Deciphering the cellular origin and evolution of malignant rhabdoid tumors

Informacje na temat projektu

RhabdoEvo

Identyfikator umowy o grant: 850571

DOI

10.3030/850571

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 26 Listopada 2019

Data rozpoczęcia 1 Grudnia 2019

Data zakończenia 31 Maja 2025

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 500 000,00

Wkład UE

€ 1 500 000,00

Koordynowany przez

PRINSES MAXIMA CENTRUM VOOR KINDERONCOLOGIE BV
Netherlands

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Open Research Data Pilot

Publikacje

Peer reviewed articles (15)

Organoid models of childhood kidney tumours

Autorzy: Ariadne H. A. G. Ooms, Camilla Calandrini, Ronald R. de Krijger, Jarno Drost
Opublikowane w: Nature Reviews Urology, Numer 17, 2023, Strona(/y) 311-313, ISSN 1759-4812
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41585-020-0315-y

In vitro Modeling of Embryonal Tumors

Autorzy: Lars Custers, Irene Paassen, Jarno Drost
Opublikowane w: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Numer February 2021 | Volume 9 | Article 640633, 2021, ISSN 2296-634X
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fcell.2021.640633

Normal and tumor-derived organoids as a drug screening platform for tumor-specific drug vulnerabilities

Autorzy: Camilla Calandrini, Jarno Drost
Opublikowane w: STAR Protocols, Numer Volume 3, Numer 1, 18 March 2022, 2022, ISSN 2666-1667
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.xpro.2021.101079

Atypical teratoid/rhabdoid tumoroids reveal subgroup-specific drug vulnerabilities

Autorzy: Irene Paassen, Justin Williams, Carla Ríos Arceo, Femke Ringnalda, Kimberly Shea Mercer, Juliane L. Buhl, Natalia Moreno, Aniello Federico, Niels E. Franke, Mariette Kranendonk, Santhosh A. Upadhyaya, Kornelius Kerl, Marc van de Wetering, Hans Clevers, Marcel Kool, Eelco W. Hoving, Martine F. Roussel, Jarno Drost
Opublikowane w: Oncogene, Numer 42, 2023, Strona(/y) 1661-1671, ISSN 0950-9232
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41388-023-02681-y

Generation of Human Kidney Tubuloids from Tissue and Urine

Autorzy: Camilla Calandrini, Jarno Drost
Opublikowane w: The Journal of Visualized Experiments, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62404

Single-cell transcriptomics reveals immune suppression and cell states predictive of patient outcomes in rhabdomyosarcoma

Autorzy: Jeff DeMartino, Michael T. Meister, Lindy L. Visser, Mariël Brok, Marian J. A. Groot Koerkamp, Amber K. L. Wezenaar, Laura S. Hiemcke-Jiwa, Terezinha de Souza, Johannes H. M. Merks, Anne C. Rios, Frank C. P. Holstege, Thanasis Margaritis, Jarno Drost
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38886-8

Single cell derived mRNA signals across human kidney tumors

Autorzy: Matthew D. Young, Thomas J. Mitchell, Lars Custers, Thanasis Margaritis, Francisco Morales-Rodriguez, Kwasi Kwakwa, Eleonora Khabirova, Gerda Kildisiute, Thomas R. W. Oliver, Ronald R. de Krijger, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, Federico Comitani, Alice Piapi, Eva Bugallo-Blanco, Christine Thevanesan, Christina Burke, Elena Prigmore, Kirsty Ambridge, Kenny Roberts, Felipe A. Vieira Braga, Tim H.
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23949-5

An engineered tumor organoid model reveals cellular identity and signaling trajectories underlying SFPQ-TFE3 driven translocation RCC

Autorzy: Maroussia M.P. Ganpat, Francisco Morales-Rodriguez, Nhung Pham, Philip Lijnzaad, Terezinha de Souza, Sepide Derakhshan, Arianna Fumagalli, Peter Zeller, Aleksandra Balwierz, Dilara Ayyildiz, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, Ronald R. de Krijger, Alexander van Oudenaarden, Thanasis Margaritis, Susana M. Chuva de Sousa Lopes, Jarno Drost
Opublikowane w: iScience, Numer 28, 2025, Strona(/y) 112122, ISSN 2589-0042
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.isci.2025.112122

