Leistungen
For standardized MTD assessments in drug combination studies
Performance of the segmentation and IG approach on images.Trained network and report on performance of the segmentation and IG approach on images.
Quality plan & risk registryQuality plan & risk registry, used to monitor risks and assess quality/timing of results.
Data Integration ReportData integration report Describing the data integration process from existing datasets from CTs
Dissemination Plan, describing the actions foreseen for dissemination and reporting on the dissemination framework established for the project.
Data management database with front end ready.
Bayesian modelling framework for predicting drug synergiesAn open-source software implementation of the developed Bayesian modelling framework for predicting drug synergistic effects in drug combination experiments
The DMP needs to be updated over the course of the project whenever significant changes arise, such as (but not limited to): - new data - changes in consortium policies (e.g. new innovation potential, decision to file for a patent) - changes in consortium composition and external factors (e.g. new consortium members joining or old members leaving).
Veröffentlichungen
Autoren:
Aleix Prat; Anwesha Chaudhury; Nadia Solovieff; Laia Paré; D. Martinez; Nuria Chic; Olga Martínez-Sáez; Fara Brasó-Maristany; Agnes Lteif; Tetiana Taran; Naveen Babbar; Fei Su
Veröffentlicht in:
J Clin Oncol., Ausgabe 1, 2021, ISSN 1527-7755
Herausgeber:
American Society of Clinical Oncology
DOI:
10.1200/jco.20.02977
Autoren:
Xiaoran Lai; Håkon A. Taskén; Torgeir Mo; Simon W. Funke; Arnoldo Frigessi; Arnoldo Frigessi; Marie E. Rognes; Alvaro Köhn-Luque
Veröffentlicht in:
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, Ausgabe 16, 2021, Seite(n) e3542, ISSN 2040-7939
Herausgeber:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.48550/arxiv.2105.00448
Autoren:
Leiv Rønneberg, Andrea Cremaschi, Robert Hanes, Jorrit M Enserink, Manuela Zucknick
Veröffentlicht in:
Briefings in Bioinformatics, 2021, ISSN 1467-5463
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bib/bbab251
Autoren:
Aleix Prat, Yi-Hsuan Tsai, Tomás Pascual, Laia Paré, Barbara Adamo, Maria Vidal, Fara Brasó-Maristany, Patricia Galván, Jan Christoph Brase, Vanessa Rodrik-Outmezguine, Stephen Johnston, Eva Ciruelos, Joel S. Parker
Veröffentlicht in:
Clinical Cancer Research, Ausgabe 26/23, 2020, Seite(n) 6141-6148, ISSN 1078-0432
Herausgeber:
American Association for Cancer Research
DOI:
10.1158/1078-0432.ccr-20-2793
Autoren:
Susana García-Recio; Aatish Thennavan; Michael P. East; Joel S. Parker; Juan Miguel Cejalvo; Joseph P. Garay; Daniel P. Hollern; Xiaping He; Kevin R. Mott; Patricia Galván; Cheng Fan; Sara R. Selitsky; Alisha R. Coffey; David Marron; Fara Brasó-Maristany; Octavio Burgues; Joan Albanell; Federico Rojo; Ana Lluch; Eduardo Martínez de Dueñas; Jeffery M. Rosen; Gary L. Johnson; Lisa A. Carey; Ale
Veröffentlicht in:
instname:, Ausgabe 12, 2020, ISSN 0021-9738
Herausgeber:
American Society for Clinical Investigation
DOI:
10.1172/jci130323
Autoren:
Francesco Schettini, Elia Seguí, Benedetta Conte, Esther Sanfeliu, Blanca Gonzalez-Farre , Pedro Jares , Sergi Vidal-Sicart , Sergi Ganau , Isaac Cebrecos, Fara Brasó-Maristany , Montserrat Muñoz, Aleix Prat, Maria Vidal
Veröffentlicht in:
Frontiers Oncol., Ausgabe 12, 2022, ISSN 2234-943X
Herausgeber:
Frontiers Media S. A.
