Deciphering the cellular origin and evolution of malignant rhabdoid tumors

Informazioni relative al progetto

RhabdoEvo

ID dell’accordo di sovvenzione: 850571

DOI

10.3030/850571

Progetto chiuso

Data della firma CE 26 Novembre 2019

Data di avvio 1 Dicembre 2019

Data di completamento 31 Maggio 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 500 000,00

Contributo UE

€ 1 500 000,00

Coordinato da

PRINSES MAXIMA CENTRUM VOOR KINDERONCOLOGIE BV
Netherlands

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Open Research Data Pilot

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (15)

Organoid models of childhood kidney tumours

Autori: Ariadne H. A. G. Ooms, Camilla Calandrini, Ronald R. de Krijger, Jarno Drost
Pubblicato in: Nature Reviews Urology, Numero 17, 2023, Pagina/e 311-313, ISSN 1759-4812
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41585-020-0315-y

In vitro Modeling of Embryonal Tumors

Autori: Lars Custers, Irene Paassen, Jarno Drost
Pubblicato in: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Numero February 2021 | Volume 9 | Article 640633, 2021, ISSN 2296-634X
Editore: Frontiers
DOI: 10.3389/fcell.2021.640633

Normal and tumor-derived organoids as a drug screening platform for tumor-specific drug vulnerabilities

Autori: Camilla Calandrini, Jarno Drost
Pubblicato in: STAR Protocols, Numero Volume 3, Numero 1, 18 March 2022, 2022, ISSN 2666-1667
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.xpro.2021.101079

Atypical teratoid/rhabdoid tumoroids reveal subgroup-specific drug vulnerabilities

Autori: Irene Paassen, Justin Williams, Carla Ríos Arceo, Femke Ringnalda, Kimberly Shea Mercer, Juliane L. Buhl, Natalia Moreno, Aniello Federico, Niels E. Franke, Mariette Kranendonk, Santhosh A. Upadhyaya, Kornelius Kerl, Marc van de Wetering, Hans Clevers, Marcel Kool, Eelco W. Hoving, Martine F. Roussel, Jarno Drost
Pubblicato in: Oncogene, Numero 42, 2023, Pagina/e 1661-1671, ISSN 0950-9232
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41388-023-02681-y

Generation of Human Kidney Tubuloids from Tissue and Urine

Autori: Camilla Calandrini, Jarno Drost
Pubblicato in: The Journal of Visualized Experiments, 2021, ISSN 1940-087X
Editore: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62404

Single-cell transcriptomics reveals immune suppression and cell states predictive of patient outcomes in rhabdomyosarcoma

Autori: Jeff DeMartino, Michael T. Meister, Lindy L. Visser, Mariël Brok, Marian J. A. Groot Koerkamp, Amber K. L. Wezenaar, Laura S. Hiemcke-Jiwa, Terezinha de Souza, Johannes H. M. Merks, Anne C. Rios, Frank C. P. Holstege, Thanasis Margaritis, Jarno Drost
Pubblicato in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38886-8

Single cell derived mRNA signals across human kidney tumors

Autori: Matthew D. Young, Thomas J. Mitchell, Lars Custers, Thanasis Margaritis, Francisco Morales-Rodriguez, Kwasi Kwakwa, Eleonora Khabirova, Gerda Kildisiute, Thomas R. W. Oliver, Ronald R. de Krijger, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, Federico Comitani, Alice Piapi, Eva Bugallo-Blanco, Christine Thevanesan, Christina Burke, Elena Prigmore, Kirsty Ambridge, Kenny Roberts, Felipe A. Vieira Braga, Tim H.
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23949-5

An engineered tumor organoid model reveals cellular identity and signaling trajectories underlying SFPQ-TFE3 driven translocation RCC

Autori: Maroussia M.P. Ganpat, Francisco Morales-Rodriguez, Nhung Pham, Philip Lijnzaad, Terezinha de Souza, Sepide Derakhshan, Arianna Fumagalli, Peter Zeller, Aleksandra Balwierz, Dilara Ayyildiz, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, Ronald R. de Krijger, Alexander van Oudenaarden, Thanasis Margaritis, Susana M. Chuva de Sousa Lopes, Jarno Drost
Pubblicato in: iScience, Numero 28, 2025, Pagina/e 112122, ISSN 2589-0042
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.isci.2025.112122

