Precision Docking of Very Large DNA Cargos in Mammalian Genomes

Projektinformationen

DNA-DOCK

ID Finanzhilfevereinbarung: 834631

DOI

10.3030/834631

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 22 Mai 2019

Startdatum 1 September 2019

Enddatum 28 Februar 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 498 578,00

EU-Beitrag

€ 2 498 578,00

Koordiniert durch

UNIVERSITY OF BRISTOL
United Kingdom

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (14)

Bottom-up assembly of viral replication cycles

Autoren: Oskar Staufer, Gösta Gantner, Ilia Platzman, Klaus Tanner, Imre Berger, Joachim P. Spatz
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33661-7

Coenzyme Q10 protects keratinocytes against oxidation-induced energy stress as revealed by spatiotemporal analysis of cell energetics

Autoren: Roland Abi Nahed, Ali Hussein, Cécile Cottet-Rousselle, Alexandra Vogelsang, Francesco Aulicino, Imre Berger, Thomas Blatt, Julia M. Weise, Uwe Schlattner
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-025-98793-4

Tuning VSV-G Expression Improves Baculovirus Integrity, Stability and Mammalian Cell Transduction Efficiency

Autoren: Martina Mattioli, Renata A. Raele, Gunjan Gautam, Ufuk Borucu, Christiane Schaffitzel, Francesco Aulicino, Imre Berger
Veröffentlicht in: Viruses, Ausgabe 16, 2025, Seite(n) 1475, ISSN 1999-4915
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v16091475

Genome editing and kidney health

Autoren: Nadia Tavakolidakhrabadi, Francesco Aulicino, Carl J May, Moin A Saleem, Imre Berger, Gavin I Welsh
Veröffentlicht in: Clinical Kidney Journal, Ausgabe 17, 2024, ISSN 2048-8505
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/ckj/sfae119

Engineering the ADDobody protein scaffold for generation of high-avidity ADDomer super-binders

Autoren: Dora Buzas, Huan Sun, Christine Toelzer, Sathish K.N. Yadav, Ufuk Borucu, Gunjan Gautam, Kapil Gupta, Joshua C. Bufton, Julien Capin, Richard B. Sessions, Frederic Garzoni, Imre Berger, Christiane Schaffitzel
Veröffentlicht in: Structure, Ausgabe 32, 2026, Seite(n) 342-351.e6, ISSN 0969-2126
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.str.2023.12.010

An engineered baculoviral protein and DNA co-delivery system for CRISPR-based mammalian genome editing

Autoren: Julien Capin; Alexandra Harrison; Renata A Raele; Sathish K N Yadav; Dominique Baiwir; Gabriel Mazzucchelli; Loic Quinton; Timothy J Satchwell; Ashley M Toye; Christiane Schaffitzel; Imre Berger; Francesco Aulicino
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 52(6), 2024, Seite(n) 3450–3468, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae142

Unlocking the effective alliance of β-lapachone and hydroxytyrosol against triple-negative breast cancer cells

Autoren: Jesús Calahorra, José L. Blaya-Cánovas, Olivia Castellini-Pérez, Ernesto Aparicio-Puerta, Candela Cives-Losada, Jose J.G. Marin, Markel Rementeria, Francisca E. Cara, Araceli López-Tejada, Carmen Griñán-Lisón, Francesco Aulicino, Imre Berger, Juan A. Marchal, Violeta Delgado-Almenta, Sergio Granados-Principal
Veröffentlicht in: Biomedicine & Pharmacotherapy, Ausgabe 174, 2026, Seite(n) 116439, ISSN 0753-3322
Herausgeber: Elsevier Masson
DOI: 10.1016/j.biopha.2024.116439

Microfluidic production and characterization of biofunctionalized giant unilamellar vesicles for targeted intracellular cargo delivery

Autoren: Oskar Staufer, Silvia Antona, Dennis Zhang, Júlia Csatári, Martin Schröter, Jan-Willi Janiesch, Sebastian Fabritz, Imre Berger, Ilia Platzman, Joachim P. Spatz
Veröffentlicht in: Biomaterials, Ausgabe 264, 2025, Seite(n) 120203, ISSN 0142-9612
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.biomaterials.2020.120203

The MultiBac BEVS: Basics, applications, performance and recent developments

Autoren: Barbara Gorda, Christine Toelzer, Francesco Aulicino, Imre Berger
Veröffentlicht in: Methods in Enzymology, Ausgabe 00766879, 2021, Seite(n) 129-154, ISSN 0076-6879
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/bs.mie.2021.06.018

The free fatty acid–binding pocket is a conserved hallmark in pathogenic β-coronavirus spike proteins from SARS-CoV to Omicron

Autoren: Christine Toelzer, Kapil Gupta, Sathish K. N. Yadav, Lorna Hodgson, Maia Kavanagh Williamson, Dora Buzas, Ufuk Borucu, Kyle Powers, Richard Stenner, Kate Vasileiou, Frederic Garzoni, Daniel Fitzgerald, Christine Payré, Gunjan Gautam, Gérard Lambeau, Andrew D. Davidson, Paul Verkade, Martin Frank, Imre Berger, Christiane Schaffitzel
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 8, 2024, ISSN 2375-2548
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.adc9179