DOI:
10.3389/fonc.2022.1009352
Autoren:
Torgeir Mo; Siri Helene Bertelsen Brandal; Alvaro Köhn-Luque; Olav Engebraaten; Vessela N. Kristensen; Thomas Fleischer; Tord Hompland; Therese Seierstad
Veröffentlicht in:
Cancers; Volume 14; Ausgabe 5; Pages: 1326, Ausgabe 3, 2022, ISSN 2072-6694
Herausgeber:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/cancers14051326
Autoren:
Ben Galili, Xavier Tekpli, Vessela N. Kristensen, Zohar Yakhini
Veröffentlicht in:
PLOS ONE, Ausgabe 16/1, 2021, Seite(n) e0245215, ISSN 1932-6203
Herausgeber:
Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pone.0245215
Autoren:
Zhi Zhao, Manuela Zucknick, Tero Aittokallio
Veröffentlicht in:
Bioinformatics Advances, Ausgabe 2(1), 2022, Seite(n) vbac073, ISSN 2635-0041
Herausgeber:
Oxford Academic
DOI:
10.1093/bioadv/vbac073
Autoren:
Pauliina M, Munne; Lahja, Martikainen; Iiris, Räty; Kia, Bertula; , Nonappa; Janika, Ruuska; Hanna, Ala-Hongisto; Aino, Peura; Babette, Hollmann; Lilya, Euro; Kerim, Yavuz; Linda, Patrikainen; Maria, Salmela; Juho, Pokki; Mikko, Kivento; Juho, Väänänen; Tomi, Suomi; Liina, Nevalaita; Minna, Mutka; Panu, Kovanen; Marjut, Leidenius; Tuomo, Meretoja; Katja, Hukkinen; Outi, Monni; Jeroen, Pouwels;
Veröffentlicht in:
Nature Communications, Ausgabe 14, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-021-27220-9
Autoren:
Alessandra Cabassi, Paul D W Kirk
Veröffentlicht in:
Bioinformatics, Ausgabe 36/18, 2020, Seite(n) 4789-4796, ISSN 1367-4803
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btaa593
Autoren:
Zhi Zhao, Shixiong Wang, Manuela Zucknick, Tero Aittokallio
Veröffentlicht in:
iScience, Ausgabe 25(8), 2022, Seite(n) 104767, ISSN 2589-0042
Herausgeber:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.isci.2022.104767
Autoren:
Susanna Holmström, Sampsa Hautaniemi, Antti Häkkinen
Veröffentlicht in:
Bioinformatics, 2022, ISSN 1460-2059
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btac124
Autoren:
Robert Hanes, Pilar Ayuda-Durán, Leiv Rønneberg, Sigve Nakken, Eivind Hovig, Manuela Zucknick, Jorrit M Enserink
Veröffentlicht in:
Bioinformatics, Ausgabe btac840, 2022, Seite(n) 1-3, ISSN 1477-4054
Herausgeber:
Oxford Academic
DOI:
10.1093/bioinformatics/btac840
Autoren:
Alona Levy-Jurgenson, Xavier Tekpli, Vessela N. Kristensen, Zohar Yakhini
Veröffentlicht in:
Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41598-020-75708-z
Autoren:
Verona Buocikova, Eleonora Marta Longhin, Eleftherios Pilalis, Chara Mastrokalou, Svetlana Miklikova, Marina Cihova, et al.
