Projektbeschreibung
Hochauflösende Bildgebung der Chromatinduplikation
Der Prozess der DNA-Replikation ist streng reguliert, um fehlerhafte Kontrollmechanismen zu verhindern, da diese mit der Bildung von Zellanomalien und genetischen Erkrankungen, einschließlich der Krebsentstehung, in Zusammenhang stehen. Jüngste Studien haben ergeben, dass der Duplikation des eukaryotischen Genoms bestimmte Schritte vorausgehen. Bisherige Strukturuntersuchungen umfassen die Bildgebung von isolierten Replikationsschritten anhand von vereinfachten linearen Doppelstrang-DNA-Matrizen. Das natürliche Substrat der eukaryotischen Replikationsmaschinerie ist jedoch ein kompaktes Chromatin. Das EU-finanzierte Projekt CRYOREP wird eigens entwickelte Protokolle anwenden und mit der Kryo-Elektronenmikroskopie kombinieren, um biochemische Experimente durchzuführen. Ziel dabei ist es, die Chromatinduplikation hochauflösend darzustellen.
Ziel
In eukaryotic cells, DNA replication is tightly regulated to ensure that the genome is duplicated only once per cell cycle. Errors in the control mechanisms that regulate chromosome ploidy cause genomic instability, which is linked to the development of cellular abnormalities, genetic disease and the onset of cancer. Recent reconstitution experiments performed with purified proteins revealed that initiation of eukaryotic genome duplication requires three distinct steps. First, DNA replication start sites are identified and targeted for the loading of an inactive MCM helicase motor, which encircles the double helix. Second, MCM activators are recruited, causing duplex-DNA untwisting. Third, upon interaction with a firing factor, the MCM ring opens to eject one DNA strand, leading to unwinding of the replication fork and duplication by dedicated replicative polymerases. These three events are not understood at a molecular level. Structural investigations so far aimed at imaging artificially isolated replication steps and used simplified templates, such as linear duplex DNA to study helicase loading or pre-formed forks to understand unwinding. However, the natural substrate of the eukaryotic replication machinery is not DNA but rather chromatin, formed of nucleosome arrays that compact the genome. Chromatin plays important regulatory roles in all steps of DNA replication, by dictating origin start-site selection and stimulating replication fork progression. Only by studying chromatin replication, we argue, will we understand the molecular basis of genome propagation. To this end, we have developed new protocols to perform visual biochemistry experiments under the cryo-electron microscope, to image chromatin duplication at high resolution, frozen as it is being catalysed. Using these strategies we want to generate a molecular movie of the entire replication reaction. Our achievements will change the way we think about genome stability in eukaryotic cells.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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