RAtional design of canceR ImmunoTherapY: one size does not fit all

Projektinformationen

RARITY

ID Finanzhilfevereinbarung: 852832

DOI

10.3030/852832

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 27 November 2019

Startdatum 1 Dezember 2019

Enddatum 30 November 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 499 795,00

EU-Beitrag

€ 1 499 795,00

Koordiniert durch

ACADEMISCH ZIEKENHUIS LEIDEN
Netherlands

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

The participant will submit a plan describing how to deal with the research data generated in the current project

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (22)

Visual cohort comparison for spatial single-cell omics-data

Autoren: Antonios Somarakis, Marieke E. Ijsselsteijn, Sietse J. Luk, Boyd Kenkhuis, Noel F.C.C. de Miranda, Boudewijn P.F. Lelieveldt, Thomas Hollt
Veröffentlicht in: IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, Ausgabe 27/2, 2021, Seite(n) 733-743, ISSN 1077-2626
Herausgeber: Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI: 10.1109/tvcg.2020.3030336

Semi‐automated background removal limits data loss and normalizes imaging mass cytometry data

Autoren: Marieke E. Ijsselsteijn, Antonios Somarakis, Boudewijn P. F. Lelieveldt, Thomas Höllt, Noel F. C. C. Miranda
Veröffentlicht in: Cytometry Part A, 2021, ISSN 1552-4922
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cyto.a.24480

PENGUIN: A rapid and efficient image preprocessing tool for multiplexed spatial proteomics

Autoren: A.M. Sequeira, M.E. Ijsselsteijn, M. Rocha, Noel F.C.C. de Miranda
Veröffentlicht in: Computational and Structural Biotechnology Journal, Ausgabe 23, 2025, Seite(n) 3920-3928, ISSN 2001-0370
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.csbj.2024.10.048

Cancer-Associated Fibroblasts Are Key Determinants of Cancer Cell Invasion in the Earliest Stage of Colorectal Cancer

Autoren: Hao Dang, Tom J. Harryvan, Chen-Yi Liao, Erik H.J. Danen, Vienna N.L.N. Spalburg, Szymon M. Kielbasa, Hailiang Mei, Jelle J. Goeman, Eveline S. de Jonge-Muller, Stefanus G.T. Janson, Johan J. van der Reijden, Stijn Crobach, James C.H. Hardwick, Jurjen J. Boonstra, Noel F.C.C. de Miranda, Lukas J.A.C. Hawinkels
Veröffentlicht in: Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, Ausgabe 16, 2024, Seite(n) 107-131, ISSN 2352-345X
Herausgeber: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.jcmgh.2023.04.004

Integration of mass cytometry and mass spectrometry imaging for spatially resolved single-cell metabolic profiling

Autoren: Joana B. Nunes, Marieke E. Ijsselsteijn, Tamim Abdelaal, Rick Ursem, Manon van der Ploeg, Martin Giera, Bart Everts, Ahmed Mahfouz, Bram Heijs, Noel F. C. C. de Miranda
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 21, 2024, Seite(n) 1796-1800, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02392-6

CD103 and CD39 coexpression identifies neoantigen-specific cytotoxic T cells in colorectal cancers with low mutation burden

Autoren: Jitske van den Bulk, Manon van der Ploeg, Marieke E Ijsselsteijn, Dina Ruano, Ruud van der Breggen, Rebekka Duhen, Koen C M J Peeters, Arantza Fariña-Sarasqueta, Els M E Verdegaal, Sjoerd H van der Burg, Thomas Duhen, Noel F C C de Miranda
Veröffentlicht in: Journal for ImmunoTherapy of Cancer, Ausgabe 11, 2024, Seite(n) e005887, ISSN 2051-1426
Herausgeber: SITC
DOI: 10.1136/jitc-2022-005887

Transcriptomic and immunophenotypic profiling reveals molecular and immunological hallmarks of colorectal cancer tumourigenesis

Autoren: Jessica Roelands; Manon van der Ploeg; Marieke E Ijsselsteijn; Hao Dang; Jurjen J Boonstra; James C H Hardwick; Lukas J A C Hawinkels; Hans Morreau; Noel F C C de Miranda
Veröffentlicht in: Gut, Ausgabe 1, 2022, ISSN 1468-3288
Herausgeber: BMJ
DOI: 10.1136/gutjnl-2022-327608

