Past, present and future of turbid reefs in the Coral Triangle

Projektinformationen

4D_REEF

ID Finanzhilfevereinbarung: 813360

DOI

10.3030/813360

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 6 Mai 2019

Startdatum 1 September 2019

Enddatum 29 Februar 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 4 039 155,72

EU-Beitrag

€ 4 039 155,72

Koordiniert durch

STICHTING NATURALIS BIODIVERSITY CENTER
Netherlands

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Other (4)

Each ESR has presented results at 2 international conferences

Scientific deliverable - Each ESR has presented results at 2 international conferences

Topical session at European Geoscience Union

D2 Topical session at the Asia Pacific Coral Reef Symposium

Award ceremony for best 3 minute video, blog entry, research paper, and visualisation

D4 Award ceremony for best 3 minute video, blog entry, research paper, and visualisation

Each ESR has published at least 2 blogs

D3 Each ESR has published at least 2 blogs

Open Research Data Pilot (1)

All datasets published in suitable repositories

Scientific deliverable - All datasets published in suitable repositories

Documents, reports (1)

Each ESR published at least 1 first authored and 2 co-authored publications

Scientific deliverable - Each ESR published at least 1 first authored and 2 co-authored publications

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

4D-REEF website operative

The website for 4D-REEF website is in operation.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (24)

High diversity of benthic cyanobacterial mats on coral reefs of Koh Tao, Gulf of Thailand

Autoren: Stuij, T. M., Cleary, D. F., Gomes, N. C.M., Mehrotra, R., Visser, P. M., Speksnijder, A. G., and Hoeksema, B. W.
Veröffentlicht in: Coral Reefs, 2023, ISSN 0722-4028
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00338-022-02304-0

Single-Cell Genomics Reveals the Divergent Mitochondrial Genomes of Retaria (Foraminifera and Radiolaria)

Autoren: Macher, J.-N., Coots, N.L., Poh, Y.-P., Girard, E.B., Langerak, A., Muñoz-Gómez, S.A., Sinha, S.D., Jirsová, D., Vos, R., Wissels, R., Gile, G.H., Renema, W., Wideman, J.G.
Veröffentlicht in: MBio, Ausgabe 14, 2023, Seite(n) e0030223, ISSN 2150-7511
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.00302-23

Is the Coral Triangle’s future shown in a Pliocene reef gap?

Autoren: Harrison, G.W.M., Santodomingo, N., Johnson, K.G. Renema, W.
Veröffentlicht in: Coral Reefs, Ausgabe 42, 2023, Seite(n) 1219–1225, ISSN 1432-0975
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s00338-023-02412-5

Exploring Prokaryotic Communities in the Guts and Mucus of Nudibranchs, and Their Similarity to Sediment and Seawater Microbiomes

Autoren: Tamara Stuij, Daniel F. R. Cleary, Ana R. M. Polónia, Sumaitt Putchakarn, Ana C. C. Pires, Newton C. M. Gomes & Nicole J. de Voogd
Veröffentlicht in: Current Microbiology, Ausgabe 80, 2023, ISSN 0343-8651
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00284-023-03397-8

Impacts of humic substances, elevated temperature, and UVB radiation on bacterial communities of the marine sponge Chondrilla sp

Autoren: Tamara M Stuij, Daniel F R Cleary, Rui J M Rocha, Ana R M Polónia, Davide A M Silva, Antonio Louvado, Nicole J de Voogd, Newton C M Gomes
Veröffentlicht in: FEMS Microbiology Ecology, Ausgabe 100/3, 2024, ISSN 0168-6496
Herausgeber: Blackwell
DOI: 10.1093/femsec/fiae022

The hydrological cycle and ocean circulation of the Maritime Continent in the Pliocene: results from PlioMIP2

Autoren: Ren, X., Lunt, D. J., Hendy, E., von der Heydt, A., Abe-Ouchi, A., Otto-Bliesner, B., Williams, C. J. R., Stepanek, C., Guo, C., Chandan, D., Lohmann, G., Tindall, J. C., Sohl, L. E., Chandler, M. A., Kageyama, M., Baatsen, M. L. J., Tan, N., Zhang, Q., Feng, R., Hunter, S., Chan, W.-L., Peltier, W. R., Li, X., Kamae, Y., Zhang, Z., and Haywood, A. M.
Veröffentlicht in: Climate of the Past, Ausgabe 19, 2023, Seite(n) 2053-2077, ISSN 1814-9332
Herausgeber: Gottingen Copernicus Publishers
DOI: 10.5194/cp-19-2053-2023,2023

Dynamics of large benthic foraminiferal assemblages: A tool to foreshadow reef degradation?

