Alzheimer Disease - gut connection

Projektinformationen

AD-gut

ID Finanzhilfevereinbarung: 686271

DOI

10.3030/686271

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 29 April 2016

Startdatum 1 April 2016

Enddatum 31 März 2020

Finanziert unter

• INDUSTRIAL LEADERSHIP - Leadership in enabling and industrial technologies - Advanced materials

Gesamtkosten

€ 7 686 620,00

EU-Beitrag

€ 5 092 886,25

Koordiniert durch

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Switzerland

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Websites, patent fillings, videos etc. (5)

Creation of website

see WP5 description

Workshop

see WP5 description

Mid-term press release

see WP5 description

Production of m-MOOCs

and at month 48 see WP5 description

Final press release

see WP5 description

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (27)

Native protein hydrogels by dynamic boronic acid chemistry

Autoren: Christiane Seidler, David Y.W. Ng, Tanja Weil
Veröffentlicht in: Tetrahedron, Ausgabe 73/33, 2017, Seite(n) 4979-4987, ISSN 0040-4020
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.tet.2017.06.066

Complementarity of PALM and SOFI for super-resolution live-cell imaging of focal adhesions

Autoren: Hendrik Deschout, Tomas Lukes, Azat Sharipov, Daniel Szlag, Lely Feletti, Wim Vandenberg, Peter Dedecker, Johan Hofkens, Marcel Leutenegger, Theo Lasser, Aleksandra Radenovic
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 7, 2016, Seite(n) 13693, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms13693

Spatiotemporally Controlled Release of Rho-Inhibiting C3 Toxin from a Protein-DNA Hybrid Hydrogel for Targeted Inhibition of Osteoclast Formation and Activity

Autoren: Jasmina Gačanin, Anna Kovtun, Stephan Fischer, Victoria Schwager, Johanna Quambusch, Seah Ling Kuan, Weina Liu, Felix Boldt, Chuang Li, Zhongqiang Yang, Dongsheng Liu, Yuzhou Wu, Tanja Weil, Holger Barth, Anita Ignatius
Veröffentlicht in: Advanced Healthcare Materials, Ausgabe 6/21, 2017, Seite(n) 1700392, ISSN 2192-2640
Herausgeber: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/adhm.201700392

Methyltransferase-Directed Labeling of Biomolecules and its Applications

Autoren: Jochem Deen, Charlotte Vranken, Volker Leen, Robert K. Neely, Kris P. F. Janssen, Johan Hofkens
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, Ausgabe 56/19, 2017, Seite(n) 5182-5200, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201608625

Reduced Fluorescent Protein Switching Fatigue by Binding-Induced Emissive State Stabilization

Autoren: Thijs Roebroek, Sam Duwé, Wim Vandenberg, Peter Dedecker
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 18/10, 2017, Seite(n) 2015, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms18092015

Live-cell monochromatic dual-label sub-diffraction microscopy by mt-pcSOFI

Autoren: S. Duwé, W. Vandenberg, P. Dedecker
Veröffentlicht in: Chem. Commun., Ausgabe 53/53, 2017, Seite(n) 7242-7245, ISSN 1359-7345
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c7cc02344h

Combined multi-plane phase retrieval and super-resolution optical fluctuation imaging for 4D cell microscopy

Autoren: A. Descloux, K. S. Grußmayer, E. Bostan, T. Lukes, A. Bouwens, A. Sharipov, S. Geissbuehler, A.-L. Mahul-Mellier, H. A. Lashuel, M. Leutenegger, T. Lasser
Veröffentlicht in: Nature Photonics, Ausgabe 12/3, 2018, Seite(n) 165-172, ISSN 1749-4885
Herausgeber: Nature Pub. Group
DOI: 10.1038/s41566-018-0109-4

Optical projection tomography for rapid whole mouse brain imaging

Autoren: David Nguyen, Paul J. Marchand, Arielle L. Planchette, Julia Nilsson, Miguel Sison, Jérôme Extermann, Antonio Lopez, Marcin Sylwestrzak, Jessica Sordet-Dessimoz, Anja Schmidt-Christensen, Dan Holmberg, Dimitri Van De Ville, Theo Lasser
Veröffentlicht in: Biomedical Optics Express, Ausgabe 8/12, 2017, Seite(n) 5637, ISSN 2156-7085
Herausgeber: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.8.005637

Correcting for photodestruction in super-resolution optical fluctuation imaging

Autoren: Yves Peeters, Wim Vandenberg, Sam Duwé, Arno Bouwens, Tomáš Lukeš, Cyril Ruckebusch, Theo Lasser, Peter Dedecker
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-09666-4