Local and systemic immune profiles of human pancreatic ductal adenocarcinoma revealed by single-cell mass cytometry

Autoren: Brouwer TP, de Vries NL, Abdelaal T, Krog RT, Li Z, Ruano D, Fariña A, Lelieveldt BPF, Morreau H, Bonsing BA, Vahrmeijer AL, Koning F, de Miranda NFCC
Veröffentlicht in: J Immunother Cancer, 2022, ISSN 2051-1426
Herausgeber: BMJ
DOI: 10.1136/jitc-2022-004638

Enabling next-generation engineered TCR-T therapies based on high-throughput TCR discovery from diagnostic tumor biopsies

Autoren: Thomas Kuilman, Deborah S. Schrikkema, Jules Gadiot, Raquel Gomez-Eerland, Laura Bies, Julia Walker, Robbert M. Spaapen, Hanna Kok, Demi Houg, Milena Viyacheva, Yvonne B. Claassen, Manuel Saornil, Oscar Krijgsman, Bas Stringer, Huiwen Ding, Anou Geleijnse, Anne C. Meinema, Bianca Weissbrich, Melissa Lancee, Carmen G. Engele, Marianna Sabatino, Pei-Ling Chen, Kenneth Y. Tsai, James J. Mulé, Vernon
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-55420-6

Neoantigen Targetability in Progressive Advanced Melanoma

Autoren: Jitske van den Bulk, Els M.E. Verdegaal, Manon van der Ploeg, Marten Visser, Joana B. Nunes, Arnoud H. de Ru, Rayman T.N. Tjokrodirijo, Marieke E. Ijsselsteijn, Natasja I. Janssen, Ruud van der Breggen, Linda de Bruin, Pita de Kok, George M.C. Janssen, Dina Ruano, Ellen H.W. Kapiteijn, Peter A. van Veelen, Noel F.C.C. de Miranda, Sjoerd H. van der Burg
Veröffentlicht in: Clinical Cancer Research, Ausgabe 29, 2023, Seite(n) 4278-4288, ISSN 1078-0432
Herausgeber: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-23-1106

Tumor-specific T cells support chemokine-driven spatial organization of intratumoral immune microaggregates needed for long survival

Autoren: Ziena Abdulrahman; Saskia J Santegoets; Gregor Sturm; Pornpimol Charoentong; Marieke E Ijsselsteijn; Antonios Somarakis; Thomas Höllt; Francesca Finotello; Zlatko Trajanoski; Sylvia L van Egmond; Dana A M Mustafa; Marij J P Welters; Noel F C C de Miranda; Sjoerd H van der Burg
Veröffentlicht in: J Immunother Cancer, Ausgabe 2, 2022, ISSN 1756-1833
Herausgeber: BMJ
DOI: 10.1136/jitc-2021-004346

Enhanced immune responses are accompanied by increased MAGEA expression in osteosarcoma metastases

Autoren: Debora M Meijer, Siddh van Oost, Jessica P Roelands, Dina Ruano, I H Briaire-de Bruijn, B E van den Akker, A B Kruisselbrink, P M Wijers-Koster, Manon van der Ploeg, Marieke Ijsselsteijn, S W Lam, Arnoud H de Ru, R T N Tjokrodirijo, M A J van de Sande, Hans Gelderblom, Peter A Van Veelen, M L Kuijjer, Noel de Miranda, Judith V M G Bovee
Veröffentlicht in: BMJ Oncology, Ausgabe 3, 2024, Seite(n) e000472, ISSN 2752-7948
Herausgeber: BMJ Oncology
DOI: 10.1136/bmjonc-2024-000472

Autologous dendritic cells pulsed with allogeneic tumour cell lysate induce tumour-reactive T-cell responses in patients with pancreatic cancer: A phase I study

Autoren: S.P. Lau, L. Klaase, M. Vink, J. Dumas, K. Bezemer, A. van Krimpen, R. van der Breggen, L.V. Wismans, M. Doukas, W. de Koning, A.P. Stubbs, D.A.M. Mustafa, H. Vroman, R. Stadhouders, J.B. Nunes, C. Stingl, N.F.C.C. de Miranda, T.M. Luider, S.H. van der Burg, J.G. Aerts, C.H.J. van Eijck
Veröffentlicht in: European Journal of Cancer, Ausgabe 169, 2022, Seite(n) 20-31, ISSN 0959-8049
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.ejca.2022.03.015

