Computational ONcology TRaining Alliance

Informacje na temat projektu

CONTRA

Identyfikator umowy o grant: 766030

DOI

10.3030/766030

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 31 Sierpnia 2017

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2018

Data zakończenia 30 Czerwca 2022

Finansowanie w ramach

EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Koszt całkowity

€ 3 863 978,28

Wkład UE

€ 3 863 978,28

3 863 978,28

Koordynowany przez

KUNGLIGA TEKNISKA HOEGSKOLAN
Sweden

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Software for phylogeny with migration

A software for analysing phylogeny in combination with migration.

Progression inference software

A software for progression inference for multiple tumors.

Resistance onset prediction model

A model for resistance onset prediction.

A first software for tumour phylogeny reconstruction

Software for tumour phylogeny reconstruction from mutations.

Resistance risk evaluation tool

A software tool for resistance risk evaluation.

Project communicating and promoting material, including web site.

Compilation of all project communicating and promoting material, including web site.

Communication and dissemination activities

Completion of all communication and dissemination activities

All recruitment measures

All recruitment measures finalized including advertising on web, Facebook, and standard media.

Experimentally validated relapse and metastasis drivers

A list of experimentally validated relapse and metastasis drivers

Growth rate and progression type based biomarker

A growth rate and progression type based biomarker for cancer

Experimentally validated cancer drivers

A list of experimentally validated cancer drivers

Time dependent mutation signatures

Time dependent cancer mutation signatures

CONTRA PhD Theses

Completion of all CONTRA PhD Theses

New biomarkers that inform treatment sensitivity

A list of new biomarkers that inform treatment sensitivity

Publikacje

CACTUS: integrating clonal architecture with genomic clustering and transcriptome profiling of single tumor cells

Autorzy: Shadi Darvish Shafighi; Szymon M. Kielbasa; Julieta Sepulveda-Yanez; Ramin Monajemi; Davy Cats; Hailiang Mei; Roberta Menafra; Susan L. Kloet; Hendrik Veelken; Cornelis A.M. van Bergen; Ewa Szczurek
Opublikowane w: Genome Medicine, Numer 4, 2021, ISSN 1471-2458
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1101/2020.06.05.134452

Integrative radiogenomics for virtual biopsy and treatment monitoring in ovarian cancer.

Autorzy: Paula Martin-Gonzalez; Mireia Crispin-Ortuzar; Leonardo Rundo; Maria Delgado-Ortet; Marika Reinius; Lucian Beer; Ramona Woitek; Stephan Ursprung; Helen Addley; Helen Addley; James D. Brenton; Florian Markowetz; Evis Sala
Opublikowane w: Insights into Imaging, Vol 11, Iss 1, Pp 1-10 (2020), Numer 4, 2020, ISSN 1869-4101
Wydawca: Springer Science and Business Media Deutschland GmbH
DOI: 10.17863/cam.74310

Bayesian non-parametric clustering of single-cell mutation profiles

Autorzy: Nico Borgsmüller; Nico Borgsmüller; Jose Bonet; Francesco Marass; Francesco Marass; Abel Gonzalez-Perez; Nuria Lopez-Bigas; Niko Beerenwinkel; Niko Beerenwinkel
Opublikowane w: Bioinformatics, Numer Volume 36, Numer 19, 2020, Strona(/y) 4854–4859, ISSN 1367-4803
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2020.01.15.907345

Pan-cancer detection of driver genes at the single-patient resolution.

Autorzy: Joel Nulsen; Hrvoje Misetic; Christopher Yau; Francesca D. Ciccarelli
Opublikowane w: Genome Medicine, Numer 9, 2021, ISSN 1756-994X
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13073-021-00830-0

DeepMP: a deep learning tool to detect DNA base modifications on Nanopore sequencing data

Autorzy: Jose Bonet; Mandi Chen; Mandi Chen; Marc Dabad; Simon Heath; Abel Gonzalez-Perez; Nuria Lopez-Bigas; Nuria Lopez-Bigas; Jens Lagergren; Jens Lagergren
Opublikowane w: Bioinformatics, Numer Volume 38, Numer 5,, 2021, Strona(/y) 1235–1243, ISSN 1367-4803
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2021.06.28.450135

Cell Abundance Aware Deep Learning For Cell Detection On Highly Imbalanced Pathological Data

Autorzy: Yeman Brhane Hagos; Catherine S. Y. Lecat; Dominic Patel; Lydia Lee; Thien-An Tran; Manuel Rodriguez–Justo; Kwee Yong; Yinyin Yuan
Opublikowane w: ISBI, Numer 10, 2021
Wydawca: IEEE
DOI: 10.1109/isbi48211.2021.9433994

ConCORDe-Net: Cell Count Regularized Convolutional Neural Network for Cell Detection in Multiplex Immunohistochemistry Images

Autorzy: Hagos, Yeman Brhane; Narayanan, Priya Lakshmi; Akarca, Ayse U.; Marafioti, Teresa; Yuan, Yinyin
Opublikowane w: Numer 7, 2019
Wydawca: Springer

ConCORDe-Net: Cell Count Regularized Convolutional Neural Network for Cell Detection in Multiplex Immunohistochemistry Images

Autorzy: Yeman Brhane Hagos; Priya Narayanan; Ayse U. Akarca; Teresa Marafioti; Yinyin Yuan
Opublikowane w: MICCAI (1), Numer 2, 2019
Wydawca: Springer
DOI: 10.1007/978-3-030-32239-7_74

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Rezultaty

Publikacje

Pobierz Pobierz zawartość strony