Somatic mutations and single-cell transcriptomes reveal the root of malignant rhabdoid tumours

Autori: Lars Custers, Eleonora Khabirova, Tim H. H. Coorens, Thomas R. W. Oliver, Camilla Calandrini, Matthew D. Young, Felipe A. Vieira Braga, Peter Ellis, Lira Mamanova, Heidi Segers, Arie Maat, Marcel Kool, Eelco W. Hoving, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, James Nicholson, Karin Straathof, Liz Hook, Ronald R. de Krijger, Claire Trayers, Kieren Allinson, Sam Behjati, Jarno Drost
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-21675-6

Organoid-based drug screening reveals neddylation as therapeutic target for malignant rhabdoid tumors

Autori: Camilla Calandrini, Sander R. van Hooff, Irene Paassen, Dilara Ayyildiz, Sepide Derakhshan, M. Emmy M. Dolman, Karin P.S. Langenberg, Marieke van de Ven, Cecilia de Heus, Nalan Liv, Marcel Kool, Ronald R. de Krijger, Godelieve A.M. Tytgat, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, Jan J. Molenaar, Jarno Drost
Pubblicato in: Cell Reports, Numero AUGUST 24, 2021, 2021, ISSN 2211-1247
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109568

Bridging the gap: advancing cancer cell culture to reveal key metabolic targets

Autori: Marjolein M. G. Kes, Celia R. Berkers, Jarno Drost
Pubblicato in: Frontiers in Oncology, Numero 14, 2024, ISSN 2234-943X
Editore: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2024.1480613

Integration of multiple lineage measurements from the same cell reconstructs parallel tumor evolution

Autori: Lennart Kester, Buys de Barbanson, Anna Lyubimova, Li-Ting Chen, Valérie van der Schrier, Anna Alemany, Dylan Mooijman, Josi Peterson-Maduro, Jarno Drost, Jeroen de Ridder, Alexander van Oudenaarden
Pubblicato in: Cell Genomics, 2022, ISSN 2666-979X
Editore: CellPress
DOI: 10.1016/j.xgen.2022.100096

Mesenchymal tumor organoid models recapitulate rhabdomyosarcoma subtypes

Autori: Meister, M.T., Groot Koerkamp, M.J.A., de Souza, T., Breunis, W.B., Frazer-Mendelewska, E., Brok, M., DeMartino, J., Manders, F., Calandrini, C., Kerstens, H.H.D., Janse, A., Dolman, M.E.M., Eising, S., Langenberg, K.P.S., van Tuil, M., Knops, R.R.G., van Scheltinga, S.T., Hiemcke-Jiwa, L.S., Flucke, U., Merks, J.H.M., van Noesel, M.M., Tops, B.B.J., Hehir-Kwa, J.Y., Kemmeren, P., Molenaar, J.J.,
Pubblicato in: EMBO Molecular Medicine, 2022, ISSN 1757-4676
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.15252/emmm.202216001

SMARCB1 loss activates patient-specific distal oncogenic enhancers in malignant rhabdoid tumors.

Autori: Ning Qing Liu, Irene Paassen, Lars Custers, Peter Zeller, Hans Teunissen, Dilara Ayyildiz, Jiayou He, Juliane Laura Buhl, Eelco Wieger Hoving, Alexander van Oudenaarden, Elzo de Wit, Jarno Drost.
Pubblicato in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43498-3

High resolution clonal architecture of hypomutated Wilms tumours

Autori: Henry Lee-Six, Taryn D. Treger, Manas Dave, Tim HH Coorens, Nathaniel D. Anderson, Yvonne Tiersma, Sepide Derakhshan, Sanne de Haan, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, Yichen Wang, Anna Wenger, Reem Al-Saadi, Alice Lawford, Aleksandra Letunovska, Jenny Wegert, Conor Parks, Guillaume Morcrette, Manfred Gessler, Gordan Vujanic, Tanzina Chowdhury, Maureen J O’Sullivan, Ronald R. de Krijger, Michael R
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 16, 2025, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-59854-4