Somatic mutations and single-cell transcriptomes reveal the root of malignant rhabdoid tumours

Autorzy: Lars Custers, Eleonora Khabirova, Tim H. H. Coorens, Thomas R. W. Oliver, Camilla Calandrini, Matthew D. Young, Felipe A. Vieira Braga, Peter Ellis, Lira Mamanova, Heidi Segers, Arie Maat, Marcel Kool, Eelco W. Hoving, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, James Nicholson, Karin Straathof, Liz Hook, Ronald R. de Krijger, Claire Trayers, Kieren Allinson, Sam Behjati, Jarno Drost
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-21675-6

Organoid-based drug screening reveals neddylation as therapeutic target for malignant rhabdoid tumors

Autorzy: Camilla Calandrini, Sander R. van Hooff, Irene Paassen, Dilara Ayyildiz, Sepide Derakhshan, M. Emmy M. Dolman, Karin P.S. Langenberg, Marieke van de Ven, Cecilia de Heus, Nalan Liv, Marcel Kool, Ronald R. de Krijger, Godelieve A.M. Tytgat, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, Jan J. Molenaar, Jarno Drost
Opublikowane w: Cell Reports, Numer AUGUST 24, 2021, 2021, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109568

Bridging the gap: advancing cancer cell culture to reveal key metabolic targets

Autorzy: Marjolein M. G. Kes, Celia R. Berkers, Jarno Drost
Opublikowane w: Frontiers in Oncology, Numer 14, 2024, ISSN 2234-943X
Wydawca: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2024.1480613

Integration of multiple lineage measurements from the same cell reconstructs parallel tumor evolution

Autorzy: Lennart Kester, Buys de Barbanson, Anna Lyubimova, Li-Ting Chen, Valérie van der Schrier, Anna Alemany, Dylan Mooijman, Josi Peterson-Maduro, Jarno Drost, Jeroen de Ridder, Alexander van Oudenaarden
Opublikowane w: Cell Genomics, 2022, ISSN 2666-979X
Wydawca: CellPress
DOI: 10.1016/j.xgen.2022.100096

Mesenchymal tumor organoid models recapitulate rhabdomyosarcoma subtypes

Autorzy: Meister, M.T., Groot Koerkamp, M.J.A., de Souza, T., Breunis, W.B., Frazer-Mendelewska, E., Brok, M., DeMartino, J., Manders, F., Calandrini, C., Kerstens, H.H.D., Janse, A., Dolman, M.E.M., Eising, S., Langenberg, K.P.S., van Tuil, M., Knops, R.R.G., van Scheltinga, S.T., Hiemcke-Jiwa, L.S., Flucke, U., Merks, J.H.M., van Noesel, M.M., Tops, B.B.J., Hehir-Kwa, J.Y., Kemmeren, P., Molenaar, J.J.,
Opublikowane w: EMBO Molecular Medicine, 2022, ISSN 1757-4676
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.15252/emmm.202216001

SMARCB1 loss activates patient-specific distal oncogenic enhancers in malignant rhabdoid tumors.

Autorzy: Ning Qing Liu, Irene Paassen, Lars Custers, Peter Zeller, Hans Teunissen, Dilara Ayyildiz, Jiayou He, Juliane Laura Buhl, Eelco Wieger Hoving, Alexander van Oudenaarden, Elzo de Wit, Jarno Drost.
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43498-3

High resolution clonal architecture of hypomutated Wilms tumours

Autorzy: Henry Lee-Six, Taryn D. Treger, Manas Dave, Tim HH Coorens, Nathaniel D. Anderson, Yvonne Tiersma, Sepide Derakhshan, Sanne de Haan, Marry M. van den Heuvel-Eibrink, Yichen Wang, Anna Wenger, Reem Al-Saadi, Alice Lawford, Aleksandra Letunovska, Jenny Wegert, Conor Parks, Guillaume Morcrette, Manfred Gessler, Gordan Vujanic, Tanzina Chowdhury, Maureen J O’Sullivan, Ronald R. de Krijger, Michael R
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 16, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-59854-4