Descrizione del progetto
Rimodellare le ribonucleoproteine nello sviluppo e nelle malattie
Una ribonucleoproteina (RNP) è un complesso di acido ribonucleico e di una proteina legante l’RNA. Questi complessi svolgono un ruolo fondamentale nelle funzioni biologiche importanti tra cui la replicazione del DNA, la regolazione dell’espressione genica e il metabolismo dell’RNA. Alcune mutazioni che provocano il cancro o malattie neurodegenerative (quali la sclerosi laterale amiotrofica) si verificano nelle proteine leganti l’RNA. Queste mutazioni sono concentrate nelle zone intrinsecamente disordinate delle proteine prive di una struttura in 3D ben definita ma che svolgono un ruolo importante nella regolazione proteica, compresi l’assemblaggio e lo smontaggio delle RNP. Il progetto RNPdynamics, finanziato dall’UE, costruirà modelli di metodi sperimentali e di calcolo per studiare i meccanismi di rimodellamento delle RNP e per scoprire in che modo tali dinamiche delle RNP contribuiscano alle transizioni cellulari nello sviluppo e nelle malattie.
Obiettivo
Ribonucleoprotein complexes (RNPs) play many key regulatory roles in development. Moreover, mutations causing cancer or neurodegenerative diseases, such as amyotrophic lateral sclerosis (ALS), often occur in RNA-binding proteins (RBPs). These mutations are concentrated in the intrinsically disordered regions (IDRs), which play a central role in the control of RNP assembly and disassembly. RNP dynamics is often driven by multivalent interactions that are mediated by multiple elements within IDRs of RBPs, which can condense the RNP such that it separates from the surrounding liquid through the phenomenon of liquid-liquid phase separation. Transcriptomic insights into the physiological functions of such multivalent RNP assembly are needed to understand their regulation, or deregulation through disease-causing mutations. Here, we will build a framework of experimental and computational methods to study the mechanisms by which the dynamic multivalent interactions drive RNP remodelling, and how such RNP dynamics contributes to cellular transitions in development and disease. The first objective will be to identify the functions of specific RBPs in cell-state transitions during neuronal differentiation, and the mechanisms of IDR-mediated multivalent interactions in these functions. The next objective will be to establish new tools to manipulate RNP assembly through multivalent RNA binding sites and IDRs. Finally, the new insights and tools will be integrated with the goal to fine-tune the RNP assembly of ALS-mutant RBPs, and thereby ameliorate their toxicity.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- scienze naturaliscienze biologichegeneticamutazione
- scienze mediche e della salutemedicina clinicaoncologia
- scienze naturaliscienze biologichegeneticaRNA
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(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-ADG
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1000 Ljubljana
Slovenia