-08-11
Antragsteller: INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE

ANTI-CLAUDIN-1 MONOCLONAL ANTIBODIES FOR THE PREVENTION AND TREATMENT OF FIBROTIC DISEASES

Antrags-/Publikationsnummer: 20 20081941
Datum: 2020-11-12
Antragsteller: UNIVERSITE DE STRASBOURG

ANTI-CLAUDIN-1 MONOCLONAL ANTIBODIES FOR THE PREVENTION AND TREATMENT OF FIBROTIC DISEASES

Antrags-/Publikationsnummer: 20 20081941
Datum: 2020-11-12
Antragsteller: INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE

CLINICAL GENE SIGNATURE-BASED HUMAN CELL CULTURE MODEL AND USES THEREOF

Antrags-/Publikationsnummer: EP 16719852
Datum: 2016-04-28
Antragsteller: ICAHN SCHOOL OF MEDICINE AT MOUNT SINAI

H2 BLOCKERS TARGETING LIVER MACROPHAGES FOR THE PREVENTION AND TREATMENT OF LIVER DISEASE AND CANCER

Antrags-/Publikationsnummer: 20 21072341
Datum: 2021-08-11
Antragsteller: UNIVERSITE DE STRASBOURG

CLINICAL GENE SIGNATURE-BASED HUMAN CELL CULTURE MODEL AND USES THEREOF

Antrags-/Publikationsnummer: EP 16719852
Datum: 2016-04-28
Antragsteller: INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE

HUMANIZED ANTI-CLAUDIN-1 ANTIBODIES AND USES THEREOF

Antrags-/Publikationsnummer: 20 17056703
Datum: 2016-03-22
Antragsteller: UNIVERSITE DE STRASBOURG

METHOD FOR DIAGNOSIS AND/OR PROGNOSIS OF LIVER DISEASE PROGRESSION AND RISK OF HEPATOCELLULAR CARCINOMA AND DISCOVERY OF THERAPEUTIC COMPOUNDS AND TARGETS TO TREAT LIVER DISEASE AND CANCER

Antrags-/Publikationsnummer: 20 21055203
Datum: 2021-03-02
Antragsteller: UNIVERSITE DE STRASBOURG

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