Autoren: Girard, E.B., Estradivari, Ferse, S., Ambo-Rappe, R., Jompa, J., Renema, W.
Veröffentlicht in: Science of the Total Environment, Ausgabe 811, 2022, Seite(n) 151396, ISSN 1879-1026
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.scitotenv.2021.151396

Limited Progress in Improving Gender and Geographic Representation in Coral Reef Science

Autoren: Gabby N. Ahmadia, Samantha H. Cheng, Dominic A. Andradi-Brown, Stacy K. Baez, Megan D. Barnes, Nathan J. Bennett, Stuart J. Campbell, Emily S. Darling, Estradivari, David Gill, Erika Gress, Georgina G. Gurney, Vera Horigue, Raymond Jakub, Emma V. Kennedy, Shauna L. Mahajan, Sangeeta Mangubhai, Shayle B. Matsuda, Nyawira A. Muthiga, Michael O. Navarro, Nadia Santodomingo, Henri Vallès, Laura Veve
Veröffentlicht in: Frontiers in Marine Science, Ausgabe 8, 2021, ISSN 2296-7745
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmars.2021.731037

Seeing the Forest for the Trees: Mapping Cover and Counting Trees from Aerial Images of a Mangrove Forest Using Artificial Intelligence

Autoren: Schürholz D, Castellanos-Galindo GA, Casella E, Mejía-Rentería JC, Chennu A
Veröffentlicht in: Remote Sensing, Ausgabe 15, 2023, Seite(n) 3334, ISSN 2072-4292
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/rs15133334

Hynes, M.G., O’Dea, A., Webster, J.M. and Renema, W., 2024. RADReef: A global Holocene Reef Rate of Accretion Dataset. Scientific Data, 11(1), p.398.

Autoren: Hynes, M.G., O’Dea, A., Webster, J.M. and Renema, W
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 11, 2024, Seite(n) 398, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1038/s41597-024-03228-w

Watching out for coral reefs with forams

Autoren: Elsa B Girard Willem Renema
Veröffentlicht in: Frontiers for Young Minds, Ausgabe 12, 2024, Seite(n) 1122119, ISSN 2296-6846
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/frym.2024.1122119

Marine conservation beyond MPAs: Towards the recognition of other effective area-based conservation measures (OECMs) in Indonesia.

Autoren: Estradivari, Agung, Muh Firdaus Adhuri, Dedi Supriadi Ferse, Sebastian C. A. Sualia, Ita Andradi-Brown, Dominic A. Campbell, Stuart J. Iqbal, Mohamad Jonas, Harry D. Lazuardi, Muhammad Erdi Nanlohy, Hellen Pakiding, Fitryanti Pusparini, Ni Kadek Sri Ramadhana, Hikmah C. Ruchimat, Toni Santiadji, I. Wayan Veda Timisela, Natelda R. Veverka, Laura Ahmadia, Gabby N.
Veröffentlicht in: Marine Policy, Ausgabe 137, 2022, Seite(n) 104939, ISSN 0308-597X
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.marpol.2021.104939

First report of mitochondrial COI in foraminifera and implications for DNA barcoding

Autoren: Macher, J.-N., Wideman, J.G., Girard, E.B., Langerak, A., Duijm, E., Jompa, J., Sadekov, A., Vos, R., Wissels, R., Renema, W., 2021. First report of mitochondrial COI in foraminifera and implications for DNA barcoding. Sci. Rep. 11, 1–9.
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 11, 2021, Seite(n) 1-9, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-01589-5

Cryptic Diversity of Mediterranean <scp><i>Neogoniolithon</i></scp> (Corallinales, Corallinophycidae, Rhodophyta)

Autoren: Dino Angelo E. Ramos, Jesús Del Río, Julio Peñas, Viviana Peña, Juan C. Braga
Veröffentlicht in: Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, Ausgabe 34, 2024, ISSN 1052-7613
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/aqc.4255

Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) metabarcoding of Foraminifera communities using taxon-specific primers.