Synthetic Virus-Derived Nanosystems (SVNs) for Delivery and Precision Docking of Large Multifunctional DNA Circuitry in Mammalian Cells

Autoren: Francesco Aulicino, Julien Capin, Imre Berger
Veröffentlicht in: Pharmaceutics, Ausgabe 12/8, 2020, Seite(n) 759, ISSN 1999-4923
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/pharmaceutics12080759

Highly efficient CRISPR-mediated large DNA docking and multiplexed prime editing using a single baculovirus

Autoren: Francesco Aulicino; Martin Pelosse; Christine Toelzer; Julien Capin; Erwin Ilegems; Parisa Meysami; Ruth Rollarson; Per-Olof Berggren; Mark Simon Dillingham; Christiane Schaffitzel; Moin A Saleem; Gavin I Welsh; Imre Berger
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 50/13, 2022, Seite(n) 7783–7799, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac587

Cryo-EM reveals binding of linoleic acid to SARS-CoV-2 spike glycoprotein, suggesting an antiviral treatment strategy

Autoren: Christine Toelzer, Kapil Gupta, Imre Berger, Christiane Schaffitzel
Veröffentlicht in: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Ausgabe 79, 2025, Seite(n) 111-121, ISSN 2059-7983
Herausgeber: International Union of Crystallography (IUCr)
DOI: 10.1107/s2059798323000049

<i>In vitro</i> generated antibodies guide thermostable ADDomer nanoparticle design for nasal vaccination and passive immunization against SARS-CoV-2

Autoren: Dora Buzas; Adrian H Bunzel; Oskar Staufer; Emily J Milodowski; Grace L Edmunds; Joshua C Bufton; Beatriz V Vidana Mateo; Sathish K N Yadav; Kapil Gupta; Charlotte Fletcher; Maia K Williamson; Alexandra Harrison; Ufuk Borucu; Julien Capin; Ore Francis; Georgia Balchin; Sophie Hall; Mirella V Vega; Fabien Durbesson; Srikanth Lingappa; Renaud Vincentelli; Joe Roe; Linda Wooldridge; Rachel Burt; Ross
Veröffentlicht in: Antibody Therapeutics, Ausgabe 6, 2023, Seite(n) 277–297, ISSN 2516-4236
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/abt/tbad024

Thesis and dissertations (3)

SynBac: minimal synthetic baculovirus genomes

Autoren: Barbara Gorda
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) Entire Thesis
Herausgeber: University of Bristol

A Baculoviral ‘Swag Bag’ Protein and DNA Delivery Toolkit for CRISPR-based Editing of Human Genomes

Autoren: Julien Capin
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) Entire Thesis
Herausgeber: University of Bristol

Harnessing Baculoviruses for Gene Therapy: A Protein Delivery ApproachAlexandra Harrison

Autoren: Alexandra Harrison
Veröffentlicht in: 2024
Herausgeber: University of Bristol

Book chapters (2)

FRET-Based Sensor for Measuring Adenine Nucleotide Binding to AMPK

Autoren: Roland Abi Nahed, Martin Pelosse, Francesco Aulicino, Florine Cottaz, Imre Berger, Uwe Schlattner
Veröffentlicht in: Methods in Molecular Biology, Nutrient Sensing in Eukaryotes, 2025, Seite(n) 15-45
Herausgeber: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4284-9_2

Assembly of Baculovirus Vectors for Multiplexed Prime Editing

Autoren: Francesco Aulicino, Renata A. Raele, Alexandra Harrison, Imre Berger
Veröffentlicht in: Methods in Molecular Biology, Baculovirus, 2024, Seite(n) 301-327
Herausgeber: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-3961-0_24

Other (2)

Antibodies generated <i>in vitro</i> and <i>in vivo</i> elucidate design of a thermostable ADDomer COVID-19 nasal nanoparticle vaccine

Autoren: Dora Buzas, H Adrian Bunzel, Oskar Staufer, Emily J Milodowski, Grace L Edmunds, Joshua C Bufton, Beatriz V Vidana Mateo, Sathish K N Yadav, Kapil Gupta, Charlotte Fletcher, Maia Kavanagh Williamson, Alexandra Harrison, Ufuk Borucu, Julien Capin, Ore Francis, Georgia Balchin, Sophie Hall, Mirella Vivoli Vega, Fabien Durbesson, Renaud Vincentelli, Joe Roe, Linda Wooldridge, Rachel Burt, J L Ross An
Veröffentlicht in: 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2023.03.17.533092

Baculovirus-vectored precision delivery of large DNA cargoes in human genomes

Autoren: Francesco Aulicino, Martin Pelosse, Christine Toelzer, Julien Capin, Parisa Meysami, Mark Simon Dillingham, Christiane Schaffitzel, Imre Berger
Veröffentlicht in: 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2020.08.17.253898