Quantifying protein densities on cell membranes using super-resolution optical fluctuation imaging

Autoren: Tomáš Lukeš, Daniela Glatzová, Zuzana Kvíčalová, Florian Levet, Aleš Benda, Sebastian Letschert, Markus Sauer, Tomáš Brdička, Theo Lasser, Marek Cebecauer
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 8/1, 2017, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-017-01857-x

Autonomous Ultrafast Self-Healing Hydrogels by pH-Responsive Functional Nanofiber Gelators as Cell Matrices

Autoren: Gačanin, J.; Hedrich, J.; Sieste, S.; Glasser, G.; Lieberwirth, I.; Schilling, C.; Fischer, S.; Barth, H.; Knoell, B.; Synatschke, C.; Weil, T.
Veröffentlicht in: Advanced Materials, Ausgabe 31, 2019, ISSN 0935-9648
Herausgeber: United Nations Industrial Developement Organization
DOI: 10.1002/adma.201805044

Lectin-Functionalized Composite Hydrogels for “Capture-and-Killing” of Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa

Autoren: N. Bodenberger, D. Kubiczek, D. Halbgebauer, V. Rimola, S. Wiese, D. Mayer, A. A. Rodriguez Alfonso, L. Ständker, S. Stenger, F. Rosenau
Veröffentlicht in: Biomacromolecules, Ausgabe 19 (7), 2018, Seite(n) 2472/2482, ISSN 1525-7797
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biomac.8b00089

Go with the flow or solitary confinement: a look inside the single-cell toolbox for isolation of rare and uncultured microbes

Autoren: G. R. B. Huys, J. Raes
Veröffentlicht in: Current Opinion in Microbiology, Ausgabe Vol. 44, 2018, Seite(n) 1/8, ISSN 1369-5274
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.mib.2018.05.002

Orthogonally Stimulated Assembly/Disassembly of Depsi‐peptides by Rational Chemical Design

Autoren: M. Pieszka, A. M. Sobota, J. Gačanin, T. Weil, D. Y. W. Ng
Veröffentlicht in: ChemBioChem, 2019, ISSN 1439-7633
Herausgeber: Wiley-VCH
DOI: 10.1002/cbic.201800781m

Reduction of Abeta amyloid pathology in APPPS1 transgenic mice in the absence of gut microbiota

Autoren: T. Harach, N. Marungruang, N. Duthilleul, V. Cheatham, K. D. Mc Coy, G. Frisoni, J. J. Neher, F. Fåk, M. Jucker, T. Lasser, T. Bolmont
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/srep41802

Integrated culturing, modeling and transcriptomics uncovers complex interactions and emergent behavior in a three-species synthetic gut community

Autoren: K. D’hoe, S. Vet, K. Faust, F. Moens, G. Falony, D. Gonze, V. Llorens-Rico, L. Gelens, J. Danckaert, L. De Vuyst and J. Raes
Veröffentlicht in: eLife, 2018, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.37090

Growth of engineered Pseudomonas putida KT2440 on glucose, xylose, and arabinose: Hemicellulose hydrolysates and their major sugars as sustainable carbon sources

Autoren: Wang, Y.; Horlamus, F.; Henkel, M.; Kovacic, F.; Schlaefle, S.; Hausmann, R.; Wittgens, A.; Rosenau, F.
Veröffentlicht in: GCB Bioenergy, Ausgabe 11, 2019, ISSN 1757-1693
Herausgeber: Wiley-VCH Verlag
DOI: 10.1111/gcbb.12590

Statistical parametric mapping of stimuli evoked changes in total blood flow velocity in the mouse cortex obtained with extended-focus optical coherence microscopy

Autoren: Shamaei, Vincent K.; Bouwens, Arno; Szlag, Daniel; Lasser, Theo; Nguyen, David; Extermann, Jérôme; Marchand, Paul J.; Bolmont, Tristan
Veröffentlicht in: Biomedical Optics Express, Ausgabe 1, 2017, Seite(n) 1-15, ISSN 2156-7085
Herausgeber: The Optical Society
DOI: 10.1364/BOE.8.000001

Single Molecule Localization and Discrimination of DNA–Protein Complexes by Controlled Translocation Through Nanocapillaries

Autoren: Bulushev, Roman D.; Davis, Sebastian J.; Sebastian J Maerkl; Marion, Sanjin; Petrova, Ekaterina; Radenovic, Aleksandra
Veröffentlicht in: Nano Letters, Ausgabe 1, 2016, Seite(n) 7882–7890, ISSN 1530-6984
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.6b04165

Identifying microbial species by single-molecule DNA optical mapping and resampling statistics

Autoren: Arno Bouwens, Jochem Deen, Raffaele Vitale, Laurens D’Huys, Vince Goyvaerts, Adrien Descloux, Doortje Borrenberghs, Kristin Grussmayer, Tomas Lukes, Rafael Camacho, Jia Su, Cyril Ruckebusch, Theo Lasser, Dimitri Van De Ville, Johan Hofkens, Aleksandra Radenovic, Kris Pieter Frans Janssen
Veröffentlicht in: NAR Genomics and Bioinformatics, Ausgabe 2/1, 2020, ISSN 2631-9268
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqz007

Parameter-free image resolution estimation based on decorrelation analysis

Autoren: A. Descloux, K. S. Grußmayer, A. Radenovic
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 16/9, 2019, Seite(n) 918-924, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-019-0515-7

Supervised learning to quantify amyloidosis in whole brains of an Alzheimer’s disease mouse model acquired with optical projection tomography

Autoren: David Nguyen, Virginie Uhlmann, Arielle L. Planchette, Paul J. Marchand, Dimitri Van De Ville, Theo Lasser, Aleksandra Radenovic
Veröffentlicht in: Biomedical Optics Express, Ausgabe 10/6, 2019, Seite(n) 3041, ISSN 2156-7085
Herausgeber: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.10.003041

Biomedical Applications of DNA‐Based Hydrogels

Autoren: Jasmina Gačanin, Christopher V. Synatschke, Tanja Weil
Veröffentlicht in: Advanced Functional Materials, Ausgabe 30/4, 2019, Seite(n) 1906253, ISSN 1616-301X
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.201906253

Comparison of Three Xylose Pathways in Pseudomonas putida KT2440 for the Synthesis of Valuable Products

Autoren: Isabel Bator, Andreas Wittgens, Frank Rosenau, Till Tiso, Lars M. Blank
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Ausgabe 7, 2020, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
DOI: 10.3389/fbioe.2019.00480

Fluorescent SAM analogues for methyltransferase based DNA labeling

Autoren: Vince Goyvaerts, Sven Van Snick, Laurens D'Huys, Raffaele Vitale, Milena Helmer Lauer, Su Wang, Volker Leen, Wim Dehaen, Johan Hofkens
Veröffentlicht in: Chemical Communications, Ausgabe 56/22, 2020, Seite(n) 3317-3320, ISSN 1359-7345
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c9cc08938a

A Cerberus‐Inspired Anti‐Infective Multicomponent Gatekeeper Hydrogel against Infections with the Emerging “Superbug” Yeast Candida auris

Autoren: Dennis Kubiczek, Carolin Flaig, Heinz Raber, Steffen Dietz, Ann‐Kathrin Kissmann, Thomas Heerde, Nicholas Bodenberger, Andreas Wittgens, Melaine González‐Garcia, Fan Kang, Octavio L. Franco, Ludger Staendker, Anselmo J. Otero‐González, Paul Walther, Kay E. Gottschalk, Tanja Weil, Frank Rosenau
Veröffentlicht in: Macromolecular Bioscience, Ausgabe 20/4, 2020, Seite(n) 2000005, ISSN 1616-5187
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/mabi.202000005

High-speed multiplane structured illumination microscopy of living cells using an image-splitting prism

Autoren: Adrien Descloux, Marcel Müller, Vytautas Navikas, Andreas Markwirth, Robin van den Eynde, Tomas Lukes, Wolfgang Hübner, Theo Lasser, Aleksandra Radenovic, Peter Dedecker, Thomas Huser
Veröffentlicht in: Nanophotonics, Ausgabe 9/1, 2019, Seite(n) 143-148, ISSN 2192-8614
Herausgeber: De Gruyter
DOI: 10.1515/nanoph-2019-0346

Book chapters (2)

Aptamers as promising agents in diagnostic and therapeutic applications.

Autoren: D. Kubiczek, N. Bodenberger, F. Rosenau
Veröffentlicht in: Antimicrobial research: Novel bioknowledge and educational programs, 2017
Herausgeber: A. Méndez-Vilas, Ed.

Jelly Bombs–Hydrogels as Weapons against Microorganisms.

Autoren: N. Bodenberger, D. Kubiczek, D. Halbgebauer, C. Tanzer, N. Pfahler, F. Rosenau
Veröffentlicht in: Antimicrobial research: Novel bioknowledge and educational programs, 2017
Herausgeber: A. Méndez-Vilas, Ed.