Veröffentlicht in:
Biomedicine & Pharmacotherapy, Ausgabe Volume 147, March 2022, 112662, 2022, ISSN 1950-6007
Herausgeber:
Elsevier
DOI:
10.1016/j.biopha.2022.112662
Autoren:
Begüm Utz, Rita Turpin, Johanna Lampe, Jeroen Pouwels, Juha Klefström
Veröffentlicht in:
Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41598-020-75411-z
Autoren:
Zhi Zhao; Marco Banterle; Leonardo Bottolo; Sylvia Richardson; Alex Lewin; Manuela Zucknick
Veröffentlicht in:
Journal of Statistical Software; Vol. 100 (2021); 1 - 32, Ausgabe 4, 2021, ISSN 1548-7660
Herausgeber:
University of California at Los Angeles
DOI:
10.48550/arxiv.2104.14008
Autoren:
Thomas Thorne, Paul D W Kirk, Heather A Harrington
Veröffentlicht in:
Bioinformatics, Ausgabe btac118, 2020, Seite(n) 2529–2535, ISSN 1367-4803
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btac118
Autoren:
Nuria Chic; Blanca Gonzalez-Farre; Laia Paré; T. Pascual; Cristina Saura; C. Hernando Melia; Montse Muñoz; Pascual Fernández; Dianny Martínez; Esther Sanfeliu; Fara Brasó-Maristany; X. González-Farré; Mafalda Oliveira; Miguel Gil-Gil; Pamela Céliz; E.M. Ciruelos; Patricia Villagrasa; J. Gavila Gregori; Andreu Prat
Veröffentlicht in:
Annals of Oncology, Ausgabe 13, 2020, ISSN 0923-7534
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1016/j.annonc.2020.03.148
Autoren:
Claudette Falato; Francesco Schettini; Tomás Pascual; Fara Brasó-Maristany; Aleix Prat
Veröffentlicht in:
cancer treatment reviews, Ausgabe 9, 2022, ISSN 0305-7372
Herausgeber:
W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI:
10.1016/j.ctrv.2022.102496
Autoren:
Gaia Griguolo; Fara Brasó-Maristany; Blanca Gonzalez-Farre; Tomás Pascual; Nuria Chic; Tamara Saurí; Ronald E. Kates; Oleg Gluz; D. Martinez; Laia Paré; Vassilena Tsvetkova; David Pesantez; Maria Vidal; Barbara Adamo; Montserrat Muñoz; Patricia Galván; Laura Barberá; Miriam Cuatrecasas; Mathias Christgen; Hans Kreipe; Inés Monge-Escartín; Patricia Villagrasa; Dolors Soy; Tommaso Giarratan
Veröffentlicht in:
Cancers (Basel), Ausgabe 11, 2020, ISSN 2072-6694
Herausgeber:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/cancers12071902
Autoren:
Ayse Bassez, Hanne Vos, Laurien Van Dyck, Giuseppe Floris, Ingrid Arijs, Christine Desmedt, Bram Boeckx, Marlies Vanden Bempt, Ines Nevelsteen, Kathleen Lambein, Kevin Punie, Patrick Neven, Abhishek D. Garg, Hans Wildiers, Junbin Qian, Ann Smeets, Diether Lambrechts
Veröffentlicht in:
Nature Medicine, Ausgabe 27/5, 2021, Seite(n) 820-832, ISSN 1078-8956
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41591-021-01323-8
Autoren:
Francesco Schettini, Fara Brasó-Maristany, Nicole M. Kuderer & Aleix Prat
Veröffentlicht in:
npj breast cancer, Ausgabe 8:85, 2022, ISSN 2374-4677
Herausgeber:
Springer Nature
DOI:
10.1038/s41523-022-00451-9
Autoren:
Solon Karapanagiotis, Umberto Benedetto, Sach Mukherjee, Paul D W Kirk, Paul J Newcombe
Veröffentlicht in:
Biostatistics, 2021, ISSN 1465-4644
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/biostatistics/kxab023
Autoren:
Henri Pesonen, Umberto Simola, Alvaro Köhn-Luque, Henri Vuollekoski, Xiaoran Lai, Arnoldo Frigessi, Samuel Kaski, David T. Frazier, Worapree Maneesoonthorn, Gael M. Martin, Jukka Corander
Veröffentlicht in:
International Statistical Review, Ausgabe n/a, 2022, Seite(n) n/a, ISSN 1751-5823
Herausgeber:
Wiley
DOI:
10.1111/insr.12522
Autoren:
Fara Brasó-Maristany; Laia Paré; Nuria Chic; Olga Martínez-Sáez; Tomás Pascual; Meritxell Mallafre-Larrosa; Francesco Schettini; Blanca Gonzalez-Farre; Esther Sanfeliu; D. Martinez; Patricia Galván; Esther Barnadas; Belinda Salinas; P. Tolosa; Eva Ciruelos; Esther Carcelero; Cecilia Guillen; Barbara Adamo; Reinaldo Moreno; Maria Vidal; Montserrat Muñoz; Aleix Prat
Veröffentlicht in:
Molecular Oncology, Ausgabe 8, 2021, ISSN 1574-7891
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1002/1878-0261.13021
Autoren:
Leiv Rønneberg, Paul D.W. Kirk, Manuela Zucknick
Veröffentlicht in:
ResearchSquare, Ausgabe rs-1465185, 2022, Seite(n) 2529–2535, ISSN 2693-5015
Herausgeber:
Research Square Platform LLC
DOI:
10.21203/rs.3.rs-1465185/v2
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