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NEW METHOD TO ACTIVATE STREPTOMYCES SECONDARY METABOLISM CRYPTIC PATHWAYS

Projektbeschreibung

Eingriffe in den Stoffwechsel von Streptomyces öffnen neue Wege zur Wirkstoffentdeckung

Die Bakteriengattung Streptomyces ist bekannt dafür, dass sie natürliche und therapeutische Stoffe bilden kann. Eine Genomannotation der Streptomyces lässt auf verborgene sekundäre Stoffwechselwege schließen, die bei traditionellen Screeningmethoden nicht erkennbar sind. Im Rahmen des EU-finanzierten Projekts StrepCryptPath hat nun ein wissenschaftliches Team einen mutierten Stamm der Streptomyces coelicolor gefunden, dem ein bestimmter Regulator für Differenzierung und sekundären Stoffwechsel fehlt. Dieser Stamm kann über seinen gesamten Entwicklungszyklus hinweg sekundäre Stoffwechselprodukte bilden, einschließlich Verbindungen, die in verschiedenen verborgenen Pfaden kodiert sind. Darum arbeitet das Team nun an Strategien, um den in den Streptomyces konservierten Regulator auszuschalten, in der Annahme, dass sich dadurch der sekundäre Stoffwechsel der Streptomyces aktiviert. Sollte dies erfolgreich sein, könnte der neue Ansatz die Entdeckung neuer sekundärer Stoffwechselprodukte revolutionieren.

Ziel

The aim of the StrepCrypPath is to test the industrial potential of a new approach to enhance Streptomyces secondary metabolism, discovered in our ERC-StG Strp-differentiation (280304) project. We discovered a pleiotropic regulator of differentiation and secondary metabolism in the S. coelicolor model strain. The S. coelicolor strain lacking this regulator is the first Streptomyces reported to produce secondary metabolites during its whole developmental cycle, including germination, the exponential growth phase and the stationary stage. S. coelicolor encodes 30 secondary metabolites, but only two are produced in high amounts under the culture conditions used in our lab. The expression of 15 secondary metabolite clusters (50% of the total), including 6 predicted to participate in secondary metabolite biosynthesis never observed in the lab (cryptic pathways), is activated/enhanced, in our mutant.

The gene encoding this new regulator is highly conserved in Streptomyces. We will explore if the inactivation of the orthologues of this regulatory gene in industrial streptomycetes causes the same phenotype observed in S. coelicolor: secondary metabolism and cryptic pathway activation. We will create integrative conjugative plasmids harbouring antisense mRNAs to inactivate this gene. We do not expect that this method will enhance and/or activate all secondary metabolite clusters. However, if as it happens in S. coelicolor, we can activate/enhance 50% of the secondary metabolite pathways, including several cryptic pathways, in any streptomycete, we can revolutionise the screening for new secondary metabolites from streptomycetes.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

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Schlüsselbegriffe

Programm/Programme

Thema/Themen

Finanzierungsplan

ERC-POC - Proof of Concept Grant

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2018-PoC

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Gastgebende Einrichtung

UNIVERSIDAD DE OVIEDO
Netto-EU-Beitrag
€ 150 000,00
Adresse
CALLE SAN FRANCISCO 3
33003 OVIEDO
Spanien
Region
Noroeste Principado de Asturias Asturias
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
€ 150 000,00

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