Autoren: Macher, J.-N., Bloska, D.M., Holzmann, M., Girard, E.B., Pawlowski, J., Renema, W
Veröffentlicht in: PeerJ, 2022, Seite(n) e13952, ISSN 2689-7733
Herausgeber: PeerJ publishing
DOI: 10.7717/peerj.13952

Simulation of the mid-Pliocene Warm Period using HadGEM3: experimental design and results from model–model and model–data comparison

Autoren: Charles J. R. Williams, Alistair A. Sellar, Xin Ren, Alan M. Haywood, Peter Hopcroft, Stephen J. Hunter, William H. G. Roberts, Robin S. Smith, Emma J. Stone, Julia C. Tindall, Daniel J. Lunt
Veröffentlicht in: Climate of the Past, Ausgabe 17/5, 2021, Seite(n) 2139-2163, ISSN 1814-9332
Herausgeber: European Geosciences Union
DOI: 10.5194/cp-17-2139-2021

A standardized database of Last Interglacial (MIS 5e) sea-level indicators in Southeast Asia

Autoren: Kathrine Maxwell, Hildegard Westphal, Alessio Rovere
Veröffentlicht in: Earth System Science Data, Ausgabe 13/9, 2021, Seite(n) 4313-4329, ISSN 1866-3516
Herausgeber: Copernicus Publications
DOI: 10.5194/essd-13-4313-2021

The rapid expansion of Indonesia's marine protected area requires improvement in management effectiveness

Autoren: Amkieltiela, Handayani CN, Andradi-Brown DA, Estradivari, Ford AK, Berger M, Hakim A, Muenzel DK, Carter E, Agung F, Veverka L, Iqbal M, Lazuardi ME, Fauzi MN, Tranter SN, Ahmadia GN.
Veröffentlicht in: Marine Policy, 2022, Seite(n) 105257, ISSN 0308-597X
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.marpol.2022.105257

Mitochondrial Cytochrome Oxidase Subunit 1: A Promising Molecular Marker for Species Identification in Foraminifera

Autoren: Girard, E.B., Langerak, A., Jompa, J., Wangensteen, O.S., Macher, J.-N., Renema, W
Veröffentlicht in: Frontiers in Marine Science, Ausgabe 9, 2022, Seite(n) 809659, ISSN 2296-7745
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2022.809659

Digitizing the coral reef: Machine learning of underwater spectral images enables dense taxonomic mapping of benthic habitats

Autoren: Schürholz, D., & Chennu, A.
Veröffentlicht in: Methods in Ecology and Evolution, Ausgabe 14, 2023, Seite(n) 596–613, ISSN 2041-210X
Herausgeber: John Wiley and Sons Inc.
DOI: 10.1111/2041-210x.14029

The Punta de la Mona Rhodolith Bed: Shallow-Water Mediterranean Rhodoliths (Almuñecar, Granada, Southern Spain)

Autoren: Del Río J, Ramos DA, Sánchez-Tocino L, Peñas J and Braga JC
Veröffentlicht in: Frontiers in Earth Sciences, Ausgabe 10:884685, 2022, ISSN 2296-6463
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/feart.2022.884685

Rutterford, A., Bertini, L., Hendy, E. J., Johnson, K. G., Summerfield, R., & Burghardt, T. (2022). Towards the analysis of coral skeletal density-banding using deep learning. SN Applied Sciences, 4(2), 38

Autoren: Rutterford, A., Bertini, L., Hendy, E. J., Johnson, K. G., Summerfield, R., & Burghardt, T.
Veröffentlicht in: SN Applied Sciences, Ausgabe 42, 2022, Seite(n) 38, ISSN 2523-3971
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s42452-021-04912-x

The annelid community of a natural deep-sea whale fall off eastern Australia

Autoren: Georgieva, M.N., Wiklund, H., Ramos, D.A., Neal, L., Glasby, C.J., Gunton, L.M.
Veröffentlicht in: Records of the Australian Museum, Ausgabe 75, 2023, Seite(n) 167-213, ISSN 2201-4349
Herausgeber: Australian Museum
DOI: 10.3853/j.2201-4349.75.2023.1800

COI metabarcoding of large benthic Foraminifera: Method validation for application in ecological studies

Autoren: Girard, E.B., Macher, J.-N., Jompa, J., Renema, W.
Veröffentlicht in: Ecology and Evolution, Ausgabe 12, 2022, Seite(n) e9549, ISSN 2045-7758
Herausgeber: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.9549

Other (1)

Quaternary coral, coralline algal and vermetid assemblages as sea-level indicators: a review

Autoren: Juan C. Braga, Marc Humblet, Dino Angelo E. Ramos, Belinda Dechnik, Jody M. Webster
Veröffentlicht in: Coral Reefs and Sea-Level Change: Quaternary Records and Modelling, 2022, Seite(n) 1-38, ISBN 978-1-7398845-1-2
Herausgeber: IAS
DOI: 10.54780/iassp49/01