Immunotherapy for pancreatic cancer: chasing the light at the end of the tunnel

Autoren: Thomas P. Brouwer, Alexander L. Vahrmeijer, Noel F. C. C. de Miranda
Veröffentlicht in: Cellular Oncology, Ausgabe 44/2, 2021, Seite(n) 261-278, ISSN 2211-3428
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s13402-021-00587-z

Fibroblasts in Orchestrating Colorectal Tumorigenesis and Progression

Autoren: Subinuer Abudukelimu, Noel F.C.C. de Miranda, Lukas J.A.C. Hawinkels
Veröffentlicht in: Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, Ausgabe 17, 2024, Seite(n) 821-826, ISSN 2352-345X
Herausgeber: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.jcmgh.2024.01.013

Discordant prognosis of mismatch repair deficiency in colorectal and endometrial cancer reflects variation in antitumour immune response and immune escape

Autoren: Mark A Glaire, Neil AJ Ryan, Marieke E Ijsselsteijn, Katarzyna Kedzierska, Sofia Obolenski, Reem Ali, Emma J Crosbie, Tjalling Bosse, Noel FCC de Miranda, David N Church
Veröffentlicht in: The Journal of Pathology, Ausgabe 257, 2023, Seite(n) 340-351, ISSN 0022-3417
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/path.5894

Linking Immunity with Genomics in Sarcomas: Is Genomic Complexity an Immunogenic Trigger?

Autoren: Siddh van Oost, Debora M. Meijer, Marieke L. Kuijjer, Judith V. M. G. Bovée, and Noel F. C. C. de Miranda
Veröffentlicht in: Biomedicines, 2021, ISSN 2078-2489
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/biomedicines9081048

A Paradoxical Role for Regulatory T Cells in the Tumor Microenvironment of Pancreatic Cancer

Autoren: Thomas Brouwer, Marieke Ijsselsteijn, Jan Oosting, Dina Ruano, Manon van der Ploeg, Frederike Dijk, Bert Bonsing, Arantza Fariña, Hans Morreau, Alexander Vahrmeijer, Noel de Miranda
Veröffentlicht in: Cancers, Ausgabe 14, 2025, Seite(n) 3862, ISSN 2072-6694
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers14163862

γδ T cells are effectors of immunotherapy in cancers with HLA class I defects

Autoren: Natasja L. de Vries, Joris van de Haar, Vivien Veninga, Myriam Chalabi, Marieke E. Ijsselsteijn, Manon van der Ploeg, Jitske van den Bulk, Dina Ruano, Jose G. van den Berg, John B. Haanen, Laurien J. Zeverijn, Birgit S. Geurts, Gijs F. de Wit, Thomas W. Battaglia, Hans Gelderblom, Henk M. W. Verheul, Ton N. Schumacher, Lodewyk F. A. Wessels, Frits Koning, Noel F. C. C. de Miranda, Emile E. Voest
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 613, 2023, Seite(n) 743-750, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05593-1

Unraveling the Complexity of the Cancer Microenvironment With Multidimensional Genomic and Cytometric Technologies

Autoren: Natasja L. de Vries, Ahmed Mahfouz, Frits Koning, Noel F. C. C. de Miranda
Veröffentlicht in: Frontiers in Oncology, Ausgabe 10, 2020, ISSN 2234-943X
Herausgeber: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2020.01254

Therapeutic targeting of TGF-β in cancer: hacking a master switch of immune suppression

Autoren: Jitske van den Bulk, Noel F.C.C. de Miranda, Peter ten Dijke
Veröffentlicht in: Clinical Science, Ausgabe 135/1, 2021, Seite(n) 35-52, ISSN 0143-5221
Herausgeber: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/cs20201236

Advancing multiplexed imaging for enhanced tissue complexity analysis

Autoren: Marieke E. Ijsselsteijn, Noel F. C. C. de Miranda
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 20, 2023, Seite(n) 1280-1281, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01935-7