Discovery and validation of ‘epidrivers’ of cancer evolution and resistance to therapy

Veröffentlichungen

DNA methylation disruption reshapes the hematopoietic differentiation landscape

Autoren: Franco Izzo, Stanley C. Lee, Asaf Poran, Ronan Chaligne, Federico Gaiti, Baptiste Gross, Rekha R. Murali, Sunil D. Deochand, Chelston Ang, Philippa Wyndham Jones, Anna S. Nam, Kyu-Tae Kim, Steven Kothen-Hill, Rafael C. Schulman, Michelle Ki, Priscillia Lhoumaud, Jane A. Skok, Aaron D. Viny, Ross L. Levine, Ephraim Kenigsberg, Omar Abdel-Wahab, Dan A. Landau
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 52/4, 2020, Seite(n) 378-387, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-020-0595-4

Epigenetic evolution and lineage histories of chronic lymphocytic leukaemia

Autoren: Federico Gaiti, Ronan Chaligne, Hongcang Gu, Ryan M. Brand, Steven Kothen-Hill, Rafael C. Schulman, Kirill Grigorev, Davide Risso, Kyu-Tae Kim, Alessandro Pastore, Kevin Y. Huang, Alicia Alonso, Caroline Sheridan, Nathaniel D. Omans, Evan Biederstedt, Kendell Clement, Lili Wang, Joshua A. Felsenfeld, Erica B. Bhavsar, Martin J. Aryee, John N. Allan, Richard Furman, Andreas Gnirke, Catherine J. Wu,
Veröffentlicht in: Nature, 2019, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1198-z

Corrupted coordination of epigenetic modifications leads to diverging chromatin states and transcriptional heterogeneity in CLL

Autoren: Alessandro Pastore, Federico Gaiti, Sydney X. Lu, Ryan M. Brand, Scott Kulm, Ronan Chaligne, Hongcang Gu, Kevin Y. Huang, Elena K. Stamenova, Wendy Béguelin, Yanwen Jiang, Rafael C. Schulman, Kyu-Tae Kim, Alicia Alonso, John N. Allan, Richard R. Furman, Andreas Gnirke, Catherine J. Wu, Ari M. Melnick, Alexander Meissner, Bradley E. Bernstein, Omar Abdel-Wahab, Dan A. Landau
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-09645-5

Somatic mutations and cell identity linked by Genotyping of Transcriptomes

Autoren: Anna S. Nam, Kyu-Tae Kim, Ronan Chaligne, Franco Izzo, Chelston Ang, Justin Taylor, Robert M. Myers, Ghaith Abu-Zeinah, Ryan Brand, Nathaniel D. Omans, Alicia Alonso, Caroline Sheridan, Marisa Mariani, Xiaoguang Dai, Eoghan Harrington, Alessandro Pastore, Juan R. Cubillos-Ruiz, Wayne Tam, Ronald Hoffman, Raul Rabadan, Joseph M. Scandura, Omar Abdel-Wahab, Peter Smibert, Dan A. Landau
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 571/7765, 2019, Seite(n) 355-360, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1367-0

Integrating genetic and non-genetic determinants of cancer evolution by single-cell multi-omics

Autoren: Anna S. Nam, Ronan Chaligne, Dan A. Landau
Veröffentlicht in: Nature Reviews Genetics, 2020, ISSN 1471-0056
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41576-020